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Gli scienziati confermano la teoria del HIV ordinando il tessuto di 53 anni

I ricercatori hanno estratto un genoma quasi-completo di HIV-1 dal tessuto di linfonodo di un uomo nel Repubblica Democratica del Congo che è stato incassato in cera dal 1966.

Virus del HIVBiomedico | Shutterstock

La sporgenza del tessuto, che è intorno alla dimensione dell'unghia sul mignolo, è stata affettata dall'uomo di 38 anni che era stato fissato con formalina in un blocco protettivo di paraffina, con il RNA virale nascosto nel suo linfonodo per più di 50 anni.

Liberato una volta dalla sua intelaiatura della cera, il genoma quasi-completo di HIV-1 che il gruppo ha estratto supporta la teoria che il virus è stato trasmesso agli esseri umani dalle scimmie all'interno della dei prima decade o due del secoloth 20.

Il genoma, che fornisce “un orologio molecolare„ più accurato per la valutazione dell'evoluzione del HIV, è il più vecchio esempio di un genoma quasi completo di HIV-1 fin qui.

L'analisi del genoma ha indicato che non dimostra una cronologia evolutiva che fosse affatto differente da quelle generate dai campioni più recenti e dissipasse “il paziente zero" mito - la teoria che il HIV è stato presentato negli Stati Uniti dopo che sono stati trasmessi ad un sorvegliante di volo.

Il HIV-1, che è uno dei virus principali che causa l'AIDS, in primo luogo è stato scoperto nel 1983. I più vecchi campioni che contengono la sequenza genetica del virus sono insufficienti ed il loro materiale genetico si è degradato solitamente.

I ricercatori scrivono:

Con pochissimo i dati biologici diretti del HIV-1 prima degli anni 80, dalle illazioni evolutive ed epidemiologiche ampie per quanto riguarda la fase lunga di pre-scoperta di questa pandemia sono basati sulle estrapolazioni dai modelli phylodynamic delle sequenze genomiche di HIV-1 riunite principalmente durante gli ultimi decenni.„

Comprensione delle origini dell'epidemia del HIV

La sequenza quasi-completa estratta da questo campione 1966 è dieci anni più vecchia di più vecchia sequenza integrale precedente generata.

Fornisce un'occhiata di come il virus ha guardato quando era circolare inosservata in Africa centrale, 15 anni prima dell'quando una serie di infezioni fra gli omosessuali negli Stati Uniti, piombo al riconoscimento che una nuova malattia era emerso che i ricercatori finalmente hanno chiamato AIDS.

Secondo il ricercatore Michael Worobey del cavo ed il gruppo, calcolatore esattamente quando la pandemia di HIV/AIDS prodotta è di grande importanza perché permette ai ricercatori di capire quali fattori hanno fatto o non hanno contribuito all'emergenza del virus causale.

I ricercatori hanno usato le sequenze genetiche dei virus che hanno infettato la gente nei giorni più in anticipo dell'epidemia di AIDS per provare a stimare quando esattamente il virus del HIV ha saltato dai primati agli esseri umani. Confrontando le differenze nelle sequenze virali, i ricercatori possono stimare quanto tempo fa le sequenze potrebbe divergere dalla stessa sorgente.

Ciò non può determinare quando il salto agli esseri umani è accaduto, ma può essere usato per dedurre che ha dovuto avere luogo prima di un tempo particolare.

Gli sforzi precedenti per segnare il periodo con esattezza preciso dell'origine hanno suggerito che il virus fosse presentato agli esseri umani durante il secolo in anticipoth 20 in Africa centrale, in cui le popolazioni una volta isolate hanno avute misto e fuse.

Ora, Worobey dice i nuovi dati suggeriscono il HIV probabilmente non si sia mosso dai primati verso gli esseri umani durante gli anni 20 e Pepin pensa che possa anche agire in tal modo verso la fine dei 1800s

Worobey ed il gruppo dicono che il loro ripristino del primo genoma di HIV-1 a partire dagli anni 60 fornisce la prova diretta che le valutazioni che sono state effettuate durante gli ultimi 50 anni sono notevolmente affidabili.

I ricercatori scrivono:

Le analisi non hanno alterato significativamente la root ed i preventivi interni dell'età di vertice basati sulle sequenze di HIV-1 post-1978… E, perché questo genoma stesso è stato campionato soltanto circa un mezzo secolo dopo l'origine stimata della pandemia, empiricamente ancora questa illazione cruciale con alta fiducia.„

Worobey, di cui il gruppo svolge gli studi virologic di archeologia sui vecchi tessuti e campioni di sangue, dice che la ricerca ha compreso molti anni di lavoro: “Appena su quella sequenza, stiamo sgobbando per più di cinque anni.„

Conferma della teoria

Dovrebbe essere notato che il lavoro è stato inviato finora soltanto sul bioRxiv del sito Web della pubblicazione preliminare ed ancora non è stato presentato ad un giornale scientifico o ad una revisione tra pari subita.

Tuttavia, Oliver Pybus, un professore di evoluzione e malattie infettive all'università di Oxford, ha elogiato il lavoro, ad esempio che la generazione di sequenza genetica da un esemplare archivato del tessuto è tecnicamente impressionante.

“Sebbene la sua scoperta non alteri sostanzialmente il nostro modello corrente della cronologia genetica iniziale della pandemia di AIDS, migliora la nostra fiducia nelle conclusioni precedentemente ricavate da moderno e sequenze parziali del gene del HIV,„ dice Pybus.

L'esperto Jacques Pepin (università nella malattia infettiva di Sherbrooke, di Quebec) è un autore di letteratura sulla cronologia dell'epidemia di AIDS e corrente sta lavorando alla seconda edizione del suo libro “l'origine dell'AIDS,„ che è l'anno prossimo dovuta essere recente pubblicato. Pepin ha chiamato il lavoro di Worobey “un'abilità tecnologica„ e che dice che pianificazione scomporre negli aggiornamenti in sua ultima pubblicazione.

In conclusione, Worobey ed il gruppo scrivono: “Questa sequenza archivistica unica di HIV-1 fornisce la comprensione genomica diretta nel DRC di HIV-1 nel 1960 s [Repubblica Democratica del Congo] e, come calibratore antico-DNA, convalida la nostra comprensione della cronologia evolutiva di HIV-1.„

Journal reference:

Gryseels, S., et al. (2019). A near-full-length HIV-1 genome from 1966 recovered from formalin-fixed paraffin-embedded tissue. bioRxiv. https://doi.org/10.1101/687863.

Sally Robertson

Written by

Sally Robertson

Sally first developed an interest in medical communications when she took on the role of Journal Development Editor for BioMed Central (BMC), after having graduated with a degree in biomedical science from Greenwich University.

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