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Os cientistas tornam-se teste novo, rápido para diagnosticar mais baixas infecções bacterianas das vias respiratórias

Os cientistas no instituto de Quadram e na universidade de East Anglia (UEA) desenvolveram uma maneira nova, rápida de diagnosticar mais baixas infecções bacterianas das vias respiratórias nas horas um pouco do que os dias, que poderia melhorar o assistência ao paciente e retardar a propagação da resistência antimicrobial. O método é publicado hoje na biotecnologia da natureza do jornal.

Abaixe infecções respiratórias, tais como a pneumonia, esclareça ao redor 3 milhão mortes no mundo inteiro todos os anos. Os métodos diagnósticos actuais confiam nas bactérias crescentes das amostras pacientes, mas este toma dois a três dias e pode ainda assim não identificar a causa. Durante este tempo, os pacientes são dados os antibióticos do largo-espectro, que não podem trabalhar se a infecção é causada por um micróbio patogénico resistente e poderiam provocar efeitos secundários. Sobre a utilização do largo-espectro os antibióticos são igualmente um motorista conhecido para a revelação da resistência antimicrobial.

O Dr. Justin O'Grady e sua equipe desenvolveu com sucesso um teste clínico do metagenomics (análise genomic dos organismos múltiplos obtidos de uma única amostra) para identificar precisamente as causas bacterianas de umas mais baixas infecções respiratórias dentro de 6 horas. Pode igualmente determinar se os micróbios patogénicos são resistentes a alguns dos antibióticos usados para tratar estas infecções.

Isto permite o tratamento rápido com antibióticos visados, tendo por resultado resultados pacientes melhorados enquanto reduzindo o uso de antibióticos do largo-espectro e ajudando na luta contra a resistência antimicrobial.

O metagenomics clínico tem a promessa de revolucionar o diagnóstico de doenças infecciosas, e nosso estudo descreve o primeiro teste metagenomic clínico disponível e exacto rápido que poderia prontamente ser usado em uma base rotineira em um ajuste clínico.”

Dr. O'Grady, um líder do grupo no instituto de Quadram e professor adjunto em UEA

O estudo supera alguns dos obstáculos que, até agora, retiveram o desenvolvimento difundido do metagenomics clínico. O método novo incorpora uma etapa que remova ràpida e eficientemente o material genético humano da amostra fornecida pelo paciente, desse modo deixar principalmente o ADN do micróbio patogénico arranjando em seqüência.

“As amostras respiratórias são difíceis de trabalhar com porque são compreendidas principalmente do material genético humano. Remover isto facilita detectando os micróbios patogénicos e reduz o custo e o tempo arranjando em seqüência.” Themoula dito Charalampous, um pesquisador no estudo.

O método novo foi desenvolvido com os colegas no parque de pesquisa de Norwich, no hospital da universidade de Norfolk e de Norwich e no instituto de Earlham. O financiamento para o estudo veio da biotecnologia e do Conselho de Pesquisa de ciências biológicas, do Conselho de investigação médica e do instituto nacional para a pesquisa da saúde.

Os pesquisadores usaram o sequaz portátil de Oxford Nanopore que arranja em seqüência o dispositivo para facilitar arranjar em seqüência do tempo real, geração dos dados e análise. Isto ajudado a reduzir o tempo-à-resultado dos dias às horas. A mobilidade deste dispositivo arranjando em seqüência significa que poderia ser usada mais perto do paciente, reduzindo o tempo passado enviando amostras a um laboratório central.

O método piloto foi testado em 40 amostras dos pacientes com mais baixas infecções respiratórias suspeitadas. A equipe então refinou o teste para melhorar sua sensibilidade e para reduzir o momento da amostra de resultar a seis horas e testou-o em umas 41 amostras respiratórias mais adicionais.

“O encanamento que nós desenvolvemos neste estudo produz os dados que podem ser usados não somente para diagnósticos clínicos mas para aplicações da saúde pública tais como o controle da detecção da manifestação e da infecção do hospital” disse o Dr. Gema Kay.

O protocolo está sendo avaliado agora em um ensaio clínico maior do multi-local para avaliar seu desempenho para o diagnóstico da pneumonia hospital-adquirida.

Source:
Journal reference:

O'Grady, J. et al. (2019) Nanopore metagenomics enables rapid clinical diagnosis of bacterial lower respiratory infection. Nature Biotechnology. doi.org/10.1038/s41587-019-0156-5.