Tecnología del análisis de la viruta que rompe con los nuevos adelantos

insights from industryDr. Lindsay ParkesSenior Research ScientistPorvair Sciences

Una entrevista con el Dr. Lindsay Parkes, científico mayor de la investigación, ciencias de Porvair

®¿En la última década ha habido muchos adelantos en análisis de la viruta satisface da una reseña de la tecnología del análisis de la viruta de Chromatrap y se han llevado a cabo qué mejoras?

La tecnología® de la viruta de Chromatrap es un método moldura-libre de realizar la viruta. El potencial de la tecnología emergió de nuestras capacidades en la fabricación de los filtros plásticos porosos para la filtración y la separación de materiales biológicos. Functionalising el filtro con las proteínas de la captura (eg. Favorables-UNo, Pro-G), determinamos una nueva manera fresca de realizar la viruta que elimina el uso de las molduras por lo tanto que vencen los retos comunes asociados a estos análisis tradicionales de la viruta.

Chromatrap® continúa perfeccionar nuestra tecnología y productos en respuesta a necesidades de los clientes y cambia en el mercado. Recientemente, hemos llevado a cabo mejoras a la sensibilidad del análisis de la viruta. Nuestras proteínas únicamente orientadas se aseguran de que cada cavidad obligatoria es accesible a los complejos de la anticuerpo-cromatina que maximizan así eficiencia de la captura. Con los investigadores buscando análisis más sensibles activamos el revelado de nuestros estuches no sólo para ser el mejor para utilizar sino para entregar la sensibilidad más alta para una amplia gama de muestras biológicas.

¿Cómo esto compara a otras tecnologías estándar del análisis de la viruta?

A diferencia de análisis moldura-basados estándar de la viruta, Chromatrap® utiliza un sistema filtro-basado único para la captura y el enriquecimiento selectivo de proteínas obligatorias DNA-asociadas.  Eliminando rebordea (magnético y agarosa) de nuestra tecnología de la viruta, podíamos desarrollar un análisis de la viruta que está, más aprisa, un más robusto y más importante más sensible lejos más fáciles que análisis estándar de la viruta.

¿Por qué es importante utilizar un análisis de estado sólido de la viruta bastante que un sistema moldura-basado? ¿Cuáles son las ventajas y las limitaciones?

Cuando se trata de análisis de la viruta, la sensibilidad es una llave. Chromatrap® utiliza nuestro material plástico poroso inerte patentado, Vyon. Esto reduce importante el ruido de fondo encontrado a menudo en resultados de análisis de la viruta usando las molduras magnéticas o de la agarosa, que pueden intrínsecamente atraer el atascamiento no específico y contribuir a un backround y a un encubrimiento más altos de resultados.

De la extracción de la cromatina a la elución de la DNA ordenar-lista, los análisis moldura-basados de la viruta pueden tomar hasta 5 días para terminar. Esto se puede hacer en tan poco tiempo como 5 horas usando el sistema® de Chromatrap con él es proteínas óptimo orientadas y mezcla molecular perfeccionada.

Con Chromatrap®, todos los pasos son realizados hacia adentro por la centrifugación. Esto supera los problemas con el múltiplo que mide con una pipeta pasos y baja de la muestra conservando complejos encuadernados en el filtro hasta la elución. No sólo esto acelera la ventaja del flujo de trabajo pero® de utilizadores de Chromatrap de su facilidad de empleo.

Como con cualquier estuche comercial del análisis, la optimización del utilizador puede ser requerida. Nuestras personas de soporte técnico dedicadas son siempre a mano asesorar la dirección y. Chromatrap® ofrece todos los reactivos que usted necesita de la extracción de la cromatina al IP a la purificación de la DNA.

® ¿Qué talla muestrea se puede utilizar con análisis de la viruta de Chromatrap? ¿Cuáles son los usos de estas tallas del análisis?

Chromatrap® fue desarrollado para entregar un estuche robusto y altamente sensible compatible con una amplia gama de muestras. La viruta se puede realizar de tan poco como 1000 células o 50mg del tejido. La adaptabilidad del sistema significa hasta la cromatina 50µg se puede utilizar por análisis.

Chromatrap® tiene el rango dinámico más ancho de cualquier análisis disponible de la viruta que significa que puede ser utilizado para cualquier uso de muestras clínicas preciosas a las variedades de células abundantes. En casos tales como laboratorios clínicos, los investigadores pueden solamente hacer que el acceso a las muestras pacientes limitadas y por lo tanto requiera un estuche altamente sensible.

®¿Secuencia de la polimerización en cadena rio abajo y de la generación siguiente están los pasos siguientes comunes para la cromatina enriquecida, qué ventajas son allí para el análisis de la viruta de Chromatrap sobre otros métodos de uso general?

La sensibilidad del análisis® de la viruta de Chromatrap permite la detección de los objetivos del gen en qPCR de la cantidad más inferior de materia prima. La captura maximizada de los complejos de anticuerpo-DNA del objetivo en las olumnas® de Chromatrap y ninguna baja de la muestra permite la amplificación incluso de los objetivos abundantes inferiores del gen que pueden ser imperceptibles con los sistemas moldura-basados.

