Os pesquisadores usam dados grandes para ganhar a melhor compreensão do vírus da hepatite E

Tanto quanto a pesquisa, a hepatite E (HEV) tinha conduzido por muito tempo uma existência sombrio - mesmo que é a causa principal para a inflamação viral aguda do fígado. Causa 70.000 mortes calculadas anualmente. Professor Eike Steinmann e Dr. Daniel Todt do departamento para a virologia molecular e médica em dados grandes (RUB) do uso de Ruhr-Universität Bochum a fim ganhar uma compreensão melhor do vírus. Detectaram uma variação de reprodução extremamente rápida analisando a informação genética de todas as variações nas amostras tomadas dos pacientes. Essa variação ajudou-os a criar um modelo funcional da cultura celular. Rubin, o compartimento da ciência da RUB, publicou um relatório em sua pesquisa.

Nenhuma terapia eficaz devido ao insuficiente conhecimento

Ao contrário com de outros vírus, não há nenhuma vacinação disponível para a hepatite E, nem todas as drogas eficazes específicas existem. Alguns, mas não todos, pacientes respondem às substâncias activas de uso geral contra vírus, tais como o alfa da interferona e o ribavirin.

Os pesquisadores não conhecem bastante sobre o vírus para desenvolver terapias eficazes. Como exactamente replicate? Que o faz tão mutável? Por que não responde sempre ao tratamento com drogas comuns? Esforçando-se para encontrar as respostas a estas perguntas, a Daniel Todt e a professor Eike Steinmann recolheu e analisou amostras do soro dos pacientes com infecção crônica de HEV durante um período de um ano.

Análise detalhada do código genético

O pesquisador analisou o código genético das populações virais detectadas executando arranjar em seqüência profundo assim chamado em momentos diferentes. Este método relativamente novo é distribuído para representar tão detalhada a informação genética de todos os vírus em uma amostra como possível. “Visto que no passado, cientistas analisou somente a informação genética daquelas partículas do vírus que ocorreram mais frequentemente,” explica Daniel Todt.

Uma vez que os testes tinham sido avaliados, emergiu que as populações do vírus em pacientes crônicos de HEV eram particularmente diversas. Determinadas variações genéticas acumularam nos pacientes que não responderam à terapia do ribavirin.

Coincidência feliz para o vírus

Uma variação genética travou o olho dos pesquisadores: promoveu a proliferação do vírus na maior parte das vezes - uma coincidência feliz para o vírus. Devido à réplica rápida, essa variação rapidamente tornou-se dominante dentro da população e causou-se um aumento drástico em quantidades do vírus. Estes resultados permitiram os pesquisadores de prever o resultado do tratamento do ribavirin em pacientes individuais em uma fase inicial.

Para os pesquisadores em Bochum, a descoberta da variação de reprodução extremamente rápida do vírus era um curso da sorte em contudo de outra respeito. Podiam assim estabelecer muito um sistema da cultura celular para a hepatite E pela primeira vez. “Até agora, não tinha sido possível proliferar suficientemente vírus em uma cultura; conseqüentemente, o indicador da medida para analisar a hepatite E na cultura celular era muito demasiado pequeno,” indica Eike Steinmann.

Esperança para a cura através da substância natural

Uma primeira variação do modelo da cultura celular foi utilizada para testar como o silvestrol natural da substância activa afectou a réplica de vírus da hepatite E. Depois do tratamento do silvestrol, a taxa da multiplicação e o número de pilhas contaminadas deixaram cair dràstica. “Silvestrol era muito mais eficaz do que o ribavirin,” conclui Daniel Todt.

Source: https://news.rub.de/english/press-releases/2019-03-18-medicine-big-data-combat-hepatitis