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Les chercheurs publient le profil microbien pour supporter l'inducteur croissant de la recherche d'intestin

Il y a 157 organismes qui forment le biome de ligne zéro d'un intestin humain sain, selon la recherche publiée dans le tourillon PLOS UN par des chercheurs à l'université de George Washington (gw). Le profil microbien de ligne zéro, GutFeelingKB appelé, peut être augmenté à 863 organismes si des protéomes étroitement liés sont considérés. Cette information servira de liste des références aux médecins, patients, et les chercheurs, leur donnant une idée derrière de ce qu'un microbiome humain « normal » ressemble.

Plus que nous nous renseignons sur le microbiome humain, plus nous apprenons de son importance pour notre santé. Connaître à ce qu'un intestin humain sain ressemble est critique pour rechercher qui avisera comment diagnostiquer, traiter, et éviter des éditions avec le microbiome. »

Rajah Mazumder, PhD, co-auteur et professeur des biochimies et du médicament moléculaire aux sciences d'École de Médecine et de santé de gw

Cette connaissance complète des types et des rapports de microbes qui habitent l'intestin humain sain est nécessaire avant que n'importe quel genre de préclinique ou d'étude clinique puisse être exécuté. Il est également important pour des chercheurs examinant pour trouver des moyens de modifier le microbiome, de traiter une condition, ou d'améliorer des résultats de traitement. GutFeelingKB peut servir de contrôle sain aux études regardant le microbiome humain.

Pour compiler leur base de données, l'organisme de recherche a génétiquement ordonnancé 48 échantillons fécaux provenant de 16 participants en bonne santé recrutés à Washington, C.C, en plus d'employer 50 échantillons metagenomic fécaux téléchargés du projet humain de Microbiome des personnes également interviewées comme en bonne santé. Des 157 organismes décrits en GutFeelingKB, 20% étaient des clostridium, 19% étaient Bacterioidia, 17% étaient Bifidobacteriales, 14% étaient Enterobacterales et du phylum Firmicutes 20% étaient des clostridium et 14% étaient Lactobacillales -- toutes les classes des bactéries ont trouvé en nourritures probiotic comme le yaourt. L'équipe de recherche a noté que 84 organismes étaient courants à tous les échantillons, indiquant que ce groupe de bactéries peut être substance de faisceau pour l'intestin humain.

La recherche a été supportée par des concessions du National Science Foundation, le programme clinique et de translation de récompenses de la Science au centre national pour avancer les sciences de translation, le McCormick génomique et centre de Proteomic, et l'institut de translation clinique de la Science (CTSI) au gw et des enfants nationaux à Washington, caractéristique de séquence de D.C. Raw ont été produits chez KamTek, Inc. avec l'évaluation subventionnée utilisant des instruments de MiSeq Illumina à l'université de Montgomery à Rockville, le Maryland.

« Cette étude explique le pouvoir de la science d'équipe multidisciplinaire d'avancer la recherche de translation comme cette équipe fait participer des collègues de l'autre côté des institutions multiples, des disciplines et des écoles dans le gw, » a dit Keith A. Crandall, PhD, Co-fil d'informatique sur la concession de CTSI, co-auteur, et directeur de l'institut de bio-informatique à l'école d'institut de Milken de la santé publique au gw. « Le GutFeelingKB fournit un modèle fondamental et une caractéristique initiale pour commencer à comprendre la diversité du microbiome sain d'intestin, qui est un élément clé de n'importe quelle étude essayant de trouver la maladie liée aux modifications de microbiome. »

En plus de produire GutFeelingKB, l'organisme de recherche publié un état fécal nouvel de population de biome, connu sous le nom de FecalBiome, qui a la capacité clinique. La boîte de FecalBiome aident des médecins à comparer le microbiome d'un patient aux microbiomes des personnes en bonne santé, leur permettant d'évaluer mieux l'efficacité des greffes fécales et d'autres produits de microbiome. L'équipe de recherche a également développé une matrice d'enregistrement de prototype pour que les médecins retransmettent l'information aux patients.

La « exposition des échanges métaboliques complexes entre les substances microbiennes d'intestin et leurs hôtes humains a des implications énormes pour une grande variété d'états de santé, probablement même nos modes. Le microbiome peut-il « être ajusté » pour augmenter les populations bactériennes avantageuses ? Comment notre régime affecte-t-il cet ajustement ? Nous sommes excités cette base de connaissances nous laisserons mesurer ces commandes des vitesses et les associer à la santé des personnes, » a dit Hiroki Morizono, PhD, Co-fil d'informatique sur la concession de CTSI, le co-auteur, directeur de l'informatique biomédicale aux enfants nationaux et le professeur de recherches d'associé de la génomique et le médicament et la pédiatrie de précision aux sciences d'École de Médecine et de santé de gw.