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I ricercatori studiano i genoma tifoidi dei viaggiatori dalle parti differenti del mondo

I tifo serovar di enterica della salmonella causa ogni anno più di 20 milione casi di febbre tifoide e sproporzionatamente infetta i bambini nei paesi di reddito medio e di minimo. Ora, in un documento pubblicato nelle malattie tropicali trascurate PLOS, i ricercatori dimostrano come i dati sistematici raccolti dalla salute pubblica Inghilterra (PHE) possono essere usati per guadagnare la comprensione nella genomica di S. il Typhi in paesi intorno al mondo, fornente un sistema di allarme per le minacce emergenti quali gli scoppi di malattia e di resistenza a antibiotici all'estero.

La febbre tifoide è un'infezione batterica che può spargersi in tutto l'organismo. Senza trattamento rapido, può causare le complicazioni serie e può essere interna. Sta coltivando le preoccupazioni circa la multi-droga S. il Typhi resistente, con differenti moduli dei batteri che mostrano la resistenza alle classi differenti di droghe. Facendo uso di intero sequenziamento del genoma (WGS), è possibile predire la predisposizione agli antibiotici, evidenzianti l'opportunità di usare le tecnologie genomiche per informare le strategie del trattamento. Tuttavia, nelle aree dove la febbre tifoide è endemica, l'isolamento dei batteri e la conferma dell'emocoltura dell'infezione non sono eseguiti ordinariamente

PHE effettua la sorveglianza della salmonella facendo uso di intero sequenziamento del genoma, fra molti altri batteri, per fornire le diagnosi accurate, individuare rapido gli scoppi e segnare l'emergenza con esattezza di nuove minacce. Mentre la maggior parte dei casi di S. il Typhi in Inghilterra si acquista all'estero, i dati forniscono una fonte di informazione ricca per dipingere una maschera globale delle infezioni di S. il Typhi. Nel lavoro recente, Danielle Ingle dell'Australian National University e colleghi ha analizzato gli interi dati di sequenziamento del genoma da tutti gli isolati di S. il Typhi inviati a PHE fra aprile 2014 e marzo 2017, soprattutto in viaggiatori che ritornano dalle regioni ad alto rischio.

I 533 isolati raccolti da PHE durante il periodo di studio hanno incluso 449 casi in cui i pazienti hanno riferito il viaggio non Xeros recente a 26 paesi. La maggior parte dei casi ha riferito il viaggio ad Asia del Sud, specialmente India, Pakistan e Bangladesh. Il gruppo di lavoro ha rivelato 31 genotipo unico di S. il Typhi, sebbene la maggior parte degli isolati (73,4%) appartenesse ad un sottotipo dei batteri, che è stato identificato nei casi con il viaggio a 15 paesi. In generale, 24% degli isolati erano multidrug S. il Typhi resistente e quelli sono stati associati con il viaggio a 10 paesi Asia del Sud, in Africa orientale ed in Africa occidentale. I ricercatori potevano identificare una serie di tendenze in cui i genotipi ed i reticoli di farmacoresistenza erano presenti in quali paesi intorno al mondo, compreso il primo caso di ESBL S. il Typhi in Inghilterra, da un paziente con il viaggio nel Pakistan hanno descritto nel 2018.

“Gli interi dati di sequenziamento del genoma presentati qui forniscono la comprensione nel cambiamento della dinamica antimicrobica della resistenza presso S. il Typhi,„ i ricercatori dicono.

La salute pubblica Inghilterra è un leader mondiale nel usando le intere tecnologie di sequenziamento del genoma per la sorveglianza sistematica della salmonella. Emozionantemente, questo studio mostra che i dati ora che sono generati ordinariamente da PHE e da altri laboratori di salute pubblica potrebbero servire da sorveglianza genomica della sentinella per i paesi di tifoide-endemico che corrente mancano dei programmi locali convenzionali di sorveglianza, fornenti informazioni apprezzate sugli sforzi e sulla resistenza antimicrobica che potrebbero aiutare la gestione locale di malattia.„

Il professor Kathryn Holt

“La sorveglianza genomica sistematica degli agenti patogeni dai viaggiatori che hanno acquistato la loro infezione all'estero permette che noi guadagniamo la comprensione in che sforzi stanno circolando nelle parti differenti del mondo. Ciò fornisce un sistema di allarme contro le minacce emergenti compreso quelli posati dagli organismi resistenti antimicrobici. La nostra tecnologia può anche svolgere un ruolo importante per gli scoppi futuri tenenti la carreggiata di sorgente in paesi stranieri, contribuente a guidare il consiglio di salute pubblica per i viaggiatori,„ Dott. aggiunto Tim Dallman.

Source:
Journal reference:

Ingle, D.J. et al. (2019) Informal genomic surveillance of regional distribution of Salmonella Typhi genotypes and antimicrobial resistance via returning travellers. PLOS Neglected Tropical Diseases. doi.org/10.1371/journal.pntd.0007620.

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