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Os pesquisadores publicam o perfil microbiano para apoiar o campo crescente da pesquisa do intestino

Há 157 organismos que formam o bioma da linha de base de um intestino humano saudável, de acordo com a pesquisa publicada no jornal PLOS UM por investigador na universidade de George Washington (GW). O perfil microbiano da linha de base, chamado GutFeelingKB, pode ser expandido a 863 organismos se os proteomes estreitamente relacionados são considerados. Esta informação servirá como uma lista de referência para doutores, pacientes, e pesquisadores, dando lhes uma ideia do que um microbiome humano “normal” olha como.

O mais que nós aprendemos sobre o microbiome humano, o mais nós aprendemos de sua importância a nossa saúde. Conhecer o que um intestino humano saudável olhe como é crítico para pesquisar que informará como diagnosticar, tratar, e impedir edições com o microbiome.”

Raja Mazumder, PhD, co-autor e professor da bioquímica e da medicina molecular nas ciências da Faculdade de Medicina e da saúde do GW

Este conhecimento detalhado dos tipos e das relações dos micróbios que habitam o intestino humano saudável é necessário antes que qualquer tipo do estudo pré-clínico ou clínico possa ser executado. É igualmente importante para os pesquisadores que olham para encontrar maneiras de alterar o microbiome, de tratar uma circunstância, ou de melhorar um resultado da terapia. GutFeelingKB pode servir como um controle saudável para os estudos que olham o microbiome humano.

Para compilar sua base de dados, o grupo de investigação arranjou em seqüência genetically 48 amostras fecais de 16 participantes saudáveis recrutados em Washington, C.C., além do que a utilização de 50 amostras metagenomic fecais transferidas do projecto humano de Microbiome dos indivíduos igualmente selecionados como saudáveis. Dos 157 organismos descritos em GutFeelingKB, 20% eram clostridium, 19% eram Bacterioidia, 17% eram Bifidobacteriales, 14% eram Enterobacterales e do filo Firmicutes 20% eram clostridium e 14% eram Lactobacillales -- todas as classes de bactérias encontraram em alimentos probióticos como o iogurte. A equipa de investigação notou que 84 organismos eram comuns a todas as amostras, indicando que este grupo de bactérias pode ser espécie do núcleo para o intestino humano.

A pesquisa foi apoiada por concessões do National Science Foundation, o programa clínico e Translational das concessões da ciência no centro nacional para avançar ciências Translational, o McCormick Genomic e centro de Proteomic, e o instituto Translational clínico da ciência (CTSI) no GW e as crianças nacionais em Washington, dados da seqüência de C.C. Cru foram gerados em KamTek, Inc. com fixação do preço subvencionada usando instrumentos de MiSeq Illumina na faculdade de Montgomery em Rockville, Maryland.

“Este estudo demonstra a potência da ciência multidisciplinar da equipe avançar a pesquisa translational como esta equipe envolve colegas através das instituições múltiplas, disciplinas e escolas dentro do GW,” disse Keith A. Crandall, PhD, co-chumbo da informática na concessão de CTSI, co-autor, e director do instituto computacional da biologia na escola do instituto de Milken da saúde pública no GW. “O GutFeelingKB fornece um modelo fundacional e uns dados iniciais para começar a compreender a diversidade do microbiome saudável do intestino, que é um componente-chave de todo o estudo que tenta detectar a doença associada com as mudanças do microbiome.”

Além do que a criação de GutFeelingKB, o grupo de investigação publicou um relatório fecal novo da população do bioma, conhecido como FecalBiome, que tem a capacidade clínica. A lata de FecalBiome ajuda médicos a comparar o microbiome de um paciente aos microbiomes de indivíduos saudáveis, permitindo que avaliem melhor a eficácia de transplantações fecais e de outros produtos do microbiome. A equipa de investigação igualmente desenvolveu um molde do relatório do protótipo para que os médicos retransmitam a informação aos pacientes.

“Descobrir as trocas metabólicas complexas entre espécies microbianas do intestino e seus anfitriões humanos tem implicações tremendas para uma grande variedade de normas sanitárias, possivelmente mesmo nossos humores. Pode o microbiome “ser ajustado” para aumentar populações bacterianas benéficas? Como nossa dieta afecta este ajustamento? Nós somos entusiasmado esta base de conhecimentos deixar-nos-emos determinar estas SHIFT e para relacioná-las à saúde humana,” disse Hiroki Morizono, PhD, co-chumbo na concessão de CTSI, co-autor da informática, director da informática biomedicável nas crianças nacionais e o professor da pesquisa do associado da genómica e a medicina e a pediatria da precisão nas ciências da Faculdade de Medicina e da saúde do GW.