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Los investigadores publican perfil microbiano para soportar el campo cada vez mayor de la investigación de la tripa

Hay 157 organismos que forman el bioma de la línea de fondo de una tripa humana sana, según la investigación publicada en el gorrón PLOS UNO por los investigadores en la universidad de George Washington (GW). El perfil microbiano de la línea de fondo, llamado GutFeelingKB, se puede desplegar a 863 organismos si se consideran los proteomes estrechamente vinculados. Esta información servirá como filete de referencia para los doctores, pacientes, y los investigadores, dándoles una idea de lo que parece un microbiome humano “normal”.

Cuanto más que aprendemos sobre el microbiome humano, más aprendemos de su importancia a nuestra salud. Conocer lo que parece una tripa humana sana es crítico investigar que informará a cómo diagnosticar, tratar, y prevenir entregas con el microbiome.”

Rajá Mazumder, doctorado, co-autor y profesor de la bioquímica y del remedio molecular en las ciencias de la Facultad de Medicina y de la salud del GW

Este conocimiento completo de los tipos y de las índices de los microbios que habitan la tripa humana sana es necesario antes de que cualquier clase de estudio preclínico o clínico pueda ser realizada. Es también importante para los investigadores que observan para encontrar maneras de alterar el microbiome, de tratar una condición, o de perfeccionar un resultado de la terapia. GutFeelingKB puede servir como mando sano para los estudios que observan el microbiome humano.

Para compilar su base de datos, el grupo de investigación genético ordenó 48 muestras fecales a partir de 16 participantes sanos reclutados en Washington, C.C., además de usar 50 muestras metagenomic fecales transferidas directamente del proyecto humano de Microbiome de los individuos también revisados como sanos. De los 157 organismos descritos en GutFeelingKB, los 20% eran clostridiums, los 19% eran Bacterioidia, los 17% eran Bifidobacteriales, los 14% eran Enterobacterales y del fílum Firmicutes los 20% eran clostridiums y los 14% eran Lactobacillales -- todas las clases de bacterias encontraron en comidas probióticas como el yogur. El equipo de investigación observó que 84 organismos eran comunes a todas las muestras, indicando que este grupo de bacterias puede ser especie de la base para la tripa humana.

La investigación fue soportada por concesiones del National Science Foundation, el programa clínico y de translación de las recompensas de la ciencia en el centro nacional para avance ciencias de translación, el McCormick Genomic y centro de Proteomic, y generaron al instituto de translación clínico (CTSI) de la ciencia en el GW y a los niños nacionales en Washington, datos de la serie de D.C. Raw en KamTek, Inc. con la tasación subvencionada usando los instrumentos de MiSeq Illumina en la universidad de Montgomery en Rockville, Maryland.

“Este estudio demuestra la potencia de la ciencia multidisciplinaria de las personas de avance la investigación de translación como estas personas implican a colegas de enfrente de las instituciones múltiples, las disciplinas y las escuelas dentro del GW,” dijo a Keith A. Crandall, doctorado, co-guía de la informática en la concesión de CTSI, co-autor, y director del instituto de cómputo de la biología en la escuela del instituto de Milken de la salud pública en el GW. “El GutFeelingKB ofrece un modelo fundacional y datos iniciales para comenzar a entender la diversidad del microbiome sano de la tripa, que es un componente clave de cualquier estudio que intenta descubrir la enfermedad asociada a los cambios del microbiome.”

Además de crear GutFeelingKB, el grupo de investigación publicó un parte fecal nuevo de la población del bioma, conocido como FecalBiome, que tiene capacidad clínica. La poder de FecalBiome ayuda a médicos a comparar el microbiome de un paciente a los microbiomes de individuos sanos, permitiendo que fijen mejor la eficacia de trasplantes fecales y de otros productos del microbiome. El equipo de investigación también desarrolló un patrón de la información del prototipo para que los médicos retransmitan la información a los pacientes.

La “destapadura de las cantinas metabólicas complejas entre las especies microbianas de la tripa y sus ordenadores principal humanos tiene enormes implicaciones para una amplia variedad de condiciones de salud, posiblemente incluso nuestros humores. ¿Se puede el microbiome “sintonizar” para aumentar las poblaciones bacterianas beneficiosas? ¿Cómo nuestra dieta afecta a esta sintonización? Nos excitan que esta base de conocimiento nos permitirá cuantificar estos movimientos y relacionarse los con la salud humana,” dijo a Hiroki Morizono, doctorado, co-guía en la concesión de CTSI, co-autor, director de la informática de la informática biomédica en los niños nacionales y profesor de la investigación del socio de la genómica y remedio y pediatría de la precisión en las ciencias de la Facultad de Medicina y de la salud del GW.