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Os pesquisadores estudam genomas tifóides dos viajantes das partes diferentes do mundo

Os tifos serovar do enterica das salmonelas causam mais de 20 milhão casos da febre tifóide todos os anos, e contaminam desproporcionalmente crianças em países do ponto baixo e do salário médio. Agora, em um papel publicado em doenças tropicais negligenciadas PLOS, os pesquisadores demonstram como os dados rotineiros recolhidos pela saúde pública Inglaterra (PHE) podem ser usados para ganhar em todo o mundo a introspecção na genómica de S. Tifo nos países, fornecendo um sistema de alerta rápida para ameaças emergentes tais como manifestações antibióticas da resistência e da doença no exterior.

A febre tifóide é uma infecção bacteriana que possa espalhar durante todo o corpo. Sem tratamento alerta, pode causar complicações sérias e pode ser fatal. Está crescendo interesses sobre a multi-droga S. resistente Tifo, com formulários diferentes das bactérias que mostram a resistência às classes diferentes de drogas. Usando o genoma inteiro que arranja em seqüência (WGS), é possível prever a susceptibilidade aos antibióticos, destacando a oportunidade de usar tecnologias genomic para informar estratégias do tratamento. Contudo, nas áreas onde a febre tifóide é endémico, a confirmação do isolamento das bactérias e da cultura do sangue da infecção não é executada rotineiramente

PHE realiza a fiscalização das salmonelas usando o genoma inteiro que arranja em seqüência, entre muitas outras bactérias, a fim fornecer diagnósticos exactos, detectar ràpida manifestações e localizar a emergência de ameaças novas. Enquanto a maioria dos exemplos de S. Tifo em Inglaterra é adquirida no exterior, os dados fornecem uma fonte de informação rica para pintar uma imagem global de infecções de S. Tifo. Na nova obra, Danielle Ingle da universidade de nacional australiano, e colegas analisou o genoma inteiro que arranja em seqüência dados de todos os isolados de S. Tifo enviados a PHE entre abril de 2014 e março de 2017, primeiramente nos viajantes que retornam das regiões do risco elevado.

Os 533 isolados recolhidos por PHE durante o período do estudo incluíram 449 casos em que os pacientes relataram o curso estrangeiro recente a 26 países. A maioria dos casos relatou o curso a 3Sul da Ásia, particularmente Índia, a Paquistão e a Bangladesh. O WGS revelou 31 genótipo originais de S. Tifo, embora a maioria dos isolados (73,4%) pertencesse a um subtipo das bactérias, que foi identificado nos casos com curso a 15 países. Totais, 24% dos isolados eram multidrug S. resistente Tifo, e aqueles foram associados com o curso a 10 países em 3Sul da Ásia, em East Africa e em África ocidental. Os pesquisadores podiam identificar um número de tendências em que os genótipo e os testes padrões da resistência de droga estaram presente em que países em todo o mundo, incluindo o primeiro exemplo de ESBL S. Tifo em Inglaterra, de um paciente com curso a Paquistão descreveram em 2018.

“O genoma inteiro que arranja em seqüência os dados apresentados aqui fornece a introspecção em mudar a dinâmica antimicrobial da resistência dentro de S. Tifo,” os pesquisadores dizem.

A saúde pública Inglaterra é um líder mundial em usar o genoma inteiro que arranja em seqüência tecnologias para a fiscalização rotineira das salmonelas. Emocionantemente, este estudo mostra que os dados agora que estão sendo gerados rotineiramente por PHE e por outros laboratórios da saúde pública poderiam servir como a fiscalização genomic da sentinela para os países tifóide-endémicos que faltam actualmente os programas locais formais da fiscalização, fornecendo a informação valiosa nas tensões e na resistência antimicrobial que poderiam ajudar a gestão local da doença.”

Professor Kathryn Holt

“A fiscalização genomic rotineira dos micróbios patogénicos dos viajantes que adquiriram sua infecção no exterior permite que nós ganhem a introspecção em que tensões estão circulando em partes diferentes do mundo. Isto fornece um sistema de alerta rápida contra as ameaças emergentes que incluem aquelas levantadas por organismos resistentes antimicrobiais. Nossa tecnologia pode igualmente jogar um papel importante para manifestações futuras de seguimento da fonte nos países estrangeiros, ajudando a guiar o conselho da saúde pública para viajantes,” Dr. adicionado Tim Dallman.

Source:
Journal reference:

Ingle, D.J. et al. (2019) Informal genomic surveillance of regional distribution of Salmonella Typhi genotypes and antimicrobial resistance via returning travellers. PLOS Neglected Tropical Diseases. doi.org/10.1371/journal.pntd.0007620.

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