Da studio guidato da università di Cornell crea il nuovo genoma standard per il verme ampiamente ricercato

Nuovo da uno studio guidato da università di Cornell trova che il genoma per un verme ampiamente ricercato, su cui gli studi innumerevoli sono basati, era difettoso. Ora, una sequenza fresca del genoma collocherà il diritto record e migliorerà l'accuratezza della ricerca futura.

Quando gli scienziati studiano la genetica di un organismo, cominciano con un genoma standard ordinato da un quel a varietà unica servire come riferimento. È come una scacchiera in un gioco di scacchi: ogni quadro è fondamentalmente lo stesso.

Un organismo di modello che l'uso degli scienziati nella ricerca è un verme ha chiamato i elegans di Caenorhabditis. Il verme - il primo eucariota multicellulare (animale, pianta o fungo) fare il suo ordinare genoma - è facile da svilupparsi ed ha biologia semplice senza le ossa, il cuore o l'apparato circolatorio. Allo stesso tempo, divide molti geni e le vie molecolari con gli esseri umani, rendentegi un modello di avanzamento per lo studio della funzione del gene, drogano i trattamenti, l'invecchiamento e le malattie umane quali cancro ed il diabete.

Gli studi genetici sui elegans del C. sono stati basati su un a varietà unica, chiamato N2, che i ricercatori hanno ordinato per le decadi dal centro di riserva dei elegans del C. all'università di Minnesota. Sebbene la gente provi a sostenere uno standard comune, i diversi laboratori hanno coltivato gli sforzi del N2 da sè, che piombo a morphing.

Negli ultimi dieci anni, con gli esperimenti genetici più avanzati facendo uso degli alti livelli di DNA che ordinano, gli scienziati sono stati allarmati per scoprire che non c' è più un singolo sforzo del laboratorio che ognuno stesse usando. In 40 anni è sorto molti sforzi differenti del N2; non possiamo contare su alcun di loro per fare gli esperimenti.„

Erich Schwarz, professore di aiuto di ricerca nel dipartimento di biologia molecolare e della genetica

Schwarz è un autore senior di nuovo studio pubblicato nella ricerca del genoma che descrive un singolo sforzo geneticamente pulito, chiamata VC2010, dove ciascuno determinato è vero identico. Schwarz ed i colleghi dall'università di Tokyo, di Stanford University, dell'università di British Columbia e dell'università di Minnesota hanno usato le tecniche di avanguardia per ordinare il genoma di VC2010 e per creare un nuovo standard.

Come componente dello studio, i ricercatori hanno confrontato VC2010 al genoma originale del N2. Hanno preveduto una corrispondenza quasi perfetta, ma hanno ottenuto una sorpresa. “Con i 100 milione nucleotidi che abbiamo pensato vedere, noi ha scoperto un supplemento 2 milione nucleotidi, i due per cento extra del genoma,„ che è stato nascosto nell'originale, probabilmente dovuto le limitazioni di vecchia tecnologia, Schwarz ha detto.

Schwarz ha aggiunto che le simili emissioni sono avvenimento probabile nei genoma standard di altri organismi, compreso gli esseri umani. “Ci indica che che avere il vero DNA completo di un animale non è facile come lo abbiamo pensato era,„ ha detto.

Altri laboratori hanno cominciato facendo uso degli strumenti d'ordinamento moderni a rivalutare altri genoma, che ha implicazioni per biologia sintetica, dove gli scienziati sono creare vita quali i batteri - da zero. “Avere una sequenza realmente buona del DNA è un riferimento importante,„ Schwarz ha detto.

Sorgente: Cornell University