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Los investigadores utilizan tecnología punta para leer el corazón oscuro de cromosomas

Aunque los genomas de millares de especie vegetal y animal se hayan ordenado, porque la mayor parte de estos genomas a la parte significativa faltan - la DNA altamente repetidor. En medio este del genoma misterioso las divisiones son las regiones cromosómicas centrómero-esenciales que permiten que las células pasen exacto conectado los cromosomas cuando las células dividen.

Los investigadores utilizan tecnología punta para leer el corazón oscuro de cromosomas

Cromosomas del melanogaster de la Drosophila. La DNA se muestra en gris y los centrómeros en verde. Haber: Ankita Chavan (laboratorio de Mellone)

Nuevo estudio el 14 de mayo que publica en la biología del gorrón PLOS del abierto-acceso por el laboratorio de Mellone en la universidad de Connecticut y el laboratorio de Larracuente en la universidad de la tecnología de secuencia punta de la cosechadora de Rochester con los métodos moleculares y de alta resolución de la microscopia para descubrir las series de todos los centrómeros en el melanogaster de la Drosophila de la mosca del vinagre, un organismo modelo potente ampliamente utilizado en la investigación biomédica.

Los centrómeros han sido visibles bajo el microscopio por encima un siglo, pero poco se sabe sobre su organización en el nivel de la DNA debido a la dificultad de llegar hasta la DNA altamente repetidor con tecnologías de secuencia tradicionales. Para ordenar un genoma, los investigadores hacen fragmentos de la DNA en unidades legibles del `' y después montan estas unidades nuevamente dentro de las series contiguas que representan el genoma, en un relacionado de proceso de cómputo con el montaje de un rompecabezas. Mientras que este trabajos de proceso bien para las series únicas de la DNA en y alrededor de genes, en las regiones repetidores del genoma toda la mirada de los pedazos del rompecabezas idéntica, haciéndolo difícil imaginar cómo ajustaron junta.

Para conseguir alrededor de este problema, los autores combinaron aproximación de este rompecabezas tradicional del `' con una habitación de otros métodos: ordenando secciones más largas de la DNA, de los segmentos de la purificación del centrómero que adhieren a una proteína centrómero-específica de la histona, y de las fibras de la cromatina de la proyección de imagen con microscopia de alta resolución. Usando estas aproximaciones, los autores podían generar un completo y el retrato intacto de los centrómeros de la mosca, encontrando eso soterrada dentro de un mar de series altamente repetidores, allí era islas del `' de series más complejas de la DNA que pudieron llevar a cabo la llave a cómo los centrómeros funcionan para segregar los cromosomas fielmente.

Los investigadores encontraron que los centrómeros contienen un número asombrosamente elevado de las elemento-series transposable que saltan alrededor y egoísta proliferan en los genomas. “Cuál es emocionante es que las islas del centrómero son ricas en un tipo de elemento transposable llamado los retroelements, que consideramos generalmente ser parásitos del genoma,” dice a profesor Amanda Larracuente, autor del co-guía en el estudio. Un retroelement determinado, llamado G2/Jockey-3, fue encontrado en todos los centrómeros, no sólo en esta especie de mosca del vinagre, pero también en estrechamente vinculada, los simulans de la Drosophila.

Sus conclusión sugieren que estos elementos egoístas de la DNA puedan tener un papel en la función del centrómero a través de una amplia gama de especie, pues los retroelements se han encontrado para ser asociados a los centrómeros en hongos, instalaciones, mamíferos… y ahora moscas del vinagre.

Con las series del centrómero a disposición, nos contrapesan para leverage la caja de herramientas genética potente de la mosca del vinagre para entender que el papel que estas series desempeñan en la función y la evolución del centrómero.”

Profesor Barbara Mellone, autor del Co-Guía del estudio

Fuente:

PLOS

Referencia del gorrón:

Mellone, 2019) islas del B. y otros (de retroelements es componentes importantes de los centrómeros de la Drosophila. Biología de PLOS. doi.org/10.1371/journal.pbio.3000241