Usando el sistema® de Chromatrap, los datos de secuencia complejos se pueden obtener de Viruta-seq de cantidades importante más inferiores de materia prima. El alto rendimiento de DNA de la viruta® de Chromatrap permite NGS que ordena de un único IP de tan poco como 1000 células sin ninguna necesidad de la reunión de la muestra. Una DNA más alta de la entrada perfecciona complejidad de la biblioteca de NGS.

¿Cómo puede la automatización de los protocolos del análisis de la viruta perfeccionar la calidad, la complejidad y la exactitud de la investigación?

La automatización de la viruta usando una tecnología como Chromatrap® permite que los datos complejos exactos sean obtenidos rápidamente y sin el riesgo de medir con una pipeta o de manejar desvíos. Con este formato, los investigadores pueden investigar objetivos múltiples del anticuerpo y del gen paralelamente.

La tecnología® de Chromatrap se adapta perfectamente a los análisis de la alto-producción. Chromatrap® 96 placas bien contiene una Proteína-UNo o un filtro functionalised Proteína-G en cada uno de los 96 pozos. Apenas como nuestros estuches estándar de la olumna, los 96 productos bien de la alto-producción contienen todos los almacenadores intermedios y reactivos que usted necesita comenzar y acabar su análisis. Precise bien--bien a estado coherente permite resultados reproductivos y repetibles exactos en cada análisis.

El sistema® del HT de Chromatrap 96 se puede también fijar para el líquido automatizado que maneja ofreciendo un incluso método más rápido y más eficiente para realizar análisis de la viruta. Los conjuntos de datos grandes, seguros se pueden cerco eficientemente, permitiendo a efectos dispersos ser estudiado a través de muestras múltiples y de tipos múltiples de la célula; todos realizados simultáneamente.  

¿Qué impacto puede la tecnología perfeccionada del análisis de la viruta tener en áreas de investigación importantes tales como cáncer e investigación epigenética?

Epigenetics es un área de investigación vital en el estudio de la salud. Las modificaciones que no causan un cambio en la serie subyacente de la DNA están de interés determinado en patologías tales como cáncer debido a su naturaleza reversible. La viruta es la herramienta más potente de entender las acciones recíprocas de histonas y de factores de la transcripción con la DNA del objetivo que llave ellicit que hace señales reacciones. Las drogas epigenéticas, tales como inhibidores de HDAC, han estado creciendo en renombre en el tratamiento de cánceres y sus efectos se prueban a menudo en viruta.

Teniendo la mayoría de la información delicada sobre los efectos, ambos el objetivo por intervalos, de estas drogas puede ayudar solamente a perfeccionar resultados de la salud a largo plazo. Más rápidamente, análisis más sensibles y más reproductivos de la viruta permiten una investigación más alta de la producción en los mecanismos que son la base de enfermedades y de la prueba de sus tratamientos.

®¿Cuál es el futuro de la tecnología del análisis de la viruta, y para Chromatrap?

Con el aumento de foco en factores epigenéticos en la investigación y el tratamiento de la salud, la viruta continuará crecer en renombre. Las tecnologías necesitarán inevitable perfeccionar en la sensibilidad, la eficiencia y la producción para acelerar esta investigación. Chromatrap® mantendrá su posición en la vanguardia de la tecnología de la viruta mientras que desarrolla nuestro sistema para asegurarse que entrega siempre análisis más eficientes, más sensibles y simples de la viruta para la cromatina de una amplia variedad de fuentes. Continuaremos adaptar el tecnología, ya compatible con una amplia gama de procesos del downsteam, a las técnicas analíticas emergentes.

El éxito de Chromatrap® en viruta y las ventajas únicas que ofrece sobre los presentes moldura-basados de los análisis que excitan las oportunidades para la tecnología en una amplia gama de usos. Nuestras personas están adaptando la plataforma de estado sólido nueva para establecido y están emergiendo las técnicas epigenéticas y biológicas del enriquecimiento de modo que más investigadores puedan beneficiarse de sus numerosas ventajas y foco en las preguntas más grandes en su investigación.  

¿Dónde pueden los programas de lectura encontrar más información?

Visite www.chromatrap.com para descubrir más sobre Chromatrap®, publicaciones recientes, notas de uso y la información de producto.

Sobre el Dr. Lindsay Parkes

El Dr. Lindsay Parkes es el científico del guía en el R&D de tecnologías nuevas y existentes en las ciencias de Porvair. Su foco primario es desarrollar los materiales únicos manufacturados en las ciencias de Porvair en productos innovadores y los usos para las ciencias de la vida y la investigación médica.

Después de comenzar su carrera como genetista bacteriano en la universidad de Swansea, concedieron Lindsay un doctorado en biología molecular y genética. Para seguir su interés en biología molecular en la investigación académica, Lindsay continuó con un papel postdoctoral en la prueba de la eficacia de las drogas antimicrobianas dominantes. Durante su investigación, el Dr. Parkes hizo implicado en un proyecto académico de la industria colaborativa con Porvair en la investigación y desarrollo de los productos® de Chromatrap.

El trabajo con las ciencias de Porvair ha proveído del Dr. Lindsay Parkes la oportunidad perfecta de establecer una carrera desafiadora y emocionante que combinaba su pasión para la investigación e interés en el desarrollo de productos.

Citations

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