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Les chercheurs étudient les génomes typhoïdes des voyageurs de différentes parties du monde

Les typhus serovar d'enterica de salmonelle entraîne plus de 20 millions de cas de fièvre typhoïde tous les ans, et infecte d'une façon disproportionnée des enfants dans des pays de revenu inférieur et moyen. Maintenant, dans un papier publié dans les maladies tropicales négligées par PLOS, les chercheurs expliquent comment des caractéristiques courantes rassemblées par santé publique Angleterre (PHE) peuvent être employées pour gagner l'analyse dans la génomique de S. Typhi dans les pays autour du monde, fournissant un système de première alerte pour des dangers apparaissants tels que la résistance aux antibiotiques et les épidémies à l'étranger.

La fièvre typhoïde est une infection bactérienne qui peut écarter dans tout le fuselage. Sans traitement rapide, elle peut entraîner des complications sérieuses et peut être fatale. Là élèvent des préoccupations au sujet du multi-médicament S. Typhi résistant, avec différentes formes des bactéries montrant la résistance à différentes classes de médicaments. Utilisant le séquençage du génome entier (WGS), il est possible de prévoir la susceptibilité aux antibiotiques, mettant en valeur l'opportunité d'employer des technologies génomiques pour aviser des stratégies de demande de règlement. Cependant, dans les endroits où la fièvre typhoïde est endémique, l'isolement des bactéries et la confirmation d'hémoculture de l'infection ne sont pas par habitude exécutés

PHE effectue le contrôle de la salmonelle utilisant le séquençage du génome entier, parmi beaucoup d'autres bactéries, afin de fournir des diagnostics précis, trouver rapidement des manifestations et pour indiquer exactement l'émergence des dangers neufs. Pendant que la majorité de cas de S. Typhi en Angleterre sont acquises à l'étranger, la caractéristique fournit une source d'information riche pour peindre un tableau global des infections de S. Typhi. Dans les travaux récents, Danielle Ingle de l'université nationale australienne, et des collègues a analysé des caractéristiques entières de séquençage du génome de tous les isolats de S. Typhi envoyés à PHE entre avril 2014 et mars 2017, principalement dans les voyageurs retournant des régions à haut risque.

Les 533 isolats rassemblés par PHE au cours de la période de réflexion ont compris 449 cas dans lesquels course étrangère récente rapportée de patients à 26 pays. La majorité de la course rapportée de cas vers l'Asie du sud, en particulier Inde, Pakistan et Bangladesh. Le GT a indiqué 31 seuls génotypes de S. Typhi, bien que la majorité d'isolats (73,4%) ait appartenu à un sous-type des bactéries, qui a été recensé dans les cas avec la course à 15 pays. De façon générale, 24% d'isolats étaient multi-drogue S. Typhi résistant, et ceux ont été associés à la course à 10 pays en Afrique de l'ouest de l'Asie du sud, d'Afrique de l'Est et. Les chercheurs pouvaient recenser un certain nombre de tendances dans lesquelles les génotypes et les configurations de résistance au médicament étaient présents dans quels pays autour du monde, y compris le premier cas d'ESBL S. Typhi en Angleterre, d'un patient présentant la course vers le Pakistan ont décrit en 2018.

« Les caractéristiques entières de séquençage du génome présentées ici fournissent l'analyse dans la dynamique changeante de résistance antimicrobienne chez S. Typhi, » les chercheurs disent.

La santé publique Angleterre est un leader mondial en employant des technologies entières de séquençage du génome pour le contrôle courant de salmonelle. De façon excitée, cette étude montre que les caractéristiques maintenant produit par habitude par PHE et d'autres laboratoires de santé publique pourraient servir de contrôle génomique de sentinelle aux pays typhoïde-endémiques qui manquent actuel des programmes locaux formels de contrôle, fournissant des données de valeur sur les tensions et la résistance antimicrobienne qui pourraient aider la gestion de la maladie locale. »

Professeur Kathryn Holt

« Le contrôle génomique courant des agents pathogènes des voyageurs qui ont acquis leur infection à l'étranger nous permet de gagner l'analyse dans quelles tensions diffusent dans différentes parties du monde. Ceci fournit un système de première alerte contre des dangers apparaissants comprenant ceux posés par les organismes résistants antimicrobiens. Notre technologie peut également jouer un rôle majeur pour manifestations de rail de source de futures dans les pays étrangers, aidant à guider le conseil de la santé public pour des voyageurs, » M. ajouté Tim Dallman.

Source:
Journal reference:

Ingle, D.J. et al. (2019) Informal genomic surveillance of regional distribution of Salmonella Typhi genotypes and antimicrobial resistance via returning travellers. PLOS Neglected Tropical Diseases. doi.org/10.1371/journal.pntd.0007620.

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