Aviso: Esta página é uma tradução automática da página original em inglês. Por favor note uma vez que as traduções são geradas por máquinas, não tradução tudo será perfeita. Este site e suas páginas da Web destinam-se a ler em inglês. Qualquer tradução deste site e suas páginas da Web pode ser imprecisas e imprecisos no todo ou em parte. Esta tradução é fornecida como uma conveniência.

As ajudas genomic clínicas novas do teste identificam as mutações que conduzem a melanoma da infância

O teste genomic clínico detalhado de um paciente adolescente, incluindo o genoma inteiro que arranja em seqüência, ajudou pesquisadores a identificar as mutações em um único gene que conduzem a melanoma a mais comum da infância. O estudo do hospital da pesquisa das crianças do St. Jude aparece como uma publicação em linha avançada hoje na medicina da natureza do jornal.

Uma pesquisa mais adicional encontrou que 33 por cento de jovens com a melanoma do spitzoid selecionada neste estudo levaram as mutações novas, incluindo rearranjos, no mesmo gene, MAP3K8. As mutações análogas foram encontradas igualmente em 1,5 por cento dos quase 500 pacientes adultos da melanoma testadas. A melanoma de Spitzoid ocorre nas crianças e nos adultos, mas é a melanoma pediatra a mais comum.

Os pesquisadores igualmente relataram a evidência que os pacientes com as mutações MAP3K8 podem ser candidatos para medicinas da precisão. O paciente inicial neste estudo teve uma breve resposta a uma medicina da precisão que visasse um gene desregularizado pelo MAP3K8 transformado.

“Esta pesquisa demonstra que o inteiro-genoma e arranjar em seqüência inteiro-transcriptome podem revelar o motorista que as mutações faltadas pelos testes de selecção comerciais populares que usam os painéis do gene,” disseram Jinghui correspondente Zhang autor, Ph.D., cadeira do departamento de biologia computacional do St. Jude. “Estas alterações recentemente identificadas, incluindo fusões do gene, têm o potencial influenciar o tratamento.”

Os autores co-correspondentes são Scott Newman, Ph.D., do departamento de biologia computacional do St. Jude, e de Armita Bahrami, M.D., um membro do associado do departamento do St. Jude da patologia. Newman é igualmente o primeiro autor.

A doença

Este ano aproximadamente 96.480 casos da melanoma será diagnosticado nos E.U., incluindo 1 a 2 por cento que ocorre nas crianças e nos adolescentes. A melanoma de Spitzoid varia extensamente das toupeiras de crescimento lento aos tumores agressivos. Em aproximadamente 50 por cento dos casos, contudo, a mutação que conduz o tumor era desconhecida. Estes resultados indicam que MAP3K8 é o gene o mais geralmente transformado na melanoma pediatra do spitzoid.

A descoberta

MAP3K8 surgiu como um oncogene que iniciasse a melanoma do spitzoid através dos genomas do estudo da pesquisa do St. Jude para cabritos. O estudo incluiu arranjar em seqüência do inteiro-genoma, o inteiro-exome e o inteiro-transcriptome do tumor e do tecido normal dos pacientes.

arranjar em seqüência do Inteiro-genoma determina o pedido exacto das 3 bilhão bases químicas que compo ADN humano, a molécula que codifica instruções para a vida de montagem e de sustentação. O exome é os 1 a 2 por cento do genoma com instruções para proteínas de montagem. O transcriptome identifica os genes que estão sendo expressados.

Arranjar em seqüência e análise do material genético do paciente inicial revelaram as alterações, incluindo o supressão do gene CDKN2A/B e de mutações no gene TERT, conhecido para abastecer a melanoma do spitzoid. Mas a história estava incompleta.

Da “as fusões do gene quinase servem geralmente como o motorista de início da melanoma do spitzoid,” Bahrami disse. Newman, que analisava o caso, adicionou: “O tumor não levou nenhumas das mutações da quinase associadas previamente com a melanoma.” As quinase são as enzimas que funcionam como interruptores “de ligar/desligar” para regular a actividade de outras proteínas.

Newman girou sua atenção às dúzias de outros rearranjos e de outras mutações que arranjar em seqüência revelado, incluindo um gene de fusão novo criado quando MAP3K8, uma quinase, fundida com a parte de um outro gene.

“Ter o inteiro-genoma e dados inteiros-transcriptome era essencial,” Newman disse. “Ajudou-nos a identificar o rearranjo de gene e a determinar que o gene de fusão novo estava traduzido em uma proteína funcional.”

MAP3K8 é sabido para regular MEK, um gene que promova a divisão de pilha e desregularizado em outros cancros. Uma busca de literatura científica girada acima da pesquisa previamente publicada que sugeriu um papel possível para MAP3K8 na melanoma.

Os resultados conduziram ao tratamento do paciente com trametinib, uma medicina da precisão que inibisse a proteína do MEK. Após uma resposta positiva inicial ao inibidor do MEK, o tratamento foi interrompido quando parou de aparentemente trabalhar e o paciente desenvolveu efeitos secundários.

Quando uma outra mutação da novela MAP3K8 era num segundo paciente descoberto do St. Jude com melanoma do spitzoid, os pesquisadores expandiram sua análise para incluir tumores do spitzoid de 49 pacientes. A selecção encontrou 33 por cento das mutações MAP3K8 levadas pacientes. A equipe previu que as mutações que MAP3K8 diferentes encontraram toda a causa MAP3K8 seriam sobre-activa e iriam sobre activar o MEK.

Newman e seus colegas minaram o transcriptome que arranja em seqüência dados no atlas do genoma do cancro e a sua surpresa encontrou que 1,5 por cento dos 472 pacientes adultos da melanoma levaram as mutações MAP3K8 similares.

Passos seguintes

O relevo dos resultados a necessidade para os ensaios clínicos de trametinib e de outras medicinas da precisão que visam a alteração identificou neste estudo, pesquisadores notáveis. Havia uma evidência que o paciente desenvolveu a resistência à droga.

“Além, esta pesquisa sugere que MAP3K8 deva ser incorporado nos painéis genomic do cancro no futuro,” Bahrami disse.

Estude os dados, incluindo dados arranjando em seqüência detalhados do paciente inicial, esteja disponível na nuvem do St. Jude.