Las ayudas grandes de los datos determinan mejores modelos de la investigación para luchar la extensión del cáncer de pecho

Los científicos están utilizando muchos datos genomic para determinar entregas médicas más pronto en pacientes, pero también lo están utilizando para ayudar a sus contrapartes científicas en la investigación de enfermedades mejor.

En un nuevo estudio, los investigadores de la universidad de estado de Michigan están analizando los volúmenes de datos grandes, designados a menudo datos grandes, para determinar mejores modelos de la investigación para luchar la extensión de las drogas del potencial del cáncer y de la prueba de pecho. Los modelos actuales usados en el laboratorio implican con frecuencia las células que cultivan en platos planos, o las variedades de células, para modelar incremento del tumor en pacientes.

El estudio se publica en comunicaciones de la naturaleza.

El este extenderse, o la metástasis, es la causa más común de la muerte cáncer-relacionada, con el alrededor 90% de pacientes que no sobreviven. Hasta la fecha, pocas drogas pueden tratar la metástasis del cáncer y saber qué paso podría salir mal en el proceso de descubrimiento de la droga puede ser un tiro en la oscuridad.

Las diferencias entre las variedades de células y las muestras del tumor han planteado la pregunta crítica en qué medida las variedades de células pueden capturar el maquillaje de tumores”

Casilla Chen, autor mayor y profesor adjunto en la universidad del remedio humano

Para contestar a esta pregunta, Chen y KE Liu, primer autor del estudio y escolar postdoctoral, realizaron un análisis integrante de los datos tomados de bases de datos genomic incluyendo el atlas del genoma del cáncer, la enciclopedia de la variedad de células del cáncer, ómnibus de la expresión génica y la base de datos de genotipos y de fenotipos.

Los “datos genomic abiertos Leveraging para descubrir nuevas terapias del cáncer son nuestro objetivo último,” dijo a Chen, que es parte de la iniciativa global del impacto de MSU. “Pero antes de que comencemos a verter una cantidad de dinero importante en experimentos costosos, necesitamos evaluar modelos tempranos de la investigación y elegir el apropiado para la prueba de la droga basada en características genomic.”

Usando estos datos, los investigadores encontraron diferencias sustanciales entre las variedades de células laboratorio-creadas del cáncer de pecho y avanzado, o metastático real, las muestras del tumor del cáncer de pecho. Asombrosamente, MDA-MB-231, una variedad de células del cáncer usada en casi toda la investigación metastática del cáncer de pecho, mostrada pequeñas semejanzas genomic a las muestras pacientes del tumor.

“No podría creer el resultado,” Chen dijo. “Todos evidencian acentuado a las diferencias grandes entre los dos. Pero, en la parte negativa, podíamos determinar otras variedades de células que se asemejaron de cerca a los tumores y se podrían considerar, junto con otras consideraciones, como mejores opciones para esta investigación.”

El modelo organoide fue encontrado para reflejar muy probablemente muestras pacientes. Las culturas desarrolladas recientemente de este de la tecnología tejido de las aplicaciones 3D y pueden capturar más de las complejidades de cómo los tumores forman y crecen.

Los “estudios han mostrado que los organoids pueden preservar el maquillaje estructural y genético del tumor original,” a Chen dijeron. “Encontramos en el nivel de la expresión génica, él podíamos hacer esto, más tan que variedades de células del cáncer.”

Sin embargo, Chen y Liu agregaron que los organoids y las variedades de células no podrían modelar adecuadamente el paisaje molecular inmediato que rodeaba un tumor encontrado en diversos sitios en la carrocería.

Dijeron sabiendo que todos estos factores ayudarán a científicos a interpretar los resultados, especialmente los inesperados, e impulsan a la comunidad científica desarrollar modelos más sofisticados de la investigación.

Nuestro estudio demuestra la potencia de los datos abiertos del leveraging a los discernimientos del avance en cáncer. Cualquier avance que poder hacer en la investigación temprana nos ayudará a facilitar el descubrimiento de mejores terapias para la gente con el cáncer de pecho abajo del camino.”

Casilla Chen

Fuente:

Universidad de estado de Michigan

Referencia del gorrón:

Chen, 2019) variedades de células de evaluación del B. y otros (como modelos para el cáncer de pecho metastático con el análisis integrante de datos genomic. Comunicaciones de la naturaleza.  doi.org/10.1038/s41467-019-10148-6