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El ARN que ordenaba datos agregó al estudio robusto de la enfermedad de Parkinson

Las personas en la Facultad de Medicina de Keck de USC, en colaboración con el Michael J. Fox Foundation para la investigación de Parkinson (MJFF), acaban de agregar un nuevo elemento crucial - ARN que ordena datos -- a su estudio robusto de la enfermedad de Parkinson.

La secuencia del ARN implica el analizar de muestras de sangre para entender cómo los scripts genéticos se expresan en diversos procesos biológicos, incluyendo estados de la enfermedad. Observando cambios en ARN en un cierto plazo en los pacientes que desarrollan a Parkinson, los investigadores esperan determinar algunos de los sellos más tempranos de la enfermedad que puede aparecer incluso antes de que se presentan los síntomas.

El nuevo grupo de datos masivo es parte de la iniciativa de los marcadores de la progresión del Parkinson (PPMI), la firma del MJFF, estudio de los grande-datos de la enfermedad de Parkinson que ha datos clínicos, biológicos y de la proyección de imagen del cerco a partir de 1.400 individuos terminado por lo menos cinco años. El ARN que ordenaba datos era analizado dentro del instituto de USC de la genómica de translación y está siendo salvado y compartido por el centro de datos avanzado en el laboratorio de la proyección de imagen neura, una parte de la marca de USC y Maria Stevens Neuroimaging e instituto de la informática.

El clínicos increíblemente ricos, la proyección de imagen y los datos biológicos cerco para la iniciativa han ayudado ya a investigadores mejor debajo y caracterizan la enfermedad de Parkinson. Los datos transcriptomic nuevamente adicionales agregan una capa adicional de diversidad, habilitando la identificación de lazos entre las variables que serían de otra manera imposibles.”

Arturo W. Toga, director de la marca de USC y Maria Stevens Neuroimaging e instituto de la informática

El esfuerzo es parte de un movimiento importante--ambos en la investigación de Parkinson y más ampliamente en el estudio de enfermedades neurológicas--hacia el empalme directo de las herramientas de análisis de datos con los archivos de los datos. Hasta hace poco tiempo, requirieron a los investigadores que deseaban llegar hasta grupos de datos existentes transferir archivos directamente masivos y cuidadosamente ordenar, armonizar y analizar informaciones en bruto.

Ahora, las personas han comenzado a coimplantar las tecnologías de almacenamiento de la visualización, analíticas y de los datos de modo que los investigadores puedan conducto inmediatamente análisis preliminares en línea sin transferir ningunos archivos directamente, mientras que los que desean realizar análisis más profundizados pueden todavía llegar hasta informaciones en bruto.

Los investigadores de PPMI se adhieren a los protocolos estrictos para obtener y salvar datos. Esta aproximación robusta hace los datos altamente seguros, reduciendo inconsistencias o fuentes potenciales de la polarización negativa.

“PPMI ha construido el grupo de datos del Parkinson más robusto hasta la fecha, cerco clínico, proyección de imagen e información biológica de voluntarios encima por lo menos cinco años para entender mejor inicio y la progresión de la enfermedad,” dijo a Todd Sherer, CEO del MJFF. “El ARN de PPMI que ordena proyecto aumenta importante el valor del estudio y nos mueve más cercano a sus metas para definir, para medir y para tratar mejor la enfermedad de Parkinson.”

David W. Craig, codirector del instituto de la genómica de translación en la escuela de Keck, y Kendall Van Keuren-Jensen, del instituto de investigación de translación de la genómica, un afiliado de la ciudad de la esperanza, esperan que el nuevo grupo de datos pueda ayudar a investigadores mejor a entender la progresión de la enfermedad e incluso a desarrollar terapias apuntadas.

“Una enfermedad neurológica o neurodegenerative puede existir para 10 a 15 años antes de que vemos cambios en el cerebro con proyección de imagen,” dijo a Craig, cuyas personas se centran en traducir tecnología de la genómica del banco de trabajo a la cabecera. “Si encontramos un indicador de la sangre, ésa puede llevar a diagnosis anterior y a intervenciones terapéuticas más efectivas.”

La marca y Maria Stevens Neuroimaging e informática de USC instituyen los ordenadores principal la recogida de datos extensa--el ARN que ordena las cantidades solas a 108 Terabyte, el equivalente del proyecto de 47.520.000.000 paginaciones pulsadas a un espacio--junto con el portal del abierto-acceso que combina funciones del almacenamiento, analíticas y de la visualización.

Salva actualmente datos de casi 50.000 temas en 125 diversos estudios, también ha promovido los métodos asegurados para tramitar, compartir y visualizar grupos de datos grandes. Además de recibir datos de PPMI, el archivo del instituto es casero a la iniciativa de Neuroimaging de la enfermedad de Alzheimer, una colaboración global definir la progresión de la enfermedad de Alzheimer.

“Ahora que estos datos han cerco, nuestra meta es asegurar que continúan aprovisionar de combustible nuevos descubrimientos,” la toga dice. “Que es qué impulsa a nuestro instituto para guardar el encontrar de nuevas e innovadoras maneras de conectar a investigadores con grupos de datos grandes y cada vez más diversos.”