Cornell Universidade-conduziu o estudo cria o genoma padrão novo para o sem-fim extensamente pesquisado

Um estudo Universidade-conduzido Cornell novo encontra que o genoma para um sem-fim extensamente pesquisado, em que os estudos incontáveis são baseados, era defeituoso. Agora, uma seqüência fresca do genoma ajustará gravado em linha recta e melhorará a precisão da pesquisa futura.

Quando os cientistas estudam a genética de um organismo, começam com um genoma padrão arranjado em seqüência de uma única tensão que serva como uma linha de base. É como uma placa de xadrez em um jogo de xadrez: cada placa é fundamental a mesma.

Um organismo modelo que o uso dos cientistas na pesquisa é um sem-fim chamou elegans de Caenorhabditis. O sem-fim - o primeiro eukaryote multicellular (animal, planta ou fungo) para ter seu genoma arranjado em seqüência - é fácil de crescer e tem a biologia simples sem os ossos, o coração ou o sistema circulatório. Ao mesmo tempo, compartilha de muitos genes e os caminhos moleculars com os seres humanos, fazendo lhe a ir-ao modelo para estudar a função do gene, drogam tratamentos, envelhecimento e doenças humanas tais como o cancro e o diabetes.

Os estudos genéticos de elegans do C. foram baseados em uma única tensão, chamada N2, que os pesquisadores pediram por décadas do centro conservado em estoque dos elegans do C. na universidade de Minnesota. Embora os povos tentaram confirmar um padrão comum, os laboratórios individuais cresceram tensões do N2 no seus próprios, que conduziram a morphing.

Ao longo da última década, com experiências genéticas mais avançadas usando os níveis elevados de ADN que arranjam em seqüência, os cientistas foram alarmados para descobrir que há já não uma única tensão do laboratório que todos usasse. Sobre 40 anos elevarou muitas tensões diferentes do N2; nós não podemos confiar em nenhum delas para fazer experiências.”

Erich Schwarz, professor assistente da pesquisa no departamento da biologia molecular e da genética

Schwarz é um autor superior de um estudo novo publicado na pesquisa do genoma que descreve uma única tensão genetically limpa, chamada VC2010, onde cada um individual é verdadeiramente idêntico. Schwarz e os colegas da universidade do Tóquio, da Universidade de Stanford, da universidade do Columbia Britânica e da universidade de Minnesota usaram técnicas pioneiros para arranjar em seqüência o genoma de VC2010 e para criar um padrão novo.

Como parte do estudo, os pesquisadores compararam VC2010 ao genoma original do N2. Esperaram um fósforo próximo-perfeito, mas obtiveram uma surpresa. “Junto com os 100 milhão nucleotides que nós esperamos ver, nós descobriu os 2 milhão nucleotides extra, uns dois por cento extra do genoma,” que foi escondido no original, provavelmente devido às limitações da tecnologia velha, Schwarz disse.

Schwarz adicionou que as edições similares são ocorrência provável nos genomas padrão de outros organismos, incluindo seres humanos. “Mostra-nos que que ter o ADN completo verdadeiro de um animal não é tão fácil como nós o pensamos era,” disse.

Outros laboratórios começaram a usar ferramentas arranjando em seqüência modernas para fazer nova avaliação de outros genomas, que tem implicações para a biologia sintética, onde os cientistas estão criando a vida - tal como as bactérias - a partir do zero. “Ter uma seqüência realmente boa do ADN é uma linha de base importante,” Schwarz disse.

Source: Universidade de Cornell