o Inteiro-genoma que arranja em seqüência e que compartilha de dados do tempo real podia limitar a propagação das bactérias foodborne

Empregar avançou técnicas deseguimento e compartilhar dos dados produziu no tempo real poderia limitar a propagação das bactérias -- Bacilo círio -- quais causam a doença foodborne, de acordo com os pesquisadores que executaram arranjar em seqüência do inteiro-genoma de uma investigação da micróbio-manifestação.

“Aqui, em nosso estudo, nós usamos esta aproximação pela primeira vez no bacilo círio,” disse Jasna Kovac, professor adjunto da ciência alimentar, Penn State. “É nossa esperança que arranjar em seqüência do inteiro-genoma do bacilo estará feito mais frequentemente em conseqüência de nossa pesquisa, como permite que nós se diferenciem entre a vária espécie de bacilo grupo do círio e se projectem o risco da segurança alimentar associado com ela.”

Feito em resposta a uma manifestação de doença foodborne do norte do estado em New York em 2016, o projecto marcado a primeira vez que os pesquisadores conduziram o inteiro-genoma que arranja em seqüência para investigar um bacilo manifestação do círio para ligar isolados dos casos clínicos humanos ao alimento. A manifestação, que durou menos do que um mês, provinda dos feijões refried contaminados serviu por uma corrente de restaurante mexicana pequena.

Embora as bactérias deprodução sejam calculadas para causar 63.400 casos da doença foodborne pelo ano nos Estados Unidos, o bacilo círio não recebe a atenção dada a uns micróbios patogénicos foodborne mais mortais tais como o Listeria e as salmonelas.

Porque a doença causada pelo bacilo resoluções do círio tipicamente dentro dos dias e as manifestações auto-estão limitando na natureza, a doença foodborne causada por membros deste grupo do micróbio patogénico sob-é relatada. Embora haja uns relatórios de infecções severas tendo por resultado a morte paciente repentina, o bacilo isolados do grupo do círio ligados aos casos clínicos humanos da doença foodborne tipicamente não se submete ao inteiro-genoma que arranja em seqüência, como se está tornando a norma para outros micróbios patogénicos foodborne.

Neste caso, o departamento de Estados de Nova Iorque da saúde coordenou as investigações epidemiológicas. Os métodos incluíram um estudo de coorte; revisão da preparação dos alimentos; um traceback dos produtos alimentares; teste do ambiente; alimento e água; e uma investigação em uma produção/fábrica de tratamento em Pensilvânia que produziu os feijões refried contaminados. Os pesquisadores arranjaram em seqüência a maioria do bacilo isolados do círio, do alimento e dos seres humanos, na facilidade Genomic do núcleo de Penn State, que é parte dos institutos do Huck das ciências da vida.

arranjar em seqüência do Inteiro-genoma revela a composição completa do ADN de um organismo, permitindo cientistas de compreender melhor variações dentro e entre da espécie. Estas variações são ligadas frequentemente com a capacidade dos organismos para causar tipos diferentes de doença foodborne.

O bacilo toxinas do círio pode causar dois tipos de doença. Um tipo é caracterizado pela diarreia, e pela outro, chamadas intoxicação emético, pela náusea e pelo vômito. Nos resultados dos pesquisadores, relatados o 12 de fevereiro nas fronteiras na microbiologia, encontraram que o agente causal do norte do estado na manifestação de New York era uma tensão das bactérias que produzisse a toxina emético.

arranjar em seqüência do Inteiro-genoma é uma aproximação razoavelmente nova na segurança alimentar, Kovac indicou.

“Foi pilotado para investigações de manifestações do Listeria em 2013, e nós aprendemos que usar esta técnica permite uma detecção mais rápida de isolados epidemiològica ligados e as fontes de contaminação de alimentos que ajudam a parar cedo manifestações sobre,” disse.

Inicialmente, Kovac explicou, Listeria foi escolhido para o inteiro-genoma que arranja em seqüência porque não tem uma quantidade incrível de casos todos os anos, ao contrário das salmonelas, assim que era manejável testar a aproximação. Era igualmente um micróbio patogénico importante a estudar e testar porque as infecções do Listeria conduzem frequentemente à doença séria, à hospitalização e mesmo à morte.

A aproximação era tão bem sucedida na detecção atempada de manifestações, Kovac notou, que em janeiro deste ano todos os laboratórios da saúde pública nos E.U. moveram para arranjar em seqüência do inteiro-genoma dos isolados do Listeria obtidos dos espécimes humanos, do ambiente ou do alimento. O passo seguinte é fazer o mesmos para outros micróbios patogénicos foodborne.

Pagando mais atenção ao bacilo grupo do círio, os cientistas podem obter mais exactos e os dados realísticos sobre a predominância dos micróbios patogénicos no bacilo grupo do círio, Kovac adicionaram. Isso permiti-los-á de melhorar a avaliação que a carga econômica devido à doença foodborne associou com o micróbio patogénico.

O que ajuda realmente na prevenção e a detecção atempada de manifestações é a partilha do tempo real do inteiro-genoma que arranja em seqüência dados, explicou. Quando um laboratório arranja em seqüência um isolado, as seqüências estão transferidas ficheiros pela rede geralmente ao centro nacional para a base de dados pública da informação de biotecnologia e tornam-se global disponíveis a todo o laboratório que quiser as alcançar.

“Isto ajudou em resolver manifestações foodborne internacionais no passado, desde que as tensões dos micróbios patogénicos foodborne levam frequentemente “as assinaturas geográficas” que fornecem indícios valiosos em investigações da manifestação,” Kovac disse. De “a partilha dados permite que os laboratórios através dos E.U. considerem, ao mesmo tempo, uma manifestação que esteja acontecendo, e como o número de casos aumenta acima da linha de base usual, os epidemiologistas podem reagir investigando a manifestação e identificando a fonte muito mais rapidamente, para limitar a manifestação.”

Source: https://news.psu.edu/story/558803/2019/02/13/research/more-scrutiny-needed-less-deadly-foodborne-bacteria