Les chercheurs indiquent le mécanisme de régulation de virulence dans un superbug

Car la résistance aux antibiotiques est s'élevante et constituante un danger sur la santé publique, développer des antibiotiques neufs est devenu plus urgent que jamais. Les chercheurs à l'Université de la ville de Hong Kong (CityU) ont récent indiqué le mécanisme de régulation de virulence dans les pseudomonas aeruginosa, un superbug qui est courant dans les patients présentant un faible système immunitaire et est résistant à beaucoup d'antibiotiques. Les découvertes préparent des terrains pour recenser de bons objectifs antibiotiques pour le développement neuf de médicament.

Les pseudomonas aeruginosa de Superbug sont un agent pathogène courant des infections nosocomial, entraînant la morbidité et la mortalité élevées dans les patients immunodéprimés. Ils sont également naturellement tolérants à beaucoup d'antibiotiques cliniquement importants tels que l'ampicilline, l'AMOXILLINE, et les vancomycines. En 2017, l'Organisation Mondiale de la Santé (WHO) a classifié cette bactérie notoire en tant qu'un des trois « agents pathogènes critiques prioritaires » que des médicaments neufs sont eus un besoin urgent.

Une recherche commune aboutie par M. Deng Xin (professeur adjoint), un microbiologiste, et M. Wang Xin (professeur agrégé), un biologiste de calcul du service des sciences biomédicales (BMS) chez CityU, ont récent indiqué le réseau de réglementation génomique dans les pseudomonas aeruginosa et ont recensé les régulateurs principaux sur les voies pathogènes principales. Le développement des inhibiteurs contre ces régulateurs principaux neuf recensés peut potentiellement mener à la découverte des médicaments nouveaux qui visent des pseudomonas aeruginosa.

Les découvertes étaient publiées dans la dernière question des transmissions de nature, intitulée « un réseau de réglementation génomique intégré des facteurs transcriptionnels liés à la virulence dans les pseudomonas aeruginosa ».

Conclusion de bons objectifs antibiotiques : régulateurs principaux

La pathogénicité bactérienne est assistée par l'intermédiaire des réseaux de réglementation qui comprennent des facteurs transcriptionnels liés à la virulence. Les facteurs transcriptionnels (TFs) sont des protéines qui peuvent tourner les gènes spécifiques (leurs gènes cibles fonctionnels) "ON" et "OFF", généralement une cause déterminante principale dedans si les fonctions des gènes à un moment donné. Et maîtrisez les régulateurs sont les facteurs transcriptionnels qui semblent régler la plupart des activités de réglementation d'autres facteurs transcriptionnels et des gènes associés. Par conséquent, les régulateurs de maître sont souvent de bons objectifs antibiotiques qui peuvent être employés pour le futur développement de médicament.

Dans les pseudomonas aeruginosa, nombreux TFs règlent la virulence par la détection de ajustement de quorum (QS), la sécrétion du type III (T3SS) et le système de sécrétion du type VI (T6SS). Pendant les dernières sept années, en collaboration avec professeur Liang Haihua de l'université du nord-ouest (Chine), M. Deng avait travaillé pour indiquer la pathogénie des pseudomonas aeruginosa, et pour découvrir et expliquer le mécanisme de régulation de TFs lié à la virulence multiple (Shao et autres, J Bacteriol, 2018 ; Zhao et autres, biol de PLOS, 2016 ; Kong et autres, recherche d'acides nucléiques, 2015 ; Liang et autres, recherche d'acides nucléiques, 2014 ; Liang et autres, J Bacteriol, 2012).

Pour réaliser davantage une analyse globale de la pathogénicité et découvrir les objectifs potentiels neufs de médicament des pseudomonas aeruginosa, l'équipe de M. Deng et l'équipe de M. Wang ont collaboré sur l'analyse et la découverte de l'interférence - signalez la voie affectant des des autres - dans les 20 connus TFs lié à la virulence. Par la suite, ils ont tracé le réseau de réglementation génomique de pseudomonas aeruginosa (PAGnet) pour coder les relations de réglementation de ces 20 TFs avec leurs gènes cibles fonctionnels (le schéma 1).

Ce PAGnet a indiqué le mécanisme compliqué d'assisté réglementaire de virulence par des ces TFs et l'interférence relative, et a par conséquent mené à l'identification de neuf régulateurs principaux, dans le QS et le T3SS.

Une plate-forme en ligne pour l'usage pathologique plus large potentiel

Comme cotisation à la communauté de la recherche, ils ont également développé une plate-forme en ligne et l'envoi de R basés sur PAGnet pour assurer un réseau de réglementation à jour et pour faciliter des analyses usager-personnalisées. Cette plate-forme et envoi de R fournissent la visualisation de réseau, sous-réseau filtrant et téléchargeant les services à l'usager, pour faciliter la visualisation et l'exploration du réseau de réglementation de virulence, ainsi que l'analyse principale de régulateur pour l'identification de TFs principal qui négocient un procédé biologique ou une voie dans les pseudomonas aeruginosa.

Les régulateurs principaux que nous avons recensés sont les objectifs antibiotiques potentiels, qui a la signification clinique importante pour le développement des antibiotiques neufs pour des pseudomonas aeruginosa à l'avenir. D'une manière primordiale, le réseau que nous établissons n'est pas simplement pour des pseudomonas aeruginosa, la méthodologie et les conclusions de ce travail peuvent s'appliquer à d'autres agents pathogènes bactériens à l'avenir, »

M. Deng Xin, microbiologiste, Université de la ville de Hong Kong

M. Deng et M. Wang sont les auteurs de correspondance du papier. Les premiers co-auteurs sont stagiaire Huang Hao de PhD, Xie Yingpeng et M. Shao Xiaolong d'aide à la recherche au service du BMS de CityU. D'autres auteurs incluent le stagiaire Wang Tingting de PhD et l'aide à la recherche Zhang Yingchao du service.

Source:
Journal reference:

Huang, H. et al. (2019) An integrated genomic regulatory network of virulence-related transcriptional factors in Pseudomonas aeruginosa. Nature Communications. doi.org10.1038/s41467-019-10778-w