Las biopsias líquidas ofrecen el retrato completo de los cambios genéticos conectados a la resistencia de medicamento para el cáncer

Muchos pacientes ven sus tumores encogerse en respuesta a una droga, sólo hacer que se vuelvan con una venganza mientras que se desarrollan para mantener lejos el tratamiento. Los oncólogos quieren poder descubrir rápidamente resistencia de medicamento para el cáncer como emerge en sus pacientes y determinan otra droga que los tumores todavía responderán a.

Un nuevo estudio de un grupo de investigadores en el instituto amplio del Hospital General del MIT y de Harvard, Massachusetts (MGH), IBM investiga, y otras organizaciones son un paso adelante en esa dirección. Los investigadores examinaron un nuevo método para muestrear los tumores conocidos como biopsia líquida -- una muestra de sangre de un paciente que contiene la DNA vertió de los tumores, llamados DNA de circulación del tumor, o el ctDNA, que puede ser aislado y ser analizado.

El equipo de investigación comparó los resultados de las biopsias líquidas y estándar del tejido de los pacientes que fueron tratados para el cáncer gastrointestinal pero la resistencia a los medicamentos desarrollada. Las conclusión, publicadas hoy en remedio de la naturaleza, revelan que las biopsias líquidas ofrecen un retrato más completo de la diversidad genética del cáncer de un paciente y cómo los tumores desarrollan resistencia a los medicamentos en el nivel molecular. Ese retrato está desafiando la vista de cómo emerge la resistencia de medicamento para el cáncer típicamente, con las implicaciones importantes para el tratamiento.

Notable, encontramos que casi cada paciente que analizábamos había desarrollado no apenas uno, sino mecanismos múltiples de la resistencia a los medicamentos simultáneamente, y esto puede ser más común que nosotros thoughtThat somos un movimiento real del paradigma y nos forzaremos previamente a repensar no apenas la biología de la resistencia de medicamento para el cáncer pero también cómo nos acercamos a ella terapéutico en el futuro.”

Gad Getz, autor co-mayor del estudio, director del grupo de cómputo del análisis del genoma del cáncer en el amplio y el Paul C. Zamecnik Chair en oncología en el centro del cáncer de MGH

Los resultados podrían explicar porqué el cáncer, una vez que ha desarrollado resistencia a los medicamentos, es tan difícil de derrotar. El estudio también sugiere los mecanismos moleculares posibles que son la base de la resistencia a los medicamentos, que podría apuntar la manera a la nueva y personalizada terapéutica.

Las biopsias del tejido son un apoyo principal de la diagnosis del cáncer, pero son invasores y ofrecen una ojeada de solamente una situación en un único tumor. Con todo las células del tumor, incluso las próximas, pueden ser genético distintas a partir de la otra. Las biopsias líquidas, que incorporan la información de lesiones múltiples del tumor, son una opción prometedora, pero se utilizan raramente en la clínica.

Para investigar la utilidad de biopsias líquidas en descubrir resistencia a los medicamentos detectada en cáncer, Getz, autor Ryan co-mayor Corcoran, investigador en MGH y Facultad de Medicina de Harvard, y sus colegas, incluyendo primeros es autor de Aparna Parikh, de Ignaty Leshchiner, y de Liudmila Elagina, estudiado 42 pacientes con diversas formas del cáncer gastrointestinal que experimentaban el tratamiento con las drogas apuntadas. Cuando los pacientes mostraron signos de la resistencia a los medicamentos, los investigadores analizaban sus tumores usando biopsias del líquido y del tejido. Aprovecharon una habitación de las herramientas de cómputo desarrolladas en el instituto amplio, conocido como PhylogicNDT, para analizar la DNA del tumor y sus mutaciones de la resistencia. Una comparativa de las biopsias del líquido y del tejido reveló que en el casi 80% de casos, las biopsias del líquido desenterraron clínico los cambios genéticos relevantes conectados a la resistencia a los medicamentos que no fueron determinados con biopsias estándar del tejido.

“Este estudio es el más grande hasta la fecha para comparar directamente biopsia líquida a la biopsia del tumor en la fijación de la resistencia del cáncer,” dijo a Corcoran. “Nuestras conclusión sugieren que la biopsia líquida pueda ser la modalidad clínica preferida para fijar cómo los tumores de los pacientes se han desarrollado después de que hayan llegado a ser resistentes a la terapia.”

El análisis de la DNA de varios de los pacientes en el estudio no mostró mecanismos sin obstrucción de la resistencia. Para aprender más sobre estos casos, los investigadores de IBM en las personas desarrollaron la máquina que aprendían que los algoritmos para agrupar a pacientes juntos según las configuraciones compartidas o similares de cambios genéticos conectaron a la resistencia a los medicamentos. De esta manera, los investigadores podían sugerir los mecanismos posibles de la resistencia para estos casos.

El estudio es parte de una colaboración de cinco años entre el instituto y la investigación amplios de IBM para analizar tumores antes y después del inicio de la resistencia a los medicamentos, para descubrir los mecanismos subyacentes que impulsan resistencia. La colaboración creció fuera de un proyecto de la biopsia de la resistencia y de la sangre de medicamento para el cáncer soportado por el asiento de la familia de Gerstner.

“Las personas de IBM, amplias y de MGH traen experiencia complementaria y las herramientas a la tabla mientras que el ataque con el problema difícil de extraer el significado de los datos, y esta acción recíproca ha demostrado ser muy fructuoso,” dijeron Laxmi Parida, el profesor investigador de IBM, la genómica de cómputo, y co-PI, junto con Getz, en la colaboración de Broad/IBM. “La colaboración ha sido determinado no sólo emocionante debido a la sinergia excepcional entre las personas pero también los datos inestimables que están cerco para uso de la comunidad de investigación entera.”

Aunque este nuevo estudio girara encima de algunas conclusión de tormento, los autores acentúan eso más grande, esfuerzos más completos son necesarios entender completo resistencia de medicamento para el cáncer. “Proyectar realmente el paisaje completo de los mecanismos de la resistencia del cáncer, necesitamos estudios mucho más grandes que atraviesen una variedad de drogas y de tipos del cáncer,” dijimos a Getz.

Source:
Journal reference:

Parikh, A.R et al. (2019) Liquid versus tissue biopsy for detecting acquired resistance and tumor heterogeneity in gastrointestinal cancers. Nature Medicine. doi.org/10.1038/s41591-019-0561-9.