Cornell Universidad-llevó estudio crea el nuevo genoma estándar para el tornillo sin fin extensamente investigado

Un nuevo estudio Universidad-llevado Cornell encuentra que el genoma para un tornillo sin fin extensamente investigado, en el cual se basan los estudios incontables, era dañado. Ahora, una serie fresca del genoma fijará el derecho de registro y perfeccionará la exactitud de la investigación futura.

Cuando los científicos estudian la genética de un organismo, comienzan con un genoma estándar ordenado de una única deformación que sirva como línea de fondo. Es como una tabla de tablón de piso en un juego de tablón de piso: cada tabla es fundamental lo mismo.

Un organismo modelo que el uso de los científicos en la investigación es un tornillo sin fin llamó los elegans de Caenorhabditis. El tornillo sin fin - el primer eucariota multicelular (animal, instalación u hongo) hacer su genoma ordenar - es fácil de crecer y tiene biología simple sin los huesos, el corazón o el sistema circulatorio. Al mismo tiempo, comparte muchos genes y los caminos moleculares con los seres humanos, haciéndole a ir-al modelo para estudiar la función del gen, drogan tratamientos, el envejecimiento y enfermedades humanas tales como cáncer y diabetes.

Los estudios genéticos de los elegans de la C. fueron basados en una única deformación, llamada N2, que los investigadores han pedido por décadas del centro común de los elegans de la C. en la universidad de Minnesota. Aunque la gente intentó mantener un estándar común, los laboratorios individuales crecieron deformaciones del N2 en sus los propio, que llevaron a morphing.

Durante la última década, con experimentos genéticos más avanzados usando los niveles de la DNA que ordenaban, alarmaron a los científicos para descubrir que hay no más una única deformación del laboratorio que todo el mundo utilizaba. Durante 40 años se han presentado muchas diversas deformaciones del N2; no podemos confiar en ningún de ellas para hacer experimentos.”

Erich Schwarz, profesor auxiliar de la investigación en el departamento de la biología molecular y de la genética

Schwarz es autor mayor de un nuevo estudio publicado en la investigación del genoma que describe una única deformación genético limpia, llamada VC2010, donde está verdad idéntico cada uno individual. Schwarz y los colegas de la universidad de Tokio, de la Universidad de Stanford, de la universidad de la Columbia Británica y de la universidad de Minnesota utilizaron técnicas puntas para ordenar el genoma de VC2010 y para crear un nuevo patrón.

Como parte del estudio, los investigadores compararon VC2010 al genoma original del N2. Contaban con un fósforo casi perfecto, pero consiguieron una sorpresa. “Junto con 100 millones de nucleótidos que preveíamos ver, nosotros descubrió 2 millones de nucleótidos extras, un dos por ciento extra del genoma,” que fue ocultado en el original, probablemente debido a las limitaciones de la vieja tecnología, Schwarz dijo.

Schwarz agregó que las entregas similares son ocurrencia probable en los genomas estándar de otros organismos, incluyendo seres humanos. “Nos muestra que tener la DNA completa verdadera de un animal no es tan fácil como lo pensamos era,” él dijo.

Otros laboratorios han comenzado usando las herramientas de secuencia modernas a valorar de nuevo otros genomas, que tiene implicaciones para la biología sintetizada, donde los científicos están creando vida - tal como bacterias - a partir de cero. “Tener una serie realmente buena de la DNA es una línea de fondo importante,” Schwarz dijo.

Fuente: Universidad Cornell