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Los científicos se convierten nueva, rápida prueba para diagnosticar infecciones más inferiores bacterianas de las vías respiratorias

Los científicos en el instituto de Quadram y la universidad de East Anglia (UEA) han desarrollado una nueva, rápida manera de diagnosticar infecciones más inferiores bacterianas de las vías respiratorias en horas bastante que los días, que podrían perfeccionar atención a los pacientes y reducir la extensión de la resistencia antimicrobiana. El método se publica hoy en la biotecnología de la naturaleza del gorrón.

Baje las infecciones respiratorias, tales como pulmonía, explique alrededor 3 millones de muertes por todo el mundo cada año. Los métodos diagnósticos actuales confían en bacterias crecientes de muestras pacientes, pero éste tarda dos a tres días y puede sin embargo no determinar la causa. Durante este tiempo, dan los pacientes los antibióticos del amplio-espectro, que pueden no trabajar si la infección es causada por un patógeno resistente y podrían accionar efectos secundarios. Sobre la utilización del amplio-espectro los antibióticos son también un impulsor sabido para el revelado de la resistencia antimicrobiana.

El Dr. Justin O'Grady y sus personas ha desarrollado con éxito una prueba clínica del metagenomics (análisis genomic de los organismos múltiples obtenidos de una única muestra) para determinar exacto las causas bacterianas de infecciones respiratorias más inferiores en el plazo de 6 horas. Puede también determinar si los patógeno son resistentes a los antibióticos uces de los usados para tratar estas infecciones.

Esto permite el tratamiento rápido con los antibióticos apuntados, dando por resultado resultados pacientes perfeccionados mientras que reduce el uso de los antibióticos del amplio-espectro y ayuda en el combate contra resistencia antimicrobiana.

El metagenomics clínico tiene la promesa de revolucionar la diagnosis de enfermedades infecciosas, y nuestro estudio describe la primera prueba metagenomic clínica asequible y exacta rápida que se podría utilizar fácilmente sobre una base rutinaria en una fijación clínica.”

El Dr. O'Grady, líder del grupo en el instituto de Quadram y profesor adjunto en UEA

El estudio vence algunos de los obstáculos que, hasta la fecha, han refrenado el despliegue disperso del metagenomics clínico. El nuevo método incorpora un paso que rápidamente y eficientemente quite el material genético humano de la muestra ofrecida por el paciente, de tal modo dejar principal la DNA el patógeno para ordenar.

Las “muestras respiratorias son difíciles de trabajar con porque se comprenden principal del material genético humano. La eliminación de esto hace descubriendo los patógeno más fácil y reduce el costo y el tiempo de secuencia.” Themoula dicho Charalampous, investigador en el estudio.

El nuevo método fue desarrollado con los colegas en el parque de investigación de Norwich, en el hospital de la universidad de Norfolk y de Norwich y el instituto de Earlham. El financiamiento para el estudio vino de la biotecnología y del Consejo de Investigación de las ciencias biológicas, del Consejo de Investigación médico y del instituto nacional para la investigación de la salud.

Los investigadores utilizaron al subordinado portátil de Oxford Nanopore que ordenaba el dispositivo para facilitar la secuencia, la generación de los datos y el análisis en tiempo real. Esto ayudada para reducir tiempo-a-resultado a partir de días a las horas. La portabilidad de este dispositivo de secuencia significa que podría ser utilizada más cercano al paciente, reduciendo el tiempo pasado enviando muestras a un laboratorio central.

El método experimental fue probado en 40 muestras de pacientes con infecciones respiratorias más inferiores sospechosas. Las personas después refinaron la prueba para perfeccionar su sensibilidad y para reducir la época de la muestra de resultar a seis horas y probaron en 41 muestras respiratorias más.

“La tubería que hemos desarrollado en este estudio presenta los datos que se pueden utilizar no sólo para los diagnósticos clínicos pero para los usos de la salud pública tales como mando de la detección del brote y de la infección del hospital” dijo al Dr. Gemma Kay.

El protocolo ahora se está fijando en una juicio clínica de un multi-sitio más grande para evaluar su funcionamiento para la diagnosis de la pulmonía hospital-detectada.

Source:
Journal reference:

O'Grady, J. et al. (2019) Nanopore metagenomics enables rapid clinical diagnosis of bacterial lower respiratory infection. Nature Biotechnology. doi.org/10.1038/s41587-019-0156-5.