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Uc San Diego concedió la concesión de NIMH para crear el archivo de los datos de Neuroelectromagnetic y trabaja con herramienta el recurso

La Universidad de California San Diego se ha concedido $4,6 millones del instituto nacional de la salud mental (NIMH) para crear el archivo de los datos de Neuroelectromagnetic y trabaja con herramienta el recurso (NEMAR). El proyecto es una parte de la iniciativa del CEREBRO, una sociedad pública-privado financiada a través de los institutos de la salud nacionales. NEMAR será una colaboración entre el centro de Swartz de la universidad para la neurología de cómputo en el instituto para el cómputo de los nervios y el centro del superordenador de San Diego (SDSC), y el centro de la Universidad de Stanford para la neurología reproductiva.

Scott Makeig, director del centro de Swartz para la neurología de cómputo, es el investigador principal (PI) en la concesión. Arnaldo Delorme, científico del proyecto en el centro de Swartz, y Amitava Majumdar, director de la división que calcula científica Dato-Habilitada de SDSC, son co-PIs junto a Russell Poldrack, el profesor de Albert Ray Lang de la psicología en la Universidad de Stanford.

Este nivel de colaboración multidisciplinaria punta de la investigación es para lo que se conoce Uc San Diego. NEMAR tiene el potencial de profundizar la extensión de la ciencia de los datos, de la investigación clínica y de la atención a los pacientes. Combinar la experiencia y el discernimiento de neurólogos y de informáticos es una manera que estamos avance las fronteras del conocimiento y que estamos descubriendo nuevas maneras de aumentar vidas por todas partes.”

Pradeep K. Khosla, canciller

NEMAR actuará como un portal o Gateway al archivo de los datos de OpenNeuro creado por Poldrack y sus personas. OpenNeuro es una plataforma libre y abierta que permite que los investigadores carguen por teletratamiento y que compartan datos neuroimaging. Los grupos de datos sometidos se pueden entonces analizar por cualquier persona que abra una sesión. OpenNeuro ha sido señalado por el NIMH como depósito para los datos cerco de proyectos preliminares del CEREBRO así como de otros tipos de datos neuroimaging humanos; sin embargo, hasta la fecha los flujos de trabajo existen solamente para los datos del fMRI. Esto significa que incluso si otros tipos de exploraciones de cerebro fueron cargados por teletratamiento a OpenNeuro, no hay infraestructura en el lugar para el análisis de datos.

NEMAR construirá la infraestructura y las herramientas necesarias agregar imágenes cerebrales neuroelectromagnetic humanas al archivo, incluyendo EEG (electroencefalografía) y sus contrapartes magnéticas, megohmio (magnetoencefalografía). Estos datos del cerebro serán cargados por teletratamiento a través del portal de NEMAR a SDSC. Después de que el software de NEMAR evalúe la calidad de los datos y lo completo de su documentación, será agregado al archivo de OpenNeuro.

El proyecto también ofrecerá las herramientas de la visualización de los datos para los utilizadores de OpenNeuro. Para hacer esto, NEMAR utilizará el Gateway de la neurología (NSG), operado con el ambiente extremo Asiento-financiado ciencia nacional del descubrimiento de la ciencia y de la ingeniería (XSEDE), la red nacional de superordenadores y el otro ordenador de alto rendimiento y experiencia. SDSC es casero al cometa, a un superordenador del petascale capaz de unas 2 operaciones del cuatrillón por segundo y a la parte del programa de XSEDE.

En el futuro, los utilizadores del NSG pueden también poder trabajar en los datos de OpenNeuro virados hacia el lado de babor a los recursos del XSEDE de SDSC vía un alto tubo de la anchura de banda entre SDSC y los proveedores comerciales de la nube tales como Amazonas, en donde ahora residen los datos de OpenNeuro. Alternativamente, una copia de los datos neuroelectromagnetic archivados en OpenNeuro se puede salvar en SDSC para facilitar la transformación posterior.

Las secuencias de datos cargadas por teletratamiento a través del Gateway serán formatadas uniformemente usando las OFERTAS (patrón de los datos de las imágenes cerebrales) y los patrones incluidos de HED (descriptor jerárquico de la acción). Esta uniformidad permitirá que los investigadores apliquen nuevas aproximaciones de máquina-aprendizaje estadísticas para destapar las configuraciones ocultadas que pueden ser encontradas solamente explorando a través de una gran cantidad de datos, llevando probablemente a los nuevos discernimientos en la investigación básica y clínica del cerebro.

La organización de los datos de la neurología, conocida como neuroinformática, es relativamente un nuevo campo de la investigación que celebra gran cuidado el hospitalizado de la promesa. Con suficiente datos analizables, los investigadores pueden poder extraer biomarkers robustos teniendo en cuenta la diagnosis y el tratamiento exactos de desordenes neurológicos.

Makeig se excita sobre el alcance potencial de este proyecto, declarando, “NEMAR nos ayudará a aprender más sobre cómo las dinámicas del cerebro soportan pensamiento y la acción, y puede por lo tanto ser un catalizador para la ciencia de cerebro de avance y la investigación clínica del cerebro.”