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Technologie tranchante d'utilisation de chercheurs pour afficher le coeur foncé des chromosomes

Bien que les génomes des milliers de substances de végétal et animal aient été ordonnancés, parce que la plupart de ces génomes par part importante sont manquantes - l'ADN hautement répétitif. Au beau milieu ce de génome mystérieux les compartiments sont les régions chromosomiques de centromère-essentiel qui permettent à des cellules de réussir exactement en circuit des chromosomes quand les cellules se divisent.

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Chromosomes de melanogaster de drosophile. L'ADN est montré dans le gris et les centromères en vert. Crédit : Ankita Chavan (laboratoire de Mellone)

Étude neuve le 14 mai publiant dans la biologie du tourillon PLOS d'ouvert-accès par le laboratoire de Mellone à l'université du Connecticut et le laboratoire de Larracuente à l'université du tranchant de cartel de Rochester ordonnançant la technologie avec des méthodes moléculaires et à haute résolution de microscopie pour découvrir les séquences de tous les centromères dans le melanogaster de drosophile de mouche à fruit, un organisme modèle puissant très utilisé dans la recherche biomédicale.

Les centromères ont été visibles sous le microscope pendant plus d'un siècle, mais peu est connu au sujet de leur organisme au niveau d'ADN à cause de la difficulté d'atteindre l'ADN hautement répétitif avec des technologies de ordonnancement traditionnelles. Pour ordonnancer un génome, les chercheurs réduisent l'ADN dans éléments accessibles en lecture de ` les' et puis assemblent en fragments ces éléments de nouveau dans les séquences contiguës qui représentent le génome, dans un apparenté de processus de calcul à assembler un puzzle denteux. Tandis que ce travaux par processus bien pour de seules séquences d'ADN aux environs des gènes, dans des régions répétitives du génome tout les sembler de pièces de puzzle identique, le rendant difficile de figurer à l'extérieur comment ils se sont adaptés ensemble.

Pour venir à bout ce problème, les auteurs ont combiné cette approche denteuse de ` traditionnel' avec une suite d'autres méthodes : séquençant de plus longues parties d'ADN, des segments d'épuration du centromère qui collent à une protéine d'histone de centromère-détail, et des fibres de chromatine de représentation avec la microscopie à haute résolution. Utilisant ces approches, les auteurs pouvaient produire d'un complet et l'illustration intacte des centromères de la mouche, trouvant cela enterré dans une mer des séquences hautement répétitives, là étaient des îles de `' des séquences d'ADN plus complexes qui pourraient retenir la clavette sur la façon dont les centromères fonctionnent pour isoler des chromosomes loyalement.

Les chercheurs ont constaté que les centromères contiennent un numéro étonnant élevé des élément-séquences transposables qui sautent autour et prolifèrent de manière égoïste dans tous les génomes. « Ce qui excite est que les îles de centromère sont riches en type de rétrotransposons appelés d'élément transposable, que nous considérons habituellement des parasites de génome, » dit professeur Amanda Larracuente, auteur de Co-fil sur l'étude. Un rétrotransposon particulier, G2/Jockey-3 appelé, a été trouvé en tous les centromères, non seulement dans cette substance de mouche à fruit, mais également dans étroitement liée, des simulans de drosophile.

Leurs découvertes proposent que ces éléments égoïstes d'ADN puissent avoir un rôle dans le fonctionnement de centromère en travers d'un large éventail de substance, car des rétrotransposons se sont avérés pour être associés aux centromères dans les champignons, les centrales, les mammifères… et maintenant les mouches à fruit.

Avec les séquences de centromère à disposition, nous sommes portés en équilibre pour influencer l'ensemble d'outils génétique puissant de mouche à fruit pour comprendre que le rôle que ces séquences jouent dans le fonctionnement et l'évolution de centromère. »

Professeur Barbara Mellone, auteur de Co-Fil de l'étude

Source :

PLOS

Référence de tourillon :

Mellone, 2019) îles de B. et autres (des rétrotransposons sont les composantes importantes des centromères de drosophile. Biologie de PLOS. doi.org/10.1371/journal.pbio.3000241