L'étude dirigée par l'université de Cornell produit le génome normal neuf pour la vis sans fin largement recherchée

Une étude dirigée par l'université neuve de Cornell constate que le génome pour une vis sans fin largement recherchée, sur laquelle des études innombrables sont basées, était défectueux. Maintenant, une séquence fraîche de génome réglera le droit record et améliorera l'exactitude de la future recherche.

Quand les scientifiques étudient la génétique d'un organisme, ils commencent par un génome normal ordonnancé à partir d'un ce à variété unique des servir de ligne zéro. Elle est comme un échiquier dans un jeu d'échecs : chaque carton est principalement identique.

Un organisme modèle que les scientifiques emploient dans la recherche est Caenorhabditis elegans appelé d'une vis sans fin. La vis sans fin - le premier eucaryote multicellulaire (animal, plante ou champignon) pour faire ordonnancer son génome - est facile à se développer et a la biologie simple sans les os, le coeur ou l'appareil circulatoire. En même temps, elle partage beaucoup de gènes et de voies moléculaires avec des êtres humains, effectuant lui a aller-au modèle pour étudier la fonction des gènes, à des traitements médicamenteux, à vieillissement et à des maladies humaines telles que le cancer et le diabète.

Des études génétiques des elegans de C. ont été basées sur N2 à variété unique et appelé, que les chercheurs commande pendant des décennies du centre courant d'elegans de C. à l'université du Minnesota. Bien que les gens aient essayé de confirmer une norme de fait, les différents laboratoires ont élevé des tensions de N2 sur leurs propres moyens, qui ont mené à morphing.

Au cours de la dernière décennie, avec des expériences génétiques plus avancées utilisant des hauts niveaux d'ADN ordonnançant, des scientifiques ont été alarmés pour découvrir qu'il n'y a plus une tension unique de laboratoire que chacun employait. Sur 40 ans là ont surgi beaucoup de différentes tensions de N2 ; nous ne pouvons pas ne compter sur des aucuns d'entre elles pour faire des expériences. »

Erich Schwarz, professeur auxiliaire de recherches dans le service de la biologie moléculaire et de la génétique

Schwarz est un auteur supérieur d'une étude neuve publiée dans la recherche de génome qui décrit une tension génétiquement propre unique, VC2010 appelé, où chacun individuel est vraiment identique. Schwarz et collègues de l'université de Tokyo, d'Université de Stanford, de l'université de la Colombie-Britannique et de l'université du Minnesota avaient l'habitude des techniques tranchantes pour ordonnancer le génome de VC2010 et pour produire une norme neuve.

En tant qu'élément de l'étude, les chercheurs VC2010 comparé au génome originel de N2. Ils se sont attendus à une correspondance presque parfaite, mais ont obtenu une surprise. « Avec 100 millions de nucléotides que nous avons compté voir, nous a découvert 2 millions de nucléotides supplémentaires, des deux pour cent supplémentaire du génome, » qui a été caché dans l'originel, vraisemblablement dû aux limitations de la vieille technologie, Schwarz a dit.

Schwarz a ajouté que les éditions assimilées sont occurrence susceptible dans les génomes normaux d'autres organismes, y compris des êtres humains. « Elle nous prouve que qu'avoir le véritable ADN complet d'un animal n'est pas aussi facile que nous l'avons pensé était, » il a dit.

D'autres laboratoires ont commencé utilisant les outils de ordonnancement modernes à réévaluer d'autres génomes, qui a des implications pour la biologie synthétique, où les scientifiques produisent la durée - telle que des bactéries - à partir de zéro. « Avoir une séquence d'ADN réellement bonne est une ligne zéro importante, » Schwarz a dit.

Source : Université de Cornell