El atlas en línea creado para determinar, clasifica las firmas de la proteína presentes en la diagnosis de AML

Solamente cerca de uno en cuatro personas diagnosticadas con leucemia mielógena aguda (AML) sobrevive cinco años después de la diagnosis inicial. Para perfeccionar esa tasa de supervivencia, los investigadores en la Universidad de Texas en San Antonio (UTSA) y el Doctor en Medicina centro de la Universidad de Texas del cáncer de Anderson crearon un atlas en línea para determinar y para clasificar las firmas de la proteína presentes en la diagnosis de AML.

Las nuevas clasificaciones de la proteína ayudarán a investigadores y a clínicos a recomendar un mejor tratamiento y el remedio personalizado para los pacientes que sufren de este cáncer agresivo, que ocurre en la sangre y la médula. La investigación de la ruptura se publica en la última aplicación de abril la ingeniería biomédica de la naturaleza.

El investigador Amina Qutub, un profesor adjunto en el departamento de UTSA de la ingeniería biomédica (quién ensambló UTSA en 2018 de Rice University), y el oncólogo Steven M. Kornblau, profesor y clínico practicante en el departamento de la leucemia en el Doctor en Medicina centro de UT del cáncer de Anderson, examinaron la diversidad genética, epigenética y ambiental que ocurre en las células cacerígenas debido a AML. Analizando las pantallas proteomic de 205 biopsias pacientes obtenidas en el Doctor en Medicina centro del cáncer de Anderson, primer autor Chenyue Wendy Hu (entonces estudiante de tercer ciclo en el laboratorio de Qutub, ahora en las tecnologías de Uber), Kornblau y Qutub desarrollaron un nuevo método de cómputo llamado MetaGalaxy para categorizar las firmas de la proteína en 154 diversas configuraciones basadas en sus funciones y caminos celulares.

Enfocando este reto a través de la lente única de desarrollar un mapa cuantitativo para cada paciente de la leucemia de la expresión de la proteína en su sangre y médula, bastante que la lente estándar de la métrica cualitativa y de los riesgos genéticos solamente, Qutub, Kornblau y sus colaboradores de la investigación podrán a categorizan más exacto a pacientes en grupos de riesgo y predicen mejor sus resultados del tratamiento.

Para entender mejor los sellos de AML en (el nivel proteomic del sistema de la proteína) y compartir los resultados de su trabajo con otros investigadores, el profesor de la ingeniería biomédica de UTSA y sus personas incluyendo Hu, y los estudiantes Andrew Ligeralde (ahora en la Universidad de California, Berkeley) y Allie Raybon (del departamento de UTSA de la ingeniería biomédica) construyeron un portal web conocido como el atlas de Proteome de la leucemia. Diseñado por las personas de Qutub y de Kornblau con aportación de colaboradores clínicos por todo el mundo, el portal en línea da oncólogos y a científicos del cáncer las herramientas que necesitan investigar configuraciones de la expresión de la proteína de AML a partir de un paciente al siguiente. También provee de investigadores en todo el mundo los guías para la nueva investigación de la leucemia y las nuevas herramientas de cómputo.

Puesto que muchas mutaciones genéticas no pueden ser apuntadas, el proceso proteomic de la identificación del perfilado y del objetivo usado en este estudio de la investigación acelerará la identificación de objetivos terapéuticos. También propulsa a investigadores mucho más cercano al revelado de las terapias personalizadas de la combinación para los pacientes basados en sus firmas únicas de la proteína.

La “leucemia mielógena aguda presenta como cáncer tan heterogéneo que está descrita a menudo como no uno, pero una colección de enfermedades,” dijo a Qutub. “Para descifrar las pistas encontró en proteínas de la sangre y médula de los pacientes de la leucemia, desarrollamos un nuevo análisis computarizado - el MetaGalaxy - que determina sellos moleculares de la leucemia. Estos sellos son análogos a la navegación de la guía de las constelaciones de la manera de las estrellas: ofrecen un mapa a los cambios de la proteína para la leucemia. Nuestras predicciones del “sello” se están probando experimental a través de las pantallas de la droga y se pueden “programar” en las células con la manipulación sintetizada de proteínas. Un paso siguiente para traer este trabajo a la atención a los pacientes de la clínica y del impacto está probando si estas firmas llevan al incremento o a la resistencia agresivo a la quimioterapia observada en pacientes de la leucemia. Al mismo tiempo, acelerar rápidamente la investigación en leucemia y avance la caza para los tratamientos, ofrecemos los sellos en un compendio en línea donde los investigadores y los oncólogos compañeros por todo el mundo pueden construir del recurso, de las herramientas y de las conclusión, LeukemiaAtlas.org.”