Tecnologia d'interruzione di analisi del chip con i nuovi avanzamenti

insights from industryDr. Lindsay ParkesSenior Research ScientistPorvair Sciences

Un'intervista con Dott. Lindsay Parkes, ricercatore senior, scienze di Porvair

Negli ultimi dieci anni ci sono stati molti avanzamenti nelle analisi del chip soddisfanno fanno una generalità della tecnologia® di analisi del chip di Chromatrap e che miglioramenti sono stati apportati?

La tecnologia® del chip di Chromatrap è un metodo senza perla di esecuzione del chip. Il potenziale della tecnologia è emerso dalle nostre capacità nella fabbricazione dei filtri di plastica porosi per la filtrazione e la separazione di materiali biologici. Functionalising il filtro con le proteine di bloccaggio (per esempio Pro--Un, Pro--G), abbiamo identificato un nuovo modo fresco dell'esecuzione del chip che elimina l'uso delle perle quindi che sormontano le sfide comuni connesse con queste analisi tradizionali del chip.

Chromatrap® continua a migliorare la nostri tecnologia e prodotti in risposta ai bisogni dei clienti e cambia nel servizio. Recentemente, abbiamo apportato i miglioramenti alla sensibilità dell'analisi del chip. Le nostre proteine unicamente orientate assicurano che ogni casella obbligatoria sia accessibile ai complessi della anticorpo-cromatina che massimizzano così il risparmio di temi di bloccaggio. Con i ricercatori che cercano le analisi più sensibili spingiamo lo sviluppo dei nostri kit non solo per essere il meglio per usare ma consegnare il più alta sensibilità per una vasta gamma di campioni biologici.

Come questo confronta ad altre tecnologie standard di analisi del chip?

A differenza alle delle analisi basate a perla standard del chip, Chromatrap® usa ad un sistema basato a filtro unico per il bloccaggio e l'arricchimento selettivo delle proteine obbligatorie DNA-associate.  Eliminando borda (magnetico ed agarosi) dalla nostra tecnologia del chip, potevamo sviluppare un'analisi del chip che è, più rapidamente, più robusto e per di più più sensibile ben più facili delle analisi standard del chip.

Perché è importante usare un'analisi semi conduttrice del chip piuttosto che ad un sistema basato a perla? Che cosa sono i vantaggi e le limitazioni?

Quando si tratta delle analisi del chip, la sensibilità è un tasto. Chromatrap® usa la nostra materia plastica porosa inerte brevettata, Vyon. Ciò diminuisce significativamente il rumore di fondo trovato spesso nei risultati dalle analisi del chip facendo uso delle perle dell'agarosi o magnetiche, che possono inerentemente attirare l'associazione non specifica e contribuire ad all'più alti backround e mascheramento dei risultati.

Dall'estrazione della cromatina all'eluizione di DNA ordinare-pronto, ad analisi basate a perla del chip possono prendere ai 5 giorni per completare. Ciò può essere fatta solo in 5 ore facendo uso del sistema® di Chromatrap con è proteine ottimamente orientate e mescolanza molecolare migliore.

Con Chromatrap®, tutti i punti sono effettuati dentro tramite centrifugazione. Ciò supera i problemi con il multiplo che pipetta i punti e la perdita del campione conservando i complessi rilegati sul filtro fino all'eluizione. Non solo questo accelera il vantaggio di utenti di Chromatrap® ma di flusso di lavoro dalla sua facilità d'uso.

Come con qualsiasi kit commerciale di analisi, l'ottimizzazione dell'utente può essere richiesta. Il nostro gruppo dedicato del supporto tecnico è sempre a disposizione di formulare l'orientamento ed il consiglio. Chromatrap® fornisce tutti i reagenti che avete bisogno di dall'estrazione della cromatina al IP a depurazione del DNA.

Che dimensione campiona può essere usata con le analisi® del chip di Chromatrap? Che cosa sono le applicazioni di queste dimensioni di analisi?

Chromatrap® è stato sviluppato per consegnare un kit robusto ed altamente sensibile compatibile con una vasta gamma di campioni. Il chip può essere eseguito dal poco quanto 1000 celle o 50mg del tessuto. La flessibilità del sistema significa fino a cromatina 50µg può essere usata per analisi.

Chromatrap® ha il più ampia gamma dinamica di tutta l'analisi disponibile del chip che significa che può essere usato per qualunque applicazione dai campioni clinici preziosi alle linee cellulari abbondanti. Nei casi quali i laboratori clinici, i ricercatori possono soltanto avere accesso ai campioni pazienti limitati e quindi richiedere un kit altamente sensibile.

PCR ed ordinamento a valle di Next Generation sono i punti seguenti comuni per cromatina arricchita, che vantaggi sono là per l'analisi® del chip di Chromatrap sopra altri metodi comunemente usati?

La sensibilità dell'analisi® del chip di Chromatrap permette la rilevazione degli obiettivi del gene nel qPCR dalla quantità più bassa di prodotto base. Il bloccaggio massimizzato dei complessi di anticorpo-DNA dell'obiettivo sulle colonne® di Chromatrap e su nessuna perdita del campione permette l'amplificazione anche degli obiettivi abbondanti bassi del gene che possono essere inosservabili con ai i sistemi basati a perla.

Facendo uso del sistema® di Chromatrap, i dati d'ordinamento complessi possono essere ottenuti da Chip-seguente degli importi significativamente più bassi di prodotto base. L'alto rendimento di DNA dal chip® di Chromatrap permette NGS che ordina da un singolo IP dal poco quanto 1000 celle senza alcun'esigenza della riunione del campione. Il DNA superiore dell'input migliora la complessità della libreria di NGS.

