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Gli scienziati descrivono la composizione nel microbiome in pazienti che soffrono da IBD e dallo PSC

Nel 2012, il professor Jeroen Raes (centro di VIB-KU Lovanio per microbiologia) ha lanciato il progetto fiammingo della flora dell'intestino. Ordinando i campioni fecali oltre di 3.000 volontari sani, prof. Raes ed il suo gruppo hanno definito i limiti di un microbiota normale e salubrità-associato dell'intestino. Dopo, il gruppo si è girato verso i gruppi pazienti per identificare le alterazioni del microbiome connesse con le malattie. Recentemente, hanno descritto il cosiddetto enterotype B2, carente in alcuni batteri antinfiammatori. Oggi, i loro risultati sull'alta prevalenza di questo enterotype particolare attraverso le diagnosi multiple sono pubblicati in microbiologia della natura.

Paragone dei microbiomes

La malattia di viscere infiammatoria (IBD) raggruppa parecchie circostanze caratterizzate da infiammazione cronica del tratto intestinale, compreso colite ulcerosa ed il morbo di Crohn. La colangite sclerotica primaria (PSC) è uno stato cronico del fegato che comprende l'infiammazione e lo sfregio del dotto biliare, spesso concomitante a IBD. Nel loro nuovo studio, gli scienziati di VIB-KU Lovanio descrivono la composizione nel microbiome in pazienti che soffrono da IBD e dallo PSC.

Prof. Jeroen Raes, VIB-KU Lovanio

Nel corso degli anni, molti gruppi di ricerca universalmente hanno tentato di descrivere le alterazioni di microbiota connesse con le malattie. Particolarmente IBD è un tema di attualità nella ricerca del microbiome. Il nostro studio differisce da questi tentativi precedenti su tre parti anteriori. In primo luogo, abbiamo paragonato il microbiota dei pazienti ai profili dai volontari sani dal nostro catalogo fiammingo del progetto della flora dell'intestino oltre di 3.000 microbiomes. In secondo luogo, nelle nostre analisi, non solo abbiamo esaminato le percentuali dei batteri differenti presenti nei campioni di feci, ma egualmente abbiamo usato una nuova tecnica per quantificare le loro abbondanze. In terzo luogo, correggevamo i nostri risultati per i fattori quali i feci sciolti, spesso sintomatici nelle malattie studiate, ma pregiudicanti il risultato delle analisi del microbiome.„

Un'impronta digitale microbica della malattia

Combinando la loro competenza unica nel microbiome quantitativo che profila con la loro conoscenza sulla variazione salubrità-associata di microbiota, gli scienziati di Lovanio hanno identificato una configurazione alterata del microbiome - anche conosciuta come un enterotype - con alta prevalenza fra i gruppi pazienti. Mentre questo enterotype è stato osservato in 13% dei volontari sani, potrebbe essere identificato in 38 - 78% dei pazienti di IBD e di PSC.

Prof. Séverine Vermeire, gastroenterologo a UZ Leuven/KU Lovanio, che ha partecipato alla ricerca, chiarisce: “Questa configurazione aberrante del microbiome, che chiamiamo il enterotype B2, è caratterizzata dalle abbondanze e dalla biodiversità batteriche basse. È considerevolmente carente in alcuni batteri antinfiammatori quale Faecalibacterium. Infatti, individuiamo i livelli elevati di infiammazione intestinale in pazienti con il enterotype B2. Anche fra le persone in buona salute, i portafili di questo enterotype hanno livelli elevati leggermente di infiammazione di qualità inferiore globale.„

Infiammazione, microbi e depressione dell'intestino

Sorprendente, soltanto alcuni mesi fa, il laboratorio di prof. Raes ha descritto una simile alterazione di microbiota da associare con di qualità inferiore di vita e perfino della depressione.

Prof. Jeroen Raes dice: “Sembra essere una grande sovrapposizione nelle alterazioni del microbiome osservate attraverso i gruppi pazienti differenti. Abbiamo individuato B2 il enterotype dentro intorno 26% delle persone depresse. Mentre il microbiota dell'intestino è stato indicato per svolgere un ruolo nello sviluppo di malattia dentro, per esempio, colite ulcerosa e morbo di Crohn, questo è molto chiaro per la depressione. Tuttavia, esploreremo più dettagliatamente l'associazione fra il enterotype B2 e la depressione negli studi futuri.„

Mentre intorno 13% delle persone in buona salute può essere classificato come portafili del enterotype B2, i ricercatori sollecitano che questa non dovrebbe essere una ragione per preoccupazione.

Prof. Jeroen Raes: “A questo punto, non possiamo fare alcuna previsione su predisposizione di malattia o il rischio basato sul enterotype di una persona. Inoltre, i enterotypes non sono fissi e possono essere alterati vicino, per esempio, cambiando la vostra dieta. Le associazioni osservate fra le malattie e le costellazioni di microbiota non implicano che i batteri dell'intestino realmente causino la malattia. Molti personali, stile di vita e fattori ambientali sono collegati ad un enterotype B2. Tuttavia, poichè egualmente l'infiammazione risulta essere un fattore associato B2- in alcune persone, il più certamente esamineremo più ulteriormente la causalità potenziale.„

Source:
Journal reference:

Vieira-Silva, S. et al. (2019) Quantitative microbiome profiling disentangles inflammation- and bile duct obstruction-associated microbiota alterations across PSC/IBD diagnoses. Nature Microbiolgy. https://www.nature.com/articles/s41564-019-0483-9.