A estrutura computacional nova revela o impacto de drogas da artrite na expressão genética

Uma estrutura computacional nova revelou as diferenças chaves entre quatro medicamentações da artrite reumatóide e seu impacto em caminhos biológicos nos ratos. Niki Karagianni Hélade SA, Grécia, e colegas de Biomedcode apresenta seus aproximação e resultados novos na biologia computacional de PLOS.

A aproximação analítica nova podia servir como a ferramenta poderosa para avaliar e comparar tratamentos. Crédito: Pixabay, CC0

Os povos com artrite reumatóide recebem frequentemente as medicamentações que visam e inibem o factor da Tumor-Necrose (TNF), uma proteína envolvida na inflamação dolorosa e prejudicial característica da doença. Quando diversas anti-TNF drogas forem usadas extensamente com sucesso clínico comparável, os detalhes de seus efeitos moleculars diferentes em processos biológicos foram obscuros.

Para encher esta diferença, Karagianni e os colegas empregaram um modelo do rato dos polyarthritis-ratos inflamatórios crônicos que expressam o TNF humano e desenvolvem os sintomas e as assinaturas que espelham pròxima o formulário humano da doença. Os ratos doentes receberam o tratamento com um de quatro anti-TNF drogas (Remicade, Cimzia, Humira, ou Enbrel), ou para a comparação, nenhumas das drogas. Os pesquisadores compararam-nos então aos ratos saudáveis.

Após o tratamento, os pesquisadores recolheram o tecido comum de todos os ratos e analisaram seu grupo completo do transcriptomes-the de moléculas do RNA de mensageiro nos tecidos, que indica que genes são girados de ligar/desligar. Então, aplicaram uma série de etapas computacionais aos dados do transcriptome a fim comparar os efeitos das quatro drogas diferentes.

A análise revelou diferenças previamente desconhecidas na maneira a expressão genética da influência de quatro drogas em ratos doentes. Algumas destas diferenças foram encontradas para os genes envolvidos directamente na artrite, mas muitos foram encontrados em genes não-artrite-relacionados, tais como os genes envolvidos na doença cardiovascular e nas outras circunstâncias que podem ocorrer ao lado da artrite.

Talvez o resultado o mais importante para sair de nosso estudo foi o grande número de genes para baixo-regulados nos animais doentes, que são associados com as funções e os caminhos que estiveram até que negligenciado recentemente pela maior parte. Estes podiam fornecer a introspecção adicional em mecanismos da patologia da artrite.”

Co-autor Christoforos Nikolaou do estudo

A estrutura computacional nova desenvolvida para este estudo podia ser repurposed para comparações detalhadas de outras drogas em outras doenças. Para ajudar a facilitar isto, os pesquisadores estão trabalhando para organizar o sistema em um pacote automatizado, autônomo.

Source: https://www.plos.org