Le cadre de calcul neuf indique le choc des médicaments d'arthrite sur l'expression du gène

Un cadre de calcul neuf a indiqué les différences principales entre quatre médicaments d'arthrite rhumatoïde et leur choc sur des voies biologiques chez les souris. Niki Karagianni d'Hellade de Biomedcode SA, Grèce, et collègues présentent leur approche et découvertes neuves en bio-informatique de PLOS.

L'approche analytique neuve a pu servir de puissant outil pour évaluer et comparer des demandes de règlement. Crédit : Pixabay, CC0

Les gens avec l'arthrite rhumatoïde reçoivent souvent les médicaments qui visent et empêchent le facteur de nécrose tumorale (TNF), une protéine impliquée dans la caractéristique douloureuse et dommageable d'inflammation de la maladie. Tandis que plusieurs médicaments anti-TNF sont appliqués largement avec la réussite clinique comparable, les détails de leurs différents effets moléculaires sur des procédés biologiques ont été peu clairs.

Pour combler cette lacune, Karagianni et collègues ont utilisé un modèle de souris des polyarthritis-souris inflammatoires continuelles qui expriment le TNF humain et développent les sympt40mes et les signatures qui reflètent attentivement la forme humaine de la maladie. Les souris malades ont reçu la demande de règlement avec une de quatre médicaments anti-TNF (Remicade, Cimzia, Humira, ou Enbrel), ou pour la comparaison, aucun des médicaments. Les chercheurs puis comparés elles aux souris saines.

Après demande de règlement, les chercheurs ont rassemblé le tissu commun de toutes les souris et ont analysé leur ensemble complet de transcriptomes-le de molécules d'ARN messager dans les tissus, qui indique quels gènes sont tournés mise en marche/arrêt. Puis, ils se sont appliqués une suite d'opérations de calcul aux caractéristiques de transcriptome afin de comparer les effets des quatre médicaments différents.

L'analyse a indiqué des différences précédemment inconnues de la manière l'expression du gène d'affect de quatre médicaments chez les souris malades. Certaines de ces différences ont été trouvées pour des gènes directement impliqués dans l'arthrite, mais on ont été trouvés en gènes liés non arthrite, tels que des gènes impliqués dans la maladie cardio-vasculaire et d'autres conditions qui peuvent se produire à côté de l'arthrite.

Peut-être le résultat le plus important pour sortir de notre étude est le grand nombre de gènes vers le bas-réglés chez les animaux malades, qui sont associés aux fonctionnements et aux voies qui jusque récemment ont été en grande partie négligés. Ceux-ci ont pu fournir l'analyse complémentaire dans des mécanismes de pathologie d'arthrite. »

Co-auteur Christoforos Nikolaou d'étude

Le cadre de calcul neuf développé pour cette étude a pu repurposed pour des comparaisons détaillées d'autres médicaments dans d'autres maladies. Pour aider à faciliter ceci, les chercheurs travaillent pour dispenser le système en envoi robotisé et autonome.

Source : https://www.plos.org