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La bactérie africaine résiste à presque tous les médicaments

Il ressemble à lui est temps de payer le joueur de pipeau. La première considérable tension (XDR) résistant à la drogue de salmonella typhimurium, ST313 le sublineage appelé II.1, a survenu au République démocratique du Congo (transporteur). Ceci ne réagit pas les antibiotiques l'uns des qui sont utilisés généralement dans le transporteur, excepté la ciprofloxacine. Et pour rendre des choses plus mauvaises, on a isolé un échantillon qui montre la réaction inachevée même à ce dernier médicament.

La bactérie

S. typhimurium, que beaucoup de chercheurs disent a provenu de l'Afrique Subsaharienne il y a quelques décennies, avait montré la résistance aux antibiotiques de plus en plus grande pendant les dernières décennies. Selon l'étude neuve qui indique l'émergence de cette tension neuve de S. typhimurium dans les transmissions de nature de tourillon le 19 septembre 2019, c'est un danger qui aura besoin de la coopération étroite des microbiologistes, généticiens, et les épidémiologistes, en plus des cliniciens et d'autres spécialistes, s'il doit être recensé et réglé dans l'emplacement différent.

Bactérie Salmonelle. Typhus de S., S. typhimurium et toute autre salmonelle, bactéries en forme de tige gramnégatives, 3D illustration - crédit d
Bactérie Salmonelle. Typhus de S., S. typhimurium et toute autre salmonelle, bactéries en forme de tige gramnégatives, 3D illustration - crédit d'illustration : Kateryna Kon/Shutterstock

La salmonelle est généralement connue pour entraîner l'intoxication alimentaire, cependant très inconfortable pas forcément potentiellement mortel. Cependant, les choses sont différentes quand il s'agit de tensions typhimurium et relatives de S., qui sont mieux connues pour entraîner deux-tiers d'infections de circulation sanguine dans cette région. En fait, ceux-ci ont gagné leur propre nom : salmonelloses non-typhoïdiques invasives (iNTS). Un tel affect d'infections presque 3,5 millions de personnes par année, et presque 700.000 mille personnes contactent leur mort cette voie - avec le danger le plus grand venant du S. typhimurium. La plus mauvaise chose est que les infections d'iNTS sont nombreuses dans les places mêmes qui ont la disponibilité la plus inférieure de la santé, d'un système mauvais équipé, et des concentrations faibles de l'immunité. Dans ces places, c'est les enfants au-dessous