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As amostras de sangue do uso dos pesquisadores do jardim zoológico a melhorar computador-ajudaram ao prognóstico da doença

Os pesquisadores querem usar os testes padrões genéticos similares, que estaram presente no sangue dos seres humanos e dos animais para milhares de anos, para melhorar o prognóstico computador-ajudado da doença.

O projecto de investigação é incomum para bioinformaticians não somente devido à cooperação com o jardim zoológico.

Medir os perfis de sangue moleculars dos animais foi feita nunca antes de desta maneira,”

Andreas Keller, professor da bioinformática, universidade de Saarland

Em vez do tecido de exame e dos dados dos pacientes, de Keller e de Eckart humanos Meese, um geneticista humano de Saarbrücken, amostras de sangue analisadas de 21 animais. O director de jardim zoológico Richard Francke tinha recolhido o sangue durante exames rotineiros entre 2016 e 2018 e tinha-o feito disponível aos cientistas. De facto, estes cientistas investigam normalmente os biomarkers que ocorrem no sangue humano a fim identificar tumores ou doenças do pulmão tais como Alzheimer e Parkinson mais adiantados e melhores. “Micro-RNAs é o poço - serido para este,” diz Andreas Keller.

“Estas são secções curtos das moléculas específicas no ácido ribonucléico que jogam um papel importante no controle dos genes. A fim encontrar estas secções, os pesquisadores usam os métodos bioinformatic modernos, incluindo a aprendizagem de máquina, um método da inteligência artificial. Isto conduz por sua vez a um desafio em que os animais dos dois jardins zoológicos de Saarland podem ajudar. “Até 20 milhão pontos de dados são recolhidos pelo paciente (do ser humano). Os métodos da aprendizagem de máquina reconhecem os testes padrões típicos, por exemplo para um tumor ou uma doença de Alzheimer do pulmão. Contudo, é difícil para que a inteligência artificial aprenda que testes padrões do biomarker são reais e quais parecem somente caber a imagem clínica respectiva.” Isto é o lugar aonde as amostras de sangue dos animais entram o jogo.

“Se um biomarker é conservado evolutionarily, isto é igualmente ocorre na outra espécie no formulário similar e função, é muito mais provável que é um biomarker resiliente,” explica o professor Keller. Por este motivo, os pesquisadores analisaram os resíduos das amostras de sangue tomadas dos animais. Um total de 21 amostras foi tomado de 19 espécies animais, incluindo um coati e um pinguim de Humboldt. “Os resultados novos agora estão sendo incorporados em nossos modelos de computador e ajudar-nos-ão a identificar mais precisamente no futuro os biomarkers correctos,” explicam Keller.

Os pesquisadores de Saarbrücken publicaram seus resultados na pesquisa ilustre dos ácidos nucleicos do jornal. Além, estabeleceram uma base de dados a que igualmente incorporam seus resultados actuais. Até agora, os cientistas examinaram o sangue de um total de 40 animais, incluindo uma anaconda e um canguru. Os cientistas do mundo inteiro têm agora o acesso a estes dados. O projecto de investigação foi apoiado financeira pelo governo estadual de Saarland.

Source:
Journal reference:

Fehlmann, T. et al. (2019) The sncRNA Zoo: a repository for circulating small noncoding RNAs in animals. Nucleic Acids Research. doi.org/10.1093/nar/gkz227 .