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I ricercatori pubblicano il profilo microbico per supportare il campo crescente della ricerca dell'intestino

Ci sono 157 organismi che formano il bioma del riferimento di un intestino umano sano, secondo la ricerca pubblicata nel giornale PLOS UNO dai ricercatori all'università di George Washington (GW). Il profilo microbico del riferimento, chiamato GutFeelingKB, può essere ampliato a 863 organismi se i proteomes strettamente connessi sono considerati. Questi informazioni serviranno da indice bibliografico per medici, pazienti e ricercatori, danti loro un'idea di cui un microbiome umano “normale„ assomiglia.

Il più che impariamo circa il microbiome umano, il più impariamo di sua importanza alla nostra salubrità. Conoscere a cui un intestino umano sano assomiglia è critico da ricercare che informerà come diagnosticare, trattare ed impedire le emissioni con il microbiome.„

Raja Mazumder, PhD, co-author e professore di biochimica e di medicina molecolare alle scienze della scuola di medicina e di salubrità di GW

Questa conoscenza completa dei tipi e dei rapporti di microbi che abitano nell'intestino umano sano è necessaria prima che qualunque genere di studio preclinico o clinico possa essere eseguito. È egualmente importante per i ricercatori che guardano per trovare i modi alterare il microbiome, trattare una circostanza, o migliorare un risultato di terapia. GutFeelingKB può servire da controllo sano per gli studi che esaminano il microbiome umano.

Per compilare il loro database, il gruppo di ricerca geneticamente ha ordinato 48 campioni fecali da 16 partecipanti in buona salute reclutati in Washington, DC, oltre a usando 50 campioni metagenomic fecali scaricati dal progetto umano Microbiome dalle persone anche schermate come in buona salute. Dei 157 organismi descritti in GutFeelingKB, 20% erano clostridi, 19% erano Bacterioidia, 17% erano Bifidobacteriales, 14% erano Enterobacterales e dal filo Firmicutes 20% provenivano clostridi e 14% erano Lactobacillales -- tutte le classi di batteri hanno trovato in alimenti probiotici come yogurt. Il gruppo di ricerca ha notato che 84 organismi erano comuni a tutti i campioni, indicanti che questo gruppo di batteri può essere specie di memoria per l'intestino umano.

La ricerca è stata supportata dalle concessioni dal National Science Foundation, il programma clinico e di traduzione dei premi di scienza al centro nazionale per l'avanzamento delle scienze di traduzione, il McCormick genomica e centro di Proteomic e l'istituto di traduzione clinico di scienza (CTSI) al GW ed i bambini nazionali in Washington, dati di sequenza di D.C. Raw sono stati generati a KamTek, Inc. con la fissazione dei prezzi sovvenzionata facendo uso degli strumenti di MiSeq Illumina all'istituto universitario di Montgomery a Rockville, Maryland.

“Questo studio dimostra la potenza di scienza pluridisciplinare del gruppo avanzare la ricerca di traduzione come questo gruppo fa partecipare i colleghi dall'altro lato delle istituzioni multiple, discipline e banchi all'interno del GW,„ ha detto Keith A. Crandall, PhD, co-cavo dell'informatica sulla concessione di CTSI, co-author e Direttore dell'istituto di calcolo di biologia al banco dell'istituto di Milken della salute pubblica al GW. “Il GutFeelingKB fornisce un modello fondamentale ed i dati iniziali per cominciare a capire la diversità del microbiome sano dell'intestino, che è una componente chiave di tutto lo studio che prova a diagnosticare la malattia connessa con i cambiamenti del microbiome.„

Oltre a creare GutFeelingKB, il gruppo di ricerca ha pubblicato un rapporto fecale novello della popolazione del bioma, conosciuto come FecalBiome, che ha capacità clinica. La latta di FecalBiome aiuta i medici a confrontare il microbiome di un paziente ai microbiomes delle persone in buona salute, permettendoli di valutare meglio l'efficacia dei trapianti fecali e di altri prodotti del microbiome. Il gruppo di ricerca egualmente ha sviluppato un modello di segnalazione del prototipo affinchè i medici trasmetta le informazioni ai pazienti.

“Scoprire gli scambi metabolici complessi fra le specie microbiche dell'intestino ed i loro host umani ha implicazioni tremende per un'ampia varietà di stati di salute, possibilmente anche i nostri atteggiamenti. Può il microbiome “essere sintonizzato„ per aumentare le popolazioni batteriche utili? Come la nostra dieta pregiudica questa sintonizzazione? Siamo eccitati che questa base di conoscenze ci lascerà quantificare questi spostamenti e collegarli alle sanità,„ ha detto Hiroki Morizono, il PhD, il co-cavo sulla concessione di CTSI, il co-author, Direttore dell'informatica dell'informatica biomedica ai bambini nazionali e professore della ricerca del socio di genomica e medicina e la pediatria di precisione alle scienze della scuola di medicina e di salubrità di GW.