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Los científicos describen la composición del microbiome en los pacientes que sufren de IBD y del PSC

En 2012, profesor Jeroen Raes (centro de VIB-KU Lovaina para la microbiología) puso en marcha el proyecto flamenco de la flora de la tripa. Ordenando muestras fecales sobre de 3.000 voluntarios sanos, profesor Raes y sus personas definieron los límites de un microbiota normal, salud-asociado de la tripa. Después, las personas giraron a los grupos pacientes para determinar los cambios del microbiome asociados a enfermedades. Recientemente, describieron el supuesto enterotype B2, deficiente en algunas bacterias antiinflamatorias. Hoy, sus resultados en la alta incidencia de este enterotype determinado a través de diagnosis múltiples se publican en microbiología de la naturaleza.

Comparar microbiomes

El síndrome del intestino irritable (IBD) agrupa varias condiciones caracterizadas por la inflamación crónica del trecho intestinal, incluyendo colitis ulcerosa y la enfermedad de Crohn. La colangitis esclerótica primaria (PSC) es una condición crónica del hígado que implica la inflamación y marcar con una cicatriz del conducto biliar, a menudo concomitante a IBD. En su nuevo estudio, los científicos de VIB-KU Lovaina describen la composición del microbiome en los pacientes que sufren de IBD y del PSC.

Profesor Jeroen Raes, VIB-KU Lovaina

A lo largo de los años, muchos grupos de investigación por todo el mundo han tentativa describir los cambios del microbiota asociados a enfermedades. Especialmente IBD es un asunto actual en la investigación del microbiome. Nuestro estudio difiere de estas tentativas anteriores en tres frentes. Primero, comparamos el microbiota de pacientes con perfiles de voluntarios sanos de nuestro catálogo flamenco del proyecto de la flora de la tripa sobre de 3.000 microbiomes. En segundo lugar, en nuestros análisis, no sólo observábamos los porcentajes de diversas bacterias presentes en las muestras de taburete, pero también utilizamos una nueva técnica para cuantificar su abundancia. Tercero, corregimos nuestros resultados para los factores tales como taburetes flojos, a menudo sintomáticos en las enfermedades estudiadas, pero afectando al resultado de los análisis del microbiome.”

Una huella dactilar microbiana de la enfermedad

Combinando su experiencia única en el microbiome cuantitativo que perfilaba con su conocimiento en la variación salud-asociada del microbiota, los científicos de Lovaina determinaron una configuración alterada del microbiome - también conocida como enterotype - con alta incidencia entre grupos pacientes. Mientras que este enterotype fue observado en el 13% de voluntarios sanos, podría ser determinado en 38 al 78% de pacientes del PSC y de IBD.

Profesor Séverine Vermeire, gastroenterólogo en UZ Leuven/KU Lovaina, que participó en la investigación, clarifica: “Esta configuración aberrante del microbiome, que llamamos el enterotype B2, es caracterizada por la abundancia y la biodiversidad bacterianas inferiores. Es notablemente deficiente en algunas bacterias antiinflamatorias tales como Faecalibacterium. De hecho, descubrimos niveles más altos de inflamación intestinal en pacientes con el enterotype B2. Incluso entre individuos sanos, las ondas portadoras de este enterotype tienen niveles ligeramente más altos de inflamación de calidad inferior total.”

Inflamación, microbios, y depresión de la tripa

Asombrosamente, solamente hace unos meses, el laboratorio de profesor Raes describió un cambio similar del microbiota que se asociará a de baja calidad de la vida e incluso de la depresión.

Profesor Jeroen Raes dice: “Aparece ser un recubrimiento grande en los cambios del microbiome observados a través de diversos grupos pacientes. Descubrimos B2 el enterotype hacia adentro el alrededor 26% de individuos deprimidos. Mientras que el microbiota de la tripa se ha mostrado para desempeñar un papel en el revelado de la enfermedad hacia adentro, por ejemplo, colitis ulcerosa y la enfermedad de Crohn, esto está lejos menos sin obstrucción para la depresión. Sin embargo, exploraremos la asociación entre el enterotype B2 y la depresión más detalladamente en los estudios futuros.”

Mientras que el alrededor 13% de individuos sanos se pueden clasificar como ondas portadoras del enterotype B2, los investigadores esfuerzo que esto no debe ser una razón por preocupación.

Profesor Jeroen Raes: “A este punto, no podemos hacer ninguna predicción en susceptibilidad de la enfermedad o el riesgo basado en el enterotype de una persona. Por otra parte, los enterotypes no son fijos y se pueden alterar cerca, por ejemplo, cambiando su dieta. Las asociaciones observadas entre las enfermedades y las constelaciones del microbiota no implican que las bacterias de la tripa causan real la enfermedad. Muchos personales, forma de vida, y factores ambientales se conectan a un enterotype B2. Sin embargo, como también la inflamación resulta ser un factor asociado B2- en algunos individuos, observaremos lo más ciertamente posible más lejos en causalidad potencial.”

Source:
Journal reference:

Vieira-Silva, S. et al. (2019) Quantitative microbiome profiling disentangles inflammation- and bile duct obstruction-associated microbiota alterations across PSC/IBD diagnoses. Nature Microbiolgy. https://www.nature.com/articles/s41564-019-0483-9.