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Uc San Diego concedeu a concessão de NIMH para criar o ficheiro dos dados de Neuroelectromagnetic e utiliza ferramentas o recurso

A Universidade da California San Diego foi concedida $4,6 milhões do instituto nacional da saúde mental (NIMH) para criar o ficheiro dos dados de Neuroelectromagnetic e utiliza ferramentas o recurso (NEMAR). O projecto é uma parte da iniciativa do CÉREBRO, uma parceria público-privado financiada através dos institutos de saúde nacionais. NEMAR será uma colaboração entre o centro do Swartz da universidade para a neurociência computacional no instituto para a computação neural e o centro do super-computador de San Diego (SDSC), e o centro da Universidade de Stanford para a neurociência reprodutível.

Scott Makeig, director do centro de Swartz para a neurociência computacional, é o investigador principal (PI) na concessão. Arnaud Delorme, cientista do projecto no centro de Swartz, e Amitava Majumdar, director da divisão de computação científica Dados-Permitida de SDSC, são co-PIs ao lado de Russell Poldrack, professor de Lang da raia de Albert de psicologia na Universidade de Stanford.

Este nível de colaboração multidisciplinar pioneiro da pesquisa é o que Uc San Diego é conhecido para. NEMAR tem o potencial aprofundar o espaço da ciência dos dados, da pesquisa clínica e do assistência ao paciente. Combinar a experiência e a introspecção dos neurocientistas e dos cientistas de computador é uma maneira que nós estamos avançando as fronteiras do conhecimento e estamos descobrindo maneiras novas de aumentar em toda parte vidas.”

Pradeep K. Khosla, chanceler

NEMAR actuará como um portal ou um Gateway ao ficheiro dos dados de OpenNeuro criado por Poldrack e por sua equipe. OpenNeuro é uma plataforma livre e aberta que permita que os pesquisadores transfiram ficheiros pela rede e compartilhem de dados neuroimaging. Os conjunto de dados submetidos podem então ser analisados por qualquer um que entra. OpenNeuro foi designado pelo NIMH como um repositório para os dados recolhidos dos projectos da iniciativa do CÉREBRO assim como dos outros tipos de dados neuroimaging humanos; contudo, até agora os trabalhos existem somente para dados do fMRI. Isto significa que mesmo se outros tipos de varreduras de cérebro foram transferidos ficheiros pela rede a OpenNeuro, não há nenhuma infra-estrutura no lugar para a análise de dados.

NEMAR construirá a infra-estrutura e as ferramentas necessárias adicionar a imagem lactente de cérebro neuroelectromagnetic humana ao ficheiro, incluindo o EEG (electroencefalografia) e suas contrapartes magnéticas, megohm (encefalografía magnética). Estes dados do cérebro serão transferidos ficheiros pela rede através do portal de NEMAR a SDSC. Depois que o software de NEMAR avalia a qualidade dos dados e a integralidade de sua documentação, adicionar-se-á ao ficheiro de OpenNeuro.

O projecto igualmente fornecerá ferramentas do visualização dos dados para usuários de OpenNeuro. Para fazer este, NEMAR usará o Gateway da neurociência (NSG), operado com ciência nacional o ambiente extremo Fundação-financiado da descoberta da ciência e da engenharia (XSEDE), uma rede nacional dos super-computadores e o outro informática de alto rendimento e experiência. SDSC é home ao cometa, a um super-computador do petascale capaz de um 2 por segundo das operações do quadrillion e à parte do programa de XSEDE.

No futuro, os usuários do NSG podem igualmente poder trabalhar em dados de OpenNeuro movidos aos recursos do XSEDE de SDSC através de uma tubulação alta da largura de faixa entre SDSC e fornecedores comerciais da nuvem tais como as Amazonas, onde os dados de OpenNeuro residem agora. Alternativamente, uma cópia dos dados neuroelectromagnetic arquivados em OpenNeuro pode ser armazenada em SDSC para facilitar uma transformação mais ulterior.

Os córregos de dados transferidos ficheiros pela rede através do Gateway serão formatados uniformemente usando OFERTAS (padrão dos dados da imagem lactente de cérebro) e padrões incluídos de HED (descritor hierárquico do evento). Esta uniformidade permitirá que os pesquisadores apliquem aproximações deaprendizagem estatísticas novas para descobrir os testes padrões escondidos que podem ser encontrados somente procurarando através das grandes quantidades de dados, conduzindo provavelmente às introspecções novas na pesquisa básica e clínica do cérebro.

A organização de dados da neurociência, conhecida como a neuroinformática, é um campo de pesquisa relativamente novo que mantem a grande promessa dentro - assistência ao paciente. Com bastante dados analizáveis, os pesquisadores podem poder extrair biomarkers robustos permitindo o diagnóstico e o tratamento precisos de desordens neurológicas.

Makeig é entusiasmado sobre o alcance potencial deste projecto, indicando, “NEMAR ajudar-nos-á a aprender mais sobre como a dinâmica do cérebro apoia o pensamento e a acção, e pode conseqüentemente ser um catalizador para a ciência de cérebro de avanço e a pesquisa clínica do cérebro.”