l'Entier-génome ordonnançant et partageant des caractéristiques en temps réel a pu limiter l'écart des bactéries d'origine alimentaire

L'utilisation a avancé des techniques de génétique-découverte et le partage des caractéristiques a produit en temps réel pourrait limiter l'écart des bactéries -- Bacillus céreus -- ce qui entraînent la maladie d'origine alimentaire, selon les chercheurs qui ont mis en application l'ordonnancement d'entier-génome d'une enquête d'agent-manifestation.

« Ici, dans notre étude, nous employons cette approche pour la première fois sur le bacillus céreus, » a dit Jasna Kovac, professeur adjoint des sciences de l'alimentation, État de Penn. « Il est notre espoir que l'ordonnancement d'entier-génome du bacille sera fait plus souvent en raison de notre recherche, comme il nous permet de différencier entre les espèces variées de bacillus céreus groupe et de projeter le risque de sécurité alimentaire lié à elles. »

Fait en réponse à une manifestation de maladie d'origine alimentaire à New York hors de la ville en 2016, le projet marqué la première fois que les chercheurs ont conduit l'entier-génome ordonnançant pour vérifier un bacillus céreus manifestation pour lier des isolats des cas cliniques humains à la nourriture. La manifestation, qui a duré moins qu'un mois, a provenu des haricots refried contaminés servis par un petit réseau de restaurant mexicain.

Bien qu'on estime que les bactéries toxinogènes entraînent 63.400 cas de la maladie d'origine alimentaire par an aux Etats-Unis, le bacillus céreus ne suscite pas l'attention donnée à des agents pathogènes d'origine alimentaire plus mortels tels que le Listeria et la salmonelle.

Puisque la maladie provoquée par le bacillus céreus résolutions type dans des jours et les manifestations auto-limitent en nature, la maladie d'origine alimentaire provoquée par des membres de ce groupe d'agent pathogène sont sous-rapportée. Bien qu'il y ait eu des états des infections sévères ayant pour résultat la mort patiente subite, le bacillus céreus isolats de groupe liés aux cas cliniques humains de la maladie d'origine alimentaire type ne subissent pas l'entier-génome ordonnançant, de même qu'est la norme pour d'autres agents pathogènes d'origine alimentaire.

Dans ce cas, le ministère de la santé de l'état de New-York coordonné les enquêtes épidémiologiques. Les méthodes ont compris une étude de cohorte ; révision de préparation alimentaire ; un retour arrière de produit alimentaire ; contrôle d'environnement ; nourriture et eau ; et une enquête à une installation de production/de traitement en Pennsylvanie qui a produit les haricots refried contaminés. Les chercheurs ont ordonnancé la majorité du bacillus céreus isolats, de nourriture et d'êtres humains, à l'installation génomique de faisceau d'État de Penn, qui fait partie des instituts de toile à grain d'orge des sciences de la vie.

l'ordonnancement d'Entier-génome indique le renivellement complet d'ADN d'un organisme, permettant à des scientifiques de comprendre mieux des variations les deux à l'intérieur et entre des substances. Ces variations sont souvent jointes avec la capacité des organismes d'entraîner différents types de maladie d'origine alimentaire.

Le bacillus céreus toxines peut entraîner deux types de maladie. Un type est caractérisé par diarrhée, et l'autre, l'intoxication émétique appelée, par la nausée et le vomissement. Dans les découvertes des chercheurs, 12 février rapporté dans les frontières en microbiologie, ils ont constaté que l'agent causal dans la manifestation hors de la ville de New York était une tension des bactéries qui produit la toxine émétique.

l'ordonnancement d'Entier-génome est une approche assez neuve dans la sécurité alimentaire, Kovac a précisé.

« Il a été piloté pour des investigations sur des manifestations de Listeria en 2013, et nous avons appris que cela utilisant cette technique tient compte d'un dépistage plus rapide des isolats épidémiologiquement joints et les sources de contamination des aliments qui aident à arrêter des manifestations dès l'abord, » il a dit.

Au commencement, Kovac a expliqué, Listeria a été choisi pour l'entier-génome ordonnançant parce qu'il n'a pas une quantité incroyable de cas tous les ans, à la différence de la salmonelle, ainsi il était maniable pour vérifier l'approche. C'était également un agent pathogène important à étudier et vérifier parce que les infections de Listeria ont souvent comme conséquence la maladie grave, l'hospitalisation et même la mort.

L'approche était si couronnée de succès dans le dépistage précoce des manifestations, Kovac a noté, qu'en janvier de cette année tous les laboratoires de santé publique aux États-Unis ont déménagé à l'ordonnancement d'entier-génome des isolats de Listeria obtenus des spécimens humains, de l'environnement ou de la nourriture. La prochaine opération est de faire la même chose pour d'autres agents pathogènes d'origine alimentaire.

En prêtant plus d'attention au bacillus céreus groupe, les scientifiques peuvent devenir plus précis et les caractéristiques réalistes au sujet de la prévalence des agents pathogènes dans le bacillus céreus groupe, Kovac ont ajouté. Cela leur permettra d'améliorer l'estimation que le fardeau économique dû à la maladie d'origine alimentaire a associée à l'agent pathogène.

Ce qui aide réellement dans la prévention et le dépistage précoce des manifestations est le partage en temps réel du l'entier-génome ordonnançant des caractéristiques, il a expliqué. Quand un laboratoire ordonnance un isolat, les séquences sont habituellement téléchargées au centre national pour la base de données publique de l'information de biotechnologie et elles deviennent mondial procurables à n'importe quel laboratoire qui veut les atteindre.

« Ceci a aidé en résolvant des manifestations d'origine alimentaire internationales dans le passé, puisque les tensions des agents pathogènes d'origine alimentaire transportent souvent « les signatures géographiques » qui fournissent des indices précieux dans des investigations de manifestation, » Kovac a dit. Le « partage des informations permet à des laboratoires en travers des États-Unis de voir, en même temps, une manifestation qui se produit, et à mesure que le nombre de cas augmente au-dessus de la ligne zéro habituelle, les épidémiologistes peuvent réagir en vérifiant la manifestation et en recensant la source beaucoup plus rapidement, pour limiter la manifestation. »

Source : https://news.psu.edu/story/558803/2019/02/13/research/more-scrutiny-needed-less-deadly-foodborne-bacteria