As biópsias líquidas fornecem a imagem completa das alterações genéticas ligadas à resistência de droga do cancro

Muitos pacientes vêem seus tumores encolher em resposta a uma droga, simplesmente para mandá-los voltar com uma vingança enquanto evoluem para afastar fora o tratamento. Os oncologistas querem poder detectar rapidamente a resistência de droga do cancro como emerge em seus pacientes e identificam uma outra droga que os tumores ainda responderão a.

Um estudo novo de um grupo de pesquisadores no instituto largo do MIT e o Harvard, o Hospital Geral de Massachusetts (MGH), a pesquisa do IBM, e as outras organizações é uma etapa para a frente nesse sentido. Os pesquisadores examinaram um método novo para provar os tumores conhecidos como a biópsia líquida -- uma amostra de sangue de um paciente que contivesse o ADN derramou dos tumores, chamados ADN de circulação do tumor, ou ctDNA, que pode ser isolado e analisado.

A equipa de investigação comparou os resultados de biópsias líquidas e padrão do tecido dos pacientes que foram tratados para o cancro gastrintestinal mas desenvolveu a resistência de droga. Os resultados, publicados hoje na medicina da natureza, revelam que as biópsias líquidas fornecem uma imagem mais completa da diversidade genética do cancro de um paciente e como os tumores evoluem a resistência de droga a nível molecular. Essa imagem está desafiando a vista de como a resistência de droga do cancro emerge tipicamente, com implicações importantes para o tratamento.

Notàvel, nós encontramos que quase cada paciente que nós analisamos tinha desenvolvido não apenas um, mas mecanismos múltiplos da resistência de droga simultaneamente, e este pode ser mais comum do que nós previamente thoughtThat somos uma SHIFT real do paradigma e nos forçaremos à reconsideração não apenas a biologia da resistência de droga do cancro mas também como nós a aproximamos terapêutica no futuro.”

Gad Getz, autor co-superior do estudo, director do grupo computacional da análise do genoma do cancro no largo e o Paul C. Zamecnik Cadeira na oncologia no centro do cancro de MGH

Os resultados poderiam explicar porque o cancro, uma vez que desenvolveu a resistência de droga, é tão difícil de derrotar. O estudo igualmente sugere os mecanismos moleculars possíveis que são a base da resistência de droga, que poderia apontar a maneira à terapêutica nova e mais personalizada.

As biópsias do tecido são um essencial do diagnóstico do cancro, mas são invasoras e fornecem um relance de somente um lugar em um único tumor. Contudo as pilhas do tumor, mesmo as próximas, podem ser genetically distintas de uma outra. As biópsias líquidas, que incorporam a informação das lesões múltiplas do tumor, são uma alternativa prometedora, mas são usadas raramente na clínica.

Para investigar o serviço público de biópsias líquidas em detectar a resistência de droga adquirida no cancro, Getz, autor Ryan co-superior Corcoran, um investigador em MGH e Faculdade de Medicina de Harvard, e seus colegas, incluindo o primeiro é o autor de Aparna Parikh, de Ignaty Leshchiner, e de Liudmila Elagina, estudado 42 pacientes com formulários diferentes do cancro gastrintestinal que se submetiam ao tratamento com drogas visadas. Quando os pacientes mostraram sinais da resistência de droga, os pesquisadores analisaram seus tumores usando biópsias do líquido e do tecido. Aproveitaram uma série das ferramentas computacionais desenvolvidas no instituto largo, conhecido como PhylogicNDT, para analisar o ADN do tumor e suas mutações da resistência. Uma cara a cara comparação de biópsias do líquido e do tecido revelou que em quase 80% dos casos, as biópsias líquidas desenterraram clìnica as alterações genéticas relevantes ligadas à resistência de droga que não foram identificadas com as biópsias padrão do tecido.

“Este estudo é o maior até agora para comparar directamente a biópsia líquida à biópsia do tumor no ajuste da resistência do cancro,” disse Corcoran. “Nossos resultados sugerem que a biópsia líquida possa ser a modalidade clínica preferida para avaliar como os tumores dos pacientes evoluíram depois que se tornaram resistentes à terapia.”

A análise do ADN de diversos dos pacientes no estudo não mostrou mecanismos claros da resistência. Para aprender mais sobre estes casos, os pesquisadores do IBM na equipe desenvolveram a máquina que aprende que os algoritmos para agrupar junto pacientes de acordo com testes padrões compartilhados ou similares de alterações genéticas ligaram à resistência de droga. Fazendo isso, os pesquisadores podiam sugerir mecanismos possíveis da resistência para estes casos.

O estudo é parte de uma colaboração de cinco anos entre o instituto largo e a pesquisa do IBM para analisar tumores antes e depois do início da resistência de droga, a fim descobrir os mecanismos subjacentes que conduzem a resistência. A colaboração cresceu fora de um projecto da biópsia da resistência e do sangue de droga do cancro apoiado pela fundação da família de Gerstner.

“As equipes do IBM, as largas e do MGH trazem a experiência complementar e as ferramentas à tabela quando lutar com o problema difícil de extrair o significado dos dados, e esta interacção provar ser muito frutuosa,” disseram Laxmi Parida, research fellow do IBM, a genómica computacional, e o co-PI, junto com Getz, na colaboração de Broad/IBM. “A colaboração tem excitado particularmente não somente devido à sinergia excepcional entre as equipes mas igualmente os dados inestimáveis que estão sendo recolhidos para o uso da comunidade de pesquisa inteira.”

Embora este estudo novo gire acima de alguns resultados tentativos, os autores sublinham aquele maior, uns esforços mais detalhados são necessários compreender inteiramente a resistência de droga do cancro. “Para traçar realmente para fora a paisagem completa de mecanismos da resistência do cancro, nós precisamos os estudos muito maiores que medem uma variedade de drogas e tipos do cancro,” dissemos Getz.

Source:
Journal reference:

Parikh, A.R et al. (2019) Liquid versus tissue biopsy for detecting acquired resistance and tumor heterogeneity in gastrointestinal cancers. Nature Medicine. doi.org/10.1038/s41591-019-0561-9.