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El estudio muestra cómo la DNA doble barcoding podría ayudar a perfeccionar la diagnosis de infecciones por hongos

Un nuevo estudio del instituto de Westmead para la investigación médica (WIMR) ha demostrado cómo la DNA doble barcoding podría ayudar a perfeccionar la diagnosis de enfermedades fungicidas invasores, dando a pacientes el acceso al tratamiento potencialmente salvavidas mucho más pronto.

La detección temprana de patógeno fungicidas - la especie específica de hongos responsables de enfermedad - es crucial en asegurarse de que los pacientes tienen de rápido acceso al tratamiento, previniendo complicaciones. Sin embargo, los métodos diagnósticos actuales son que toma tiempo, complejo y no son siempre exactos, dando por resultado retrasos en el tratamiento y la terapia inadecuada, aumentando el riesgo de morbosidad y de mortalidad.

La DNA doble barcoding es una técnica emergente usada para determinar patógeno fungicidas. Utiliza dos regiones únicas de DNA que sean específicas a cada especie fungicida patógena - la región barcoding primaria, región transcrita interna del espaciador (SU) y la región barcoding secundaria, factor de translación 1α de la elongación (TEF1α).

La DNA fungicida se extrae de una muestra paciente, donde después “se amplifica” o se multiplica para aumentar la cantidad de DNA disponible para ordenar. La información de la DNA dato-se mina, y se compara a una base de datos de referencia para determinar el patógeno fungicida.

Aunque la región barcoding secundaria fuera introducida en 2017, su impacto y eficacia, hasta ahora, no se ha fijado.

El investigador del guía, profesor Wieland Meyer dijo:

Nuestro estudio es el primer para comparar la exactitud de las dos regiones barcoding, y para evaluar la eficacia de SU y de TEF1α combinados.

Podíamos determinar correctamente toda la especie fungicida enfermedad-que causaba, de los albicans fungicidas humanos mas comunes de la candida el patógeno, a las especies que causan raramente infecciones. Encontramos que la región barcoding primaria solamente no podría descubrir toda la especie - sin embargo, la región secundaria, así como los dos combinados, completado este entrehierro.

Totales, encontramos que la combinación de ambos códigos de barras habilitó una identificación más exacta de la especie fungicida, determinado en caso de que un único sistema barcoding no puede hacer tan.”

Las enfermedades fungicidas invasores (IFD), tales como infecciones de los neoformans del criptococo o la aspergilosis son una amenaza cada vez mayor para la salud global, con más de 1,6 millones de muertes atribuidas a IFDs cada año. Las nuevas infecciones continúan emerger, por ejemplo la nueva especie multidrug-resistente de candida, los auris de la C., que tiene la capacidad de extenderse rápidamente y de persistir en ambientes de la atención sanitaria.

Profesor Meyer dijo, “determinando el tipo de hongos que está causando la infección nos ayudará a administrar el tratamiento apropiado más rápido, reduciendo el daño y, potencialmente, las tasas de mortalidad asociados a IFDs.

“Puede también perfeccionar otras complicaciones asociadas a IFDs, tal como resistencia a los medicamentos, y el impacto financiero IFDs puede tener en los pacientes y el sistema sanitario.

“Mientras que ahora sabemos que el sistema barcoding doble de la DNA es más efectivo en determinar especie fungicida, necesitamos aumentar la cantidad de series disponibles en bases de datos de la serie de la referencia para maximizar el número de especie que podemos determinar.

“Ahora estamos pidiendo que los investigadores de todo el mundo sometieran las series de la referencia que se pueden utilizar para determinar patógeno fungicidas.

“Perfeccionando nuestra base de datos, y, a su vez, aumentando nuestra capacidad de utilizar la DNA doble barcoding, podremos reducir el tiempo de vuelta diagnóstico a partir de días o de semanas a menos de 24 horas, que podrían tener un impacto importante en resultados pacientes, y podríamos potencialmente salvar vidas.”

Source:
Journal reference:

Hoang, M.T.V. et al. (2019) Dual DNA Barcoding for the Molecular Identification of the Agents of Invasive Fungal Infections. Frontiers in Microbiology. doi.org/10.3389/fmicb.2019.01647.