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Os cientistas descrevem a composição do microbiome nos pacientes que sofrem do IBD e do PSC

Em 2012, o professor Jeroen Raes (centro de VIB-KU Lovaina para a microbiologia) lançou o projecto flamengo da flora do intestino. Arranjando em seqüência amostras fecais sobre de 3.000 voluntários saudáveis, o prof. Raes e sua equipe definiram os limites de um microbiota normal, saúde-associado do intestino. Em seguida, a equipe girou para grupos pacientes para identificar as alterações do microbiome associadas com as doenças. Recentemente, descreveram o enterotype B2 assim chamado, deficiente em algumas bactérias anti-inflamatórios. Hoje, seus resultados na predominância alta deste enterotype particular através dos diagnósticos múltiplos são publicados na microbiologia da natureza.

Comparando microbiomes

A doença de entranhas inflamatório (IBD) agrupa diversas circunstâncias caracterizadas pela inflamação crônica do intervalo intestinal, incluindo a colite ulcerosa e a doença de Crohn. A colangite sclerosing preliminar (PSC) é uma condição crônica do fígado que envolve a inflamação e scarring do colagogo, frequentemente para o IBD. Em seu estudo novo, os cientistas de VIB-KU Lovaina descrevem a composição do microbiome nos pacientes que sofrem do IBD e do PSC.

Prof. Jeroen Raes, VIB-KU Lovaina

Ao longo dos anos, muitos grupos de investigação mundiais tentaram descrever as alterações do microbiota associadas com as doenças. Especialmente o IBD é um assunto actual na pesquisa do microbiome. Nosso estudo difere destas tentativas precedentes em três partes dianteiras. Primeiramente, nós comparamos o microbiota dos pacientes com os perfis dos voluntários saudáveis de nosso catálogo flamengo do projecto da flora do intestino sobre de 3.000 microbiomes. Em segundo, em nossas análises, nós olhamos não somente as porcentagens das bactérias diferentes actuais nas amostras de tamborete, mas igualmente usamos uma técnica nova para determinar suas abundâncias. Em terceiro lugar, nós corrigimos nossos resultados para factores tais como tamboretes fracos, frequentemente sintomáticos nas doenças estudadas, mas afetando o resultado de análises do microbiome.”

Uma impressão digital microbiana da doença

Combinando sua experiência original no microbiome quantitativo que perfila com seu conhecimento em variação saúde-associada do microbiota, os cientistas de Lovaina identificaram uma configuração alterada do microbiome - igualmente conhecida como um enterotype - com predominância alta entre grupos pacientes. Quando este enterotype foi observado em 13% de voluntários saudáveis, poderia ser identificado em 38 a 78% de pacientes do PSC e do IBD.

O prof. Séverine Vermeire, gastroenterologista em UZ Leuven/KU Lovaina, que participou na pesquisa, esclarece: “Esta configuração aberrante do microbiome, que nós chamamos o enterotype B2, é caracterizada por baixas abundâncias e biodiversidade bacterianas. É notàvel deficiente em algumas bactérias anti-inflamatórios tais como Faecalibacterium. De facto, nós detectamos uns níveis mais altos de inflamação intestinal nos pacientes com o enterotype B2. Mesmo entre indivíduos saudáveis, os portadores deste enterotype têm uns níveis ligeira mais altos de inflamação de baixo grau total.”

Inflamação, micróbios, e depressão do intestino

Surpreendentemente, somente há alguns meses atrás, o laboratório do prof. Raes descreveu uma alteração similar do microbiota a ser associada com a mais má qualidade de vida e mesmo de depressão.

O prof. Jeroen Raes diz: “Parece estar uma grande sobreposição nas alterações do microbiome observadas através dos grupos pacientes diferentes. Nós detectamos B2 o enterotype dentro ao redor 26% de indivíduos deprimidos. Quando o microbiota do intestino for mostrado para jogar dentro um papel na revelação da doença, por exemplo, colite ulcerosa e doença de Crohn, este é distante menos claro para a depressão. Contudo, nós exploraremos a associação entre o enterotype B2 e a depressão com maiores detalhes nos estudos futuros.”

Quando ao redor 13% de indivíduos saudáveis puder ser classificado como portadores do enterotype B2, os pesquisadores forçam que esta não deve ser uma razão para o interesse.

Prof. Jeroen Raes: “Neste momento, nós não podemos fazer nenhuma previsão na susceptibilidade da doença ou risco baseado no enterotype de uma pessoa. Além disso, os enterotypes não são fixos e podem ser alterados perto, por exemplo, mudando sua dieta. As associações observadas entre doenças e constelações do microbiota não implicam que as bactérias do intestino causam realmente a doença. Muitos pessoais, estilo de vida, e factores ambientais são ligados a um enterotype B2. Contudo, como igualmente a inflamação despeja ser um factor associado B2- em alguns indivíduos, nós o mais certamente estaremos olhando mais na causalidade potencial.”

Source:
Journal reference:

Vieira-Silva, S. et al. (2019) Quantitative microbiome profiling disentangles inflammation- and bile duct obstruction-associated microbiota alterations across PSC/IBD diagnoses. Nature Microbiolgy. https://www.nature.com/articles/s41564-019-0483-9.