Les microbiologistes de LMU caractérisent la structure de la population gastrique de bactérie dans différents patients

Les pylores de hélicobacter, une bactérie gastrique mondial distribuée, est génétiquement hautement capable de s'adapter. Les microbiologistes chez Ludwig-Maximilians-Universitaet (LMU) à Munich ont maintenant caractérisé sa structure de population dans différents patients, expliquant un rôle majeur des antibiotiques pour son évolution de dans-patient.

Les pylores cosmopolites de hélicobacter de bactérie est responsable d'une des infections chroniques les plus répandues trouvées chez l'homme. Bien que l'infection ne provoque souvent aucun sympt40me définissable, elle peut avoir comme conséquence une gamme des pathologies de tractus gastro-intestinal, s'échelonnant de l'inflammation de la garniture de l'estomac aux tumeurs gastriques et duodénales. Approximativement 1% de tout ces infecté développent éventuellement le cancer de l'estomac, et l'Organisation Mondiale de la Santé a classifié des pylores de H. comme carcinogène. Un des traits les plus saisissants des pylores de hélicobacter est sa diversité génétique et adaptabilité. Les chercheurs aboutis par le microbiologiste SebastiAn Suerbaum (présidence de la microbiologie et de l'épidémiologie médicales d'hôpital chez Max von Pettenkofer Institute de LMU) ont maintenant examiné la diversité génétique de la substance dans les estomacs de 16 patients, et ont recensé les adaptations spécifiques qui permettent à la bactérie de coloniser des régions particulières de l'estomac. Ils pouvaient également expliquer que les antibiothérapies réduisent le degré de diversité de la population de pylores de H. et le sélectent pour des variantes résistantes. - D'ailleurs, ils ont prouvé que les antibiotiques prescrits pour d'autres infections peuvent sélecter pour des souches résistantes des pylores de H. et former sa structure de population. Les découvertes neuves apparaissent dans les transmissions en ligne de nature de tourillon.

Le degré remarquable de souplesse génétique montré par des pylores de H. au cours d'une infection chronique a été vérifié dans plusieurs études précédentes. Cependant, peu a été renseigné jusque là sur la façon dont cette capacité pour la variation est exprimée en différents patients aux heures précises après infection. L'estomac est conventionnel divisé en trois régions anatomiques principales, qui sont différenciées par leur physiologie et fonctionnent, fournissant les créneaux écologiques pour différentes sous-populations des pylores de H.

Utilisant des échantillons obtenus à partir de différentes régions de l'estomac, nous avons demandé comment fortement les tensions de pylores de H. ont différé chez chaque patient. Pour faire ainsi, nous avons isolé au moins 20 souches de bactéries de chaque patient et avons analysé leurs génomes par un grand choix de méthodes de ordonnancement. »

Microbiologiste SebastiAn Suerbaum

Les résultats ont prouvé que les pylores de H. est en effet capable de l'adaptation aux conditions spécifiques qui règnent dans chacune des régions anatomiquement définies de l'estomac. Cette adaptabilité peut être trouvée, par exemple, dans des familles de gènes qu'indicatif pour les protéines extérieures de la membrane de l'organisme, qui servent à le fixer à l'épithélium gastrique dans des ses hôtes humains. « Nous avons également trouvé des signatures de choix et adaptation parmi des ensembles de gènes qui sont exigés pour la motilité bactérienne et le chimiotactisme, » dit M. Florent Ailloud, un postdoc dans le groupe de professeur Suerbaum's et le premier auteur de l'étude.

De plus, l'utilisation des antibiotiques s'est avérée pour avoir un impact important sur la diversité génétique des pylores de H. Ce phénomène frappait particulièrement dans un patient particulier qui a participé à l'étude. Au premier prélèvement de cette personne, la population de pylores de H. était hautement diverse et n'a montré aucun signe de résistance aux antibiotiques l'uns des vérifiés pendant l'accroissement du laboratoire. Cependant, dans un échantillon rassemblé 2 ans après, le niveau de la diversité dans la population était extrêmement - inférieur, et les bactéries était devenu complet résistant à un antibiotique de ligne du front. Au cours des 2 années intervenantes, la population avait apparemment subi une réduction massive dans la taille, qui a préparé le terrain pour le changement de grande puissance suivant de la structure de la population de survivance. En fait, les chercheurs ont constaté que l'exposition aux antibiotiques a eu un choc profond sur toutes les populations de hélicobacter qu'ils ont étudiées. « En règle générale, l'application des la plupart combinaison appropriée des antibiotiques est essentielle pour supprimer complet des pylores de H. de l'estomac et pour éviter l'émergence de la résistance. Cependant, il devient maintenant apparent que les antibiotiques ont eu un choc énorme sur la dynamique évolutionnaire de la substance en général au cours des dernières décennies, car les antibiotiques sont devenus facilement disponibles, et sont de plus en plus utilisés, partout dans le monde, » Suerbaum conclut.

L'étude neuve a été effectuée en coopération avec le centre de référence national pour des pylores de hélicobacter, qui est abouti par SebastiAn Suerbaum et a été basé chez Max von Pettenkofer Institute de LMU depuis janvier 2017, l'équipe clinique aboutie par Peter Malfertheiner à l'université de Magdebourg et LMU, université de Warwick à Coventry (R-U), l'Institut-DSMZ de Leibniz à Brunswick et d'autres associés de collaboration en Allemagne et à l'étranger. Le projet a été supporté par le financement alloué au centre de détection et de contrôle de collaboration 900 de centre de recherche sur « la persistance microbienne et son contrôle » et le centre allemand pour la recherche d'infection (DZIF).

Source : Ludwig-Maximilians-Universität München