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Uc San Diego a attribué la concession de NIMH pour produire des archives de caractéristiques de Neuroelectromagnetic et usine le moyen

L'Université de Californie San Diego a été attribuée $4,6 millions de l'institut national de la santé mentale (NIMH) pour produire les archives de caractéristiques de Neuroelectromagnetic et usine le moyen (NEMAR). Le projet est une partie de l'initiative de CERVEAU, un partenariat entre le secteur public et le secteur privé financé par les instituts de la santé nationaux. NEMAR sera une collaboration entre le centre de Swartz de l'université pour la neurologie de calcul à l'institut pour le calcul neural et le centre de superordinateur de San Diego (SDSC), et le centre de l'Université de Stanford pour la neurologie reproductible.

Scott Makeig, directeur du centre de Swartz pour la neurologie de calcul, est l'investigateur principal (PI) sur la concession. Arnaud Delorme, scientifique de projet au centre de Swartz, et Amitava Majumdar, directeur de la division calculante scientifique Caractéristique-Activée de SDSC, sont Co-PIs à côté de Russell Poldrack, le professeur de psychologie de Lang de rayon d'Albert à l'Université de Stanford.

Est ce niveau de collaboration multidisciplinaire tranchante de recherches pour ce qu'Uc San Diego est connu. NEMAR a le potentiel d'approfondir l'étendue de la science de caractéristiques, de la recherche clinique et des soins aux patients. La combinaison des compétences et de l'analyse des neurologistes et des informaticiens est une voie que nous avançons les frontières de la connaissance et découvrons des voies neuves d'améliorer des durées partout. »

Pradeep K. Khosla, chancelier

NEMAR agira en tant que portail ou passerelle aux archives de caractéristiques d'OpenNeuro produites par Poldrack et son équipe. OpenNeuro est un libre et une plate-forme extérieure qui permet à des chercheurs de télécharger et partager des caractéristiques neuroimaging. Des ensembles de données soumis peuvent alors s'analyser par n'importe qui qui ouvre une session. OpenNeuro a été montré par le NIMH comme dépôt pour des caractéristiques rassemblées des projets initiatiques de CERVEAU ainsi que d'autres types de caractéristiques neuroimaging humaines ; cependant, jusqu'à présent les flux de travail existent seulement pour des caractéristiques de fMRI. Ceci signifie que même si d'autres types d'échographies de cerveau ont été téléchargés à OpenNeuro, il n'y a aucune infrastructure en place pour l'analyse de caractéristiques.

NEMAR établira l'infrastructure et les outils nécessaires pour ajouter l'imagerie cérébrale neuroelectromagnetic humaine aux archives, y compris EEG (électroencéphalographie) et ses homologues magnétiques, mégohm (magnéto-encéphalographie). Cette caractéristique de cerveau sera téléchargée par le portail de NEMAR à SDSC. Après que le logiciel de NEMAR évalue la qualité des caractéristiques et la complétude de sa documentation, on l'ajoutera aux archives d'OpenNeuro.

Le projet fournira également des outils de visualisation de caractéristiques pour des usagers d'OpenNeuro. Pour faire ceci, NEMAR utilisera la passerelle de neurologie (NSG), actionnée par l'environnement extrême fondation Fondation de découverte du scientifique et technique de la Science nationale (XSEDE), un réseau national des superordinateurs et d'autres calcul haute performance et compétences. SDSC est à la maison à la comète, à un superordinateur de petascale capable d'environ 2 fonctionnements de quadrillion par seconde et à une partie du programme de XSEDE.

À l'avenir, les usagers du NSG peuvent également pouvoir travailler sur des caractéristiques d'OpenNeuro mis en communication aux moyens du XSEDE de SDSC par l'intermédiaire d'un tuyau élevé de largeur de bande entre SDSC et fournisseurs commerciaux de nuage tels qu'Amazone, où la caractéristique d'OpenNeuro demeure maintenant. Alternativement, une copie des caractéristiques neuroelectromagnetic archivées dans OpenNeuro peut être enregistrée à SDSC pour faciliter une transformation plus ultérieure.

Des flux de données téléchargés par la passerelle seront uniformément formatés utilisant des OFFRES (norme de caractéristiques d'imagerie cérébrale) et des normes comprises de HED (descripteur hiérarchique d'événement). Cette uniformité permettra à des chercheurs d'appliquer des approches statistiques neuves d'apprentissage automatique pour découvrir les configurations cachées qui peuvent être trouvées seulement par la recherche en travers d'un grand nombre de caractéristiques, menant vraisemblablement aux analyses neuves dans la recherche fondamentale et clinique de cerveau.

L'organisme des caractéristiques de neurologie, connu sous le nom de neuro-informatique, est un domaine de la recherche relativement neuf qui des soins grands d'hospitalisé de promesse de prises. Avec assez de caractéristiques analysables, les chercheurs peuvent pouvoir extraire des biomarqueurs robustes tenant compte du diagnostic et de la demande de règlement précis des troubles neurologiques.

Makeig est excité au sujet de l'extension potentielle de ce projet, indiquant, « NEMAR nous aidera à apprendre plus au sujet de la façon dont la pensée et l'action de support de dynamique de cerveau, et peuvent pour cette raison être un catalyseur pour la science du cerveau de avancement et la recherche clinique de cerveau. »