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Les scientifiques confirment la théorie de VIH en ordonnançant le tissu de personne de 53 ans

Les chercheurs ont extrait un génome HIV-1 proche-complet du tissu de ganglion lymphatique d'un homme au République démocratique du Congo qui a été encastré en cire depuis 1966.

Virus VIHBiomédical | Shutterstock

La pointe du tissu, qui est autour de la taille du clou sur le doigt rosâtre, a été découpée en tranches de l'homme de personne de 38 ans qui avait été fixé avec de la formaline dans une case protectrice de paraffine, avec de l'ARN viral caché dans son ganglion lymphatique pendant plus de 50 années.

Une fois libéré de son enveloppe de cire, le génome HIV-1 proche-complet que l'équipe a extrait supporte la théorie que le virus a été communiqué à des êtres humains des singes dans la premiers décennie ou deux du siècleth 20.

Le génome, qui fournit « une horloge moléculaire » plus précise pour évaluer l'évolution du VIH, est l'exemple le plus ancien d'un génome HIV-1 presque complet jusqu'à présent.

L'analyse du génome a prouvé qu'elle n'explique pas une chronologie évolutionnaire qui est différente de ceux produites des échantillons plus récents et dissipe le « patient zéro" mythe - la théorie que le VIH a été introduit aux Etats-Unis après qu'il ait été communiqué à un steward (hôtesse de l'air).

HIV-1, qui est l'un des virus principaux qui entraîne le SIDA, a été la première fois découvert en 1983. Des échantillons plus anciens contenant la séquence génétique du virus sont rares et leur matériel génétique a habituellement dégradé.

Les chercheurs écrivent :

Avec très peu des caractéristiques biologiques directes de HIV-1 avant des années 1980, des inférences évolutionnaires et épidémiologiques d'une grande portée concernant la longue phase de pré-découverte de cette pandémie sont basées sur des extrapolations par les modèles phylodynamic des séquences génomique HIV-1 recueillies en grande partie au-dessus des dernières décennies. »

Compréhension des origines de l'épidémie de VIH

La séquence proche-complète extraite de cet échantillon 1966 est dix ans plus que la séquence intégrale la plus ancienne précédente produite.

Elle fournit un aperçu de la façon dont le virus a examiné quand il était diffusion non détectée en Afrique centrale, 15 ans avant quand une chaîne de caractères des infections parmi des homosexuels aux États-Unis, menée à l'accusé de réception qu'une maladie neuve avait apparu que des chercheurs éventuellement AIDS appelé.

Selon le chercheur Michael Worobey de fil et l'équipe, prévoyant exact quand la pandémie de HIV/SIDA lancée est de la grande importance parce qu'elle permet à des chercheurs de comprendre quels facteurs ont fait ou n'ont pas contribué à l'émergence du virus causal.

Les chercheurs ont employé les séquences génétiques des virus qui les personnes infectées en jours plus tôt de l'épidémie de sida à essayer d'estimer quand exact le virus VIH a sauté des primates aux êtres humains. En comparant des différences dans les séquences virales, les chercheurs peuvent estimer combien de temps il y a les séquences pourrait avoir divergé de la même source.

Ceci ne peut pas déterminer quand le saut aux êtres humains s'est produit, mais il peut employer pour déduire qu'il a dû avoir eu lieu avant un moment particulier.

Les efforts précédents pour indiquer exactement la période précise d'origine ont proposé que le virus ait été introduit aux êtres humains pendant le siècle 20th tôt en Afrique centrale, où les populations une fois-d'isolement s'étaient mélangées et avaient fusionné.

Maintenant, Worobey dit les caractéristiques neuves proposent le VIH n'ait pas déménagé probablement des primates aux êtres humains pendant les années 1920 et Pepin pense qu'elle a pu même avoir fait ainsi vers la fin des 1800s

Worobey et équipe indiquent que leur guérison du premier génome HIV-1 des années 1960 fournit la preuve directe qui les estimations qui ont été effectuées au cours des 50 dernières années sont remarquablement fiables.

Les chercheurs écrivent :

Les analyses n'ont pas modifié de manière significative le fond et les estimations internes d'âge de noeud basés sur des séquences de post-1978 HIV-1… Et, parce que ce génome lui-même a été échantillonné seulement environ un demi-siècle après l'origine prévue de la pandémie, il ancre empiriquement cette inférence essentielle avec la confiance élevée. »

Worobey, dont l'équipe réalise des études virologiques d'archéologie sur de vieux tissus et prises de sang, dit que la recherche a impliqué beaucoup d'années de travail : « Juste sur cette séquence, nous avions branché loin pendant plus de cinq années. »

Confirmation de la théorie

Il convient noter que le travail a jusqu'ici seulement été posté sur le bioRxiv de site Web de prétirage et n'a pas été encore soumis à un tourillon scientifique ou à une inspection professionnelle subie.

Cependant, Oliver Pybus, un professeur d'évolution et maladies infectieuses à l'université d'Oxford, a félicité le travail, dire que le rétablissement d'une séquence génétique d'un spécimen archivé de tissu est techniquement impressionnant.

« Bien que sa découverte ne modifie pas considérablement notre modèle actuel de l'histoire génétique tôt de l'épidémie du sida, elle améliore notre confiance dans les conclusions précédemment tirées de moderne et des séquences du gène partielles de VIH, » dit Pybus.

L'expert en matière Jacques Pepin (université de maladie infectieuse de Sherbrooke, du Québec) est un auteur de la littérature sur l'histoire de l'épidémie de sida et travaille actuel à la deuxième édition de son livre « l'origine du SIDA, » qui doit être tardive publié l'année prochaine. Pepin a le travail appelé de Worobey « un exploit technique » et indique qu'il planification pour factoriser dans les mises à jour en sa dernière publication.

En conclusion, Worobey et équipe écrivent : « Cette seule séquence HIV-1 archivistique fournit l'analyse génomique directe dans le transporteur de HIV-1 en 1960 s [République démocratique du Congo], et, comme calibreur ancien-ADN, elle valide notre compréhension de l'histoire HIV-1 évolutionnaire. »

Journal reference:

Gryseels, S., et al. (2019). A near-full-length HIV-1 genome from 1966 recovered from formalin-fixed paraffin-embedded tissue. bioRxiv. https://doi.org/10.1101/687863.

Sally Robertson

Written by

Sally Robertson

Sally first developed an interest in medical communications when she took on the role of Journal Development Editor for BioMed Central (BMC), after having graduated with a degree in biomedical science from Greenwich University.

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