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Campioni di sangue di uso dei ricercatori dallo zoo per migliorare prognosi su ordinatore di malattia

I ricercatori vogliono usare i simili reticoli genetici, che sono stati presenti nel sangue degli esseri umani e degli animali per le migliaia di anni, per migliorare la prognosi su ordinatore di malattia.

Il progetto di ricerca è insolito per i bioinformaticians non solo a causa della cooperazione con lo zoo.

La misurazione dei profili di sangue molecolari degli animali non è stata fatta mai prima di in questo modo,„

Andreas Keller, il professor di bioinformatica, università di Saarland

Invece del tessuto d'esame e dei dati dai pazienti, da Keller e da Eckart umani Meese, un genetista umano da Saarbrücken, campioni di sangue analizzati da 21 animale. Direttore di zoo Richard Francke aveva raccolto il sangue durante gli esami sistematici fra 2016 e 2018 e lo aveva messo a disposizione degli scienziati. Infatti, questi scienziati studiano normalmente i biomarcatori che si presentano nel sangue umano per identificare i tumori o le malattie del polmone quali Alzheimer e Parkinson più in anticipo e migliori. “Micro--RNAs sia ben adattato per questo,„ dice Andreas Keller.

“Queste sono brevi sezioni delle molecole specifiche in acido ribonucleico che svolgono un ruolo importante nel controllo dei geni. Per trovare queste sezioni, i ricercatori usano i metodi bioinformatic moderni, compreso l'apprendimento automatico, un metodo di intelligenza artificiale. Ciò a sua volta piombo ad una sfida in cui gli animali dai due zoo di Saarland possono aiutare. “Fino a 20 milione punti di informazioni sono raccolti per paziente (dell'essere umano). I metodi di apprendimento automatico riconoscono i reticoli tipici, per esempio per un tumore o un morbo di Alzheimer del polmone. Tuttavia, è difficile affinchè l'intelligenza artificiale impari quali reticoli di biomarcatore sono reali e quale sembrano soltanto misura il rispettivo quadro clinico.„ Ciò è dove i campioni di sangue degli animali entrano in gioco.

“Se un biomarcatore evolutionarily è conservato, cioè egualmente si presenta in altre specie nel simile modulo e funzione, è molto più probabile che è un biomarcatore resiliente,„ spiega il professor Keller. Per questo motivo, i ricercatori hanno analizzato i residui dai campioni di sangue prelevati dagli animali. Complessivamente 21 campione è stato prelevato da 19 specie animali, compreso i coati e un pinguino di Humboldt. “I nuovi risultati ora stanno comprendendi nei nostri modelli elaborati dal calcolatore e ci aiuteranno ad identificare i biomarcatori corretti più precisamente in futuro,„ spiega Keller.

I ricercatori da Saarbrücken hanno pubblicato i loro risultati nella ricerca rinomata degli acidi nucleici del giornale. Inoltre, hanno installato un database in cui egualmente forniscono i loro risultati attuali. Finora, gli scienziati hanno esaminato il sangue di complessivamente 40 animali, compreso un'anaconda e un canguro. Gli scienziati da ogni parte del mondo ora hanno accesso a questi dati. Il progetto di ricerca è stato supportato finanziariamente dal governo statale di Saarland.

Source:
Journal reference:

Fehlmann, T. et al. (2019) The sncRNA Zoo: a repository for circulating small noncoding RNAs in animals. Nucleic Acids Research. doi.org/10.1093/nar/gkz227 .