El nuevo marco de cómputo revela el impacto de las drogas de la artritis en la expresión génica

Un nuevo marco de cómputo ha revelado diferencias claves entre cuatro medicaciones de la artritis reumatoide y su impacto en caminos biológicos en ratones. Niki Karagianni Hélade SA, Grecia, y colegas de Biomedcode presenta su nuevas aproximación y conclusión en biología de cómputo de PLOS.

La nueva aproximación analítica podía servir como herramienta potente evaluar y comparar tratamientos. Haber: Pixabay, CC0

La gente con artritis reumatoide recibe a menudo las medicaciones que apuntan e inhiben el factor de la Tumor-Necrosis (TNF), una proteína implicada en la inflamación dolorosa y perjudicial característica de la enfermedad. Mientras que varias drogas antis-TNF se utilizan extensamente con éxito clínico comparable, los detalles de sus diversos efectos moleculares sobre procesos biológicos han sido no entendibles.

Para llenar este entrehierro, Karagianni y los colegas emplearon un modelo del ratón de los poliartritis-ratones inflamatorios crónicos que expresan el TNF humano y desarrollan los síntomas y las firmas que reflejan de cerca la forma humana de la enfermedad. Los ratones enfermos recibieron el tratamiento con uno de cuatro drogas antis-TNF (Remicade, Cimzia, Humira, o Enbrel), o para la comparación, ningunas de las drogas. Los investigadores entonces los compararon a los ratones sanos.

Después del tratamiento, los investigadores cerco el tejido común de todos los ratones y analizaban su equipo completo del transcriptomes-the de moléculas del ARN de mensajero en los tejidos, que indica qué genes se giran con./desc. Entonces, aplicaron una serie de pasos de cómputo a los datos del transcriptome para comparar los efectos de las cuatro diversas drogas.

El análisis reveló diferencias previamente desconocidas de la manera la expresión génica de la influencia de cuatro drogas en ratones enfermos. Algunas de estas diferencias fueron encontradas para los genes implicados directamente en artritis, pero muchos fueron encontrados en genes no-artritis-relacionados, tales como genes implicados en la enfermedad cardiovascular y otras condiciones que pueden ocurrir junto a artritis.

Quizás el resultado más importante para salir de nuestro estudio es el gran número de genes hacia abajo-regulados en los animales enfermos, que se asocian a las funciones y a los caminos que hasta hace poco tiempo fueron pasados por alto en gran parte. Éstos podían ofrecer discernimiento adicional en mecanismos de la patología de la artritis.”

Co-autor Christoforos Nikolaou del estudio

El nuevo marco de cómputo desarrollado para este estudio se podía repurposed para las comparaciones detalladas de otras drogas en otras enfermedades. Para ayudar a facilitar esto, los investigadores están trabajando para ordenar el sistema en un empaquetar automatizado, independiente.

Fuente: https://www.plos.org