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Bruker annuncia le soluzioni novelle di phenomics a Metabolomics 2019

A Metabolomics 2019, Bruker evidenzia la spettrometria di massa innovatrice (MS) e le soluzioni d'alto valore (NMR) novelle a risonanza magnetica nucleari e del sistema per il phenomics molecolare e la ricerca clinica di metabolomics.

La soluzione RMN provata di Bruker IVDr, che è basata su una piattaforma RMN completamente automatizzata e standardizzata da 600 megahertz, è unicamente adatta a metabolomics su grande scala e quantitativo ed a studi di traduzione di phenomics.

I sui metodi standardizzati e automatizzati 2,0 di Bruker IVDr (B.I.) ora sono disponibili sul AVANCE® III HD come pure sulla più nuova piattaforma RMN NEO della console di AVANCE®. I metodi di B.I. 2,0 più ulteriormente sono stati ampliati con un nuovo pacchetto B.I.Quant-PS 2,0 di quantificazione del siero e del plasma. , che individua e quantifica fino a 40 metaboliti differenti facendo uso di 1D NOESY RMN. Le offerte di B.I.Quant-PS 2,0 hanno migliorato le funzioni interattive di segnalazione con la valutazione della qualità supplementare di quantificazione.

Estragga dal rapporto di B.I.Quant-PS 2,0 che mostra le nuove funzionalitàEstragga dal rapporto di B.I.Quant-PS 2,0 che mostra le nuove funzionalità.

I nuovi errori innati di B.I. del comitato del metabolismo (IEM) è per uso della ricerca soltanto (RUO). È stato sviluppato in collaborazione con il consorzio di Metagene e genera i risultati metabolici RMN sugli errori innati di metabolismo in neonati, in bambini e negli adulti di manifestazione tardiva. Questi possono essere confrontati al database di Metagene di quasi 1.000 malattie e diagnosi di differenziale per la ricerca di traduzione nella pediatria.

Dott. med. Friedrich Trefz, co-fondatore di Metagene e professore all'ospedale pediatrico Heidelberg dell'università in Germania, ha commentato:

Per la prima volta un'interpretazione automatica dei risultati di quantificazione è possibile usando l'esteso database di Metagene per supportare la ricerca di traduzione. Ciò è vero novella e valore alto nel campo di IEM, come RMN può individuare simultaneamente e quantificare tantissimi indicatori chimicamente differenti di IEM, qualcosa che abbia richiesto altrimenti i metodi analitici convenzionali multipli.„

Bruker egualmente annuncia le nuove soluzioni del ms per il metabolomics di prossima generazione e la ricerca di traduzione di phenomics. I metodi ultraelevati di lipidomics della sensibilità 4D sul pro sistema del timsTOF tiene conto lipidome profondo che profila in appena 30 minuti facendo uso del metodo di PASEF.

Oltre a quantificare più di 500 lipidi con alta precisione e la riproducibilità appena da 1ul di plasma umano, le sezioni trasversali accurate di collisione (CCS) possono essere ottenute per creare le librerie 4D per facilitare l'identificazione.

Questo approccio può combinarsi con le distribuzioni molecolari spaziali di tessuti ottenuti dalla rappresentazione di MALDI sul nuovo sistema della flessione del timsTOF in un flusso di lavoro contrassegno contrassegno di SpatialOMx™. La nuova flessione del timsTOF getta un ponte sul disaccordo fra la rappresentazione del tessuto e le analisi molecolari dei liquidi organici combinando la rappresentazione alto-spaziale di risoluzione MALDI con le analisi multi--omics profonde di 4D LC-TIMS-MS/MS su una singola piattaforma.Le nuove soluzioni del ms per il metabolomics di prossima generazione

Un nuovo flusso di lavoro automatizzato del software combina l'annotazione dei lipidi e dei metaboliti nelle immagini molecolari del tessuto, facendo uso del software del laboratorio 2020 di SCiLS e di MetaboScape 5,0. Ciò fa la flessione robusta e ultraelevata del timsTOF della sensibilità uno strumento inestimabile della ricerca per studiare l'eterogeneità in lipidomics e in metabolomics del tessuto.

Un nuovo flusso di lavoro profondo di metabolomics di scoperta, FIA-CASI-MRMS, tiene conto la determinazione della struttura fine isotopica (IFS) su tantissimi metaboliti sconosciuti. Alimentato dallo spettrometro di massa dello scimaX MRMS di Bruker e dal software a risonanza magnetica rivoluzionari di MetaboScape 5,0, la capitalizzazione continua delle offerte selezionate degli ioni (CASI) ha migliorato la gamma dinamica che notevolmente aumenta la densità e la sensibilità di punta.

L'analisi dell'iniezione di flusso (FIA) rende uno spettro di massa combinato con le formule molecolari inequivocabili dello SFI (statistiche finanziarie internazionali) per le migliaia di metaboliti sconosciuti. Il flusso di lavoro di scoperta di FIA-CASI-MRMS dà un livello senza precedenti di fiducia quando annota i metaboliti sconosciuti, consentente l'accesso più profondo “nel metabolome scuro„.

Combinando le capacità di annotazione di MRMS con RMN è la base di una strategia di de novo per la delucidazione strutturale dei metaboliti urinarii. Il Dott. Matthew Lewis ed il gruppo al centro nazionale BRITANNICO di Phenome all'istituto universitario imperiale Londra ha dettagliato questo flusso di lavoro di delineamento molecolare novello in chimica analitica del giornale (doi.org/10.1021/acs.analchem.9b00241).

MRMS fornisce un punto di partenza di alto-fiducia per l'analisi RMN, aumenta il risparmio di temi e diminuisce il tempo richiesto per delucidazione strutturale completa. Il lavoro egualmente dettaglia ad una soluzione novella e basata a urina della conduttura che facilita l'estrazione, la concentrazione e la depurazione del metabolita. Ciò crea “un gruppo illuminazione diffusa della frazione„ riutilizzabile per deposito a lungo termine che può essere rivisitato più successivamente per ulteriore analisi.

Un simile flusso di lavoro di delineamento molecolare ora sta utilizzando al centro nazionale australiano di Phenome (ANPC), in collaborazione con Bruker e la Murdoch University a Perth, Australia occidentale.

Per i sui studi phenotyping metabolici su grande scala, il ANPC ha standardizzato RMN sulla piattaforma del IVDr di Bruker e sull'impatto II QTOF “cavallo di lavoro di phenomics„ per la caratterizzazione delle miscele complesse dei metaboliti urinarii polari e non polari all'interno della popolazione australiana.

Gli obiettivi australiani occidentali della rete di traduzione di salubrità per sviluppare il centro primo del phenomics del mondo per l'avanzamento della medicina di precisione con Bruker multiplo IVDr RMN e sistemi di impatto II per supportare l'aumento richiesto nella capacità di lavorazione.

Per imparare più, faccia parte prego giovedì 27 giugno 2019 del simposio del pranzo a Metabolomics 2019. Il Dott. Catherine Vasilopoulou (Max Planck Institute Martinsried, Germania) degli altoparlanti di ospite e prof. Gary Frost (istituto universitario imperiale Londra, Regno Unito) presenteranno la loro ricerca recente.

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