Les grandes aides de caractéristiques déterminent de meilleurs modèles de recherches pour combattre l'écart du cancer du sein

Les scientifiques emploient beaucoup de caractéristiques génomiques pour recenser les éditions médicales plus tôt dans les patients, mais ils l'emploient également pour aider leurs homologues scientifiques en recherchant les maladies mieux.

Dans une étude neuve, les chercheurs d'université de l'Etat d'État du Michigan analysent le grand volume de données, souvent désigné sous le nom de grandes caractéristiques, pour déterminer de meilleurs modèles de recherches pour combattre l'écart des médicaments de potentiel de cancer du sein et de test. Les modèles actuels utilisés dans le laboratoire concernent fréquemment des cellules de cultivation sur les assiettes plates, ou des lignées cellulaires, pour modéliser la croissance tumorale dans les patients.

L'étude est publiée dans des transmissions de nature.

Cette propagation, ou métastase, est la plupart de cause classique de la mort liée au cancer, avec environ 90% de patients ne survivant pas. Jusqu'à présent, peu de médicaments peuvent traiter la métastase de cancer et savoir quelle opération pourrait aller mal dans le procédé de découverte de médicaments peut être un coup de feu dans l'obscurité.

Les différences entre les lignées cellulaires et les échantillons de tumeur ont soulevé la question critique dans quelle mesure les lignées cellulaires peuvent capter le renivellement des tumeurs »

Coffre Chen, auteur supérieur et professeur adjoint dans l'université de la médecine humaine

Pour répondre à cette question, Chen et le KE Liu, le premier auteur de l'étude et un chercheur post-doctoral, ont exécuté une analyse intégratrice des caractéristiques prises des bases de données génomiques comprenant l'atlas de génome de cancer, l'encyclopédie de lignée cellulaire de cancer, l'omnibus d'expression du gène et la base de données des génotypes et des phénotypes.

« Accroître des caractéristiques génomiques ouvertes pour découvrir des traitements du cancer neufs est notre objectif ultime, » a dit Chen, qui fait partie d'initiative globale du choc de MSU. « Mais avant que nous commencions à pleuvoir à torrents une importante quantité d'argent dans des expériences chères, nous devons évaluer les modèles tôt de recherches et choisir l'approprié pour le contrôle de médicament basé sur les caractéristiques génomiques. »

À l'aide de cette caractéristique, les chercheurs ont trouvé des différences considérables entre les lignées cellulaires laboratoire-produites de cancer du sein et avancé, ou métastatique réel, des échantillons de tumeur de cancer du sein. Étonnant, MDA-MB-231, une lignée cellulaire de cancer utilisée dans presque toute la recherche sur le cancer de cancer du sein métastatique, montrée de petites similitudes génomiques aux échantillons patients de tumeur.

« Je ne pourrais pas croire le résultat, » Chen a dit. « Tous démontrent aigu à de grandes différences entre les deux. Mais, du revers, nous pouvions recenser d'autres lignées cellulaires qui ont attentivement ressemblé aux tumeurs et pourraient être considérées, avec d'autres critères, en tant que meilleures options pour cette recherche. »

Le modèle organoid s'est avéré pour refléter très probablement les échantillons patients. Ce les cultures de tissu developpées récemment des utilisations 3D de technologie et peuvent capter plus des complexités de la façon dont les tumeurs forment et se développent.

Les « études ont montré que les organoids peuvent préserver le renivellement structurel et génétique de la tumeur originelle, » Chen ont dit. « Nous avons trouvé au niveau d'expression du gène, il pouvions faire ceci, plus ainsi que des lignées cellulaires de cancer. »

Cependant, Chen et Liu ont ajouté que les organoids et les lignées cellulaires ne pourraient pas adéquat modéliser l'horizontal moléculaire immédiat entourant une tumeur trouvée à différents sites dans le fuselage.

Ils ont dit sachant que tous ces facteurs aideront des scientifiques à interpréter des résultats, particulièrement les inattendus, et invitent la communauté scientifique à développer des modèles plus sophistiqués de recherches.

Notre étude explique le pouvoir des caractéristiques ouvertes d'admission des fonds de tiers aux analyses de gain sur le cancer. Toutes les avances que nous pouvons effectuer dans la première recherche nous aideront à faciliter la découverte de meilleurs traitements pour des gens avec le cancer du sein en bas de la route. »

Coffre Chen

Source :

Université de l'Etat d'État du Michigan

Référence de tourillon :

Chen, 2019) lignées cellulaires de évaluation de B. et autres (comme modèles pour le cancer du sein métastatique par l'analyse intégratrice des caractéristiques génomiques. Transmissions de nature.  doi.org/10.1038/s41467-019-10148-6