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Muestras de sangre del uso de los investigadores del parque zoológico para perfeccionar pronóstico de ayuda de computadora de la enfermedad

Los investigadores quieren utilizar las configuraciones genéticas similares, que han estado presentes en la sangre de seres humanos y de animales para los millares de años, para perfeccionar pronóstico de ayuda de computadora de la enfermedad.

El proyecto de investigación es inusual para los bioinformaticians no sólo debido a la cooperación con el parque zoológico.

La medición de los perfiles de sangre moleculares de animales nunca se ha hecho antes de esta manera,”

Andreas Keller, profesor de la bioinformática, universidad del Sarre

En vez de tejido de examen y de datos de los pacientes, de Keller y de Eckart humanos Meese, genetista humano de Saarbrücken, muestras de sangre analizadas a partir de 21 animales. Director de parque zoológico Richard Francke había cerco la sangre durante exámenes rutinarios entre 2016 y 2018 y la había puesto a disposición los científicos. De hecho, estos científicos investigan normalmente los biomarkers que ocurren en sangre humana para determinar tumores o enfermedades del pulmón tales como Alzheimer y Parkinson anteriores y mejores. “Micro-RNAs esté bien adaptado para esto,” dice a Andreas Keller.

“Éstas son secciones cortas de las moléculas específicas en ácido ribonucleico que desempeñan un papel importante en el mando de genes. Para encontrar estas secciones, los investigadores utilizan métodos bioinformatic modernos, incluyendo el aprendizaje de máquina, un método de inteligencia artificial. Esto a su vez lleva a un reto en el cual los animales de los dos parques zoológicos del Sarre puedan ayudar. “Hasta 20 millones de puntos de referencias cerco por paciente (del ser humano). Los métodos del aprendizaje de máquina reconocen las configuraciones típicas, por ejemplo para un tumor o una enfermedad de Alzheimer del pulmón. Sin embargo, es difícil para que la inteligencia artificial aprenda qué configuraciones del biomarker son reales y cuáles parecen solamente ajustar el retrato clínico respectivo.” Aquí es adonde las muestras de sangre de los animales entran en el juego.

“Si un biomarker evolutionarily se conserva, es decir también ocurre en la otra especie en forma similar y función, es mucho más probable que sea un biomarker resistente,” explica a profesor Keller. Por este motivo, los investigadores analizaban los residuos de las muestras de sangre recogidas de los animales. Un total de 21 muestras fueron recogidas a partir de 19 especies animales, incluyendo un coati y un pingüino de Humboldt. “Las nuevas conclusión ahora se están incorporando en nuestros modelos de ordenador y nos ayudarán a determinar los biomarkers correctos más exacto en el futuro,” explican a Keller.

Los investigadores de Saarbrücken han publicado sus resultados en la investigación renombrada de los ácidos nucléicos del gorrón. Además, han fijado una base de datos en la cual también incorporan sus resultados actuales. Hasta ahora, los científicos han examinado la sangre de un total de 40 animales, incluyendo una anaconda y un canguro. Los científicos de todas partes del mundo ahora tienen acceso a estos datos. El proyecto de investigación fue soportado financieramente por el gobierno estatal del Sarre.

Source:
Journal reference:

Fehlmann, T. et al. (2019) The sncRNA Zoo: a repository for circulating small noncoding RNAs in animals. Nucleic Acids Research. doi.org/10.1093/nar/gkz227 .