Come può l'automazione dei protocolli di analisi del chip migliorare la qualità, la complessità e l'accuratezza della ricerca?

L'automazione del chip facendo uso di una tecnologia come Chromatrap® permette che i dati complessi accurati siano ottenuti rapido e senza il rischio di prelevamento o di manipolazione degli errori. Con questo formato, i ricercatori possono studiare gli obiettivi multipli del gene e dell'anticorpo parallelamente.

La tecnologia® di Chromatrap è adatta perfettamente alle analisi di alto-capacità di lavorazione. Chromatrap® 96 lastre grosse buone contiene una Proteina-Un o un filtro functionalised Proteina-G in ciascuno dei 96 pozzi. Appena come i nostri kit standard della colonna, i 96 prodotti buoni di alto-capacità di lavorazione contengono tutti i buffer e reagenti che dovete iniziare e rifinire la vostra analisi. Renda paricolare ben--ben'a consistenza permette i risultati riproducibili e ripetibili accurati in ogni analisi.

Il sistema® del GH di Chromatrap 96 può anche essere installato per liquido automatizzato che tratta fornendo un ancora metodo più veloce e più efficiente per l'esecuzione delle analisi del chip. I grandi, insiemi di dati affidabili possono essere raccolti efficientemente, permettendo agli effetti diffusi di essere studiato attraverso i campioni multipli ed i tipi multipli delle cellule; tutti effettuati simultaneamente.  

Che impatto può la tecnologia migliore di analisi del chip avere sulle aree di ricerca importanti quali cancro e la ricerca epigenetica?

Epigenetics è un'area di ricerca vitale nello studio su salubrità. Le modifiche che non causano un cambiamento nella sequenza di fondo del DNA sono di interesse particolare in patologie quale cancro dovuto la loro natura reversibile. Il chip è lo strumento più potente nella comprensione delle interazioni degli istoni e dei fattori di trascrizione con il DNA dell'obiettivo che tasto ellicit che segnala le risposte. Le droghe epigenetiche, quali gli inibitori di HDAC, stanno sviluppando nella popolarità nel trattamento dei cancri ed i loro effetti sono provati spesso in chip.

Avendo la maggior parte della informazione sensibile circa gli effetti, entrambi l'obiettivo avanti/stop, di queste droghe può contribuire soltanto a migliorare i risultati di salubrità a lungo termine. Più velocemente, le analisi più sensibili e più riproducibili del chip permettono il più alta ricerca di capacità di lavorazione sui meccanismi che sono alla base delle malattie e delle prove dei loro trattamenti.

Che cosa è il futuro della tecnologia di analisi del chip e per Chromatrap®?

Con l'aumento del fuoco sui fattori epigenetici nella ricerca e nel trattamento di salubrità, il chip continuerà a svilupparsi nella popolarità. Le tecnologie dovranno inevitabilmente migliorare nella sensibilità, nel risparmio di temi e nella capacità di lavorazione per accelerare questa ricerca. Chromatrap® manterrà la sua posizione alla prima linea della tecnologia del chip mentre mette a punto il nostro sistema per assicurarsi che consegni sempre le analisi più efficienti, più sensibili e semplici del chip per cromatina da un'ampia varietà di sorgenti. Continueremo ad adattare la tecnologia, già compatibile con una vasta gamma di trattamenti del downsteam, alle tecniche analitiche emergenti.

Il successo di Chromatrap® in chip e nei vantaggi che unici fornisce sopra ai i presente basati a perla di analisi che eccitano le opportunità per la tecnologia in una vasta gamma di applicazioni. Il nostro gruppo sta adattando la piattaforma semi conduttrice novella per stabilito e sta emergendo tecniche epigenetiche e biologiche di arricchimento in moda da potere trarre giovamento più ricercatori dai suoi numerosi vantaggi e fuoco sulle più grandi domande nella loro ricerca.  

Dove possono i lettori trovare più informazioni?

Visualizzi www.chromatrap.com per scoprire più circa Chromatrap®, le pubblicazioni recenti, le note di applicazione e le informazioni di prodotto.

Circa Dott. Lindsay Parkes

Il Dott. Lindsay Parkes è lo scienziato del cavo nella R & S delle tecnologie novelle ed attuali alle scienze di Porvair. Il suo fuoco primario è di sviluppare i materiali unici fabbricati alle scienze di Porvair nei prodotti innovatori ed alle domande di scienze biologiche e ricerca medica.

Dopo avere iniziato la sua carriera come genetista batterico all'università di Swansea, Lindsay ha ricevuto un PhD nella biologia molecolare e nella genetica. Per seguire il suo interesse nella biologia molecolare nella ricerca accademica, Lindsay ha continuato con un ruolo postdottorale nel verificare l'efficacia delle droghe antimicrobiche chiave. Durante la sua ricerca, il Dott. Parkes è stato implicato in un progetto accademico dell'industria di collaborazione con Porvair su ricerca e sviluppo dei prodotti® di Chromatrap.

Lavorando con le scienze di Porvair ha fornito al Dott. Lindsay Parkes l'opportunità perfetta di stabilire una carriera provocatoria ed emozionante che combina la sua passione per la ricerca e l'interesse in via di sviluppo lo sviluppo di prodotto.

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    Chromatrap® - Porvair Sciences Ltd. (2019, July 02). Tecnologia d'interruzione di analisi del chip con i nuovi avanzamenti. News-Medical. Retrieved on January 19, 2020 from https://www.news-medical.net/news/20190627/Disrupting-ChIP-Assay-Technology-with-New-Advancements.aspx.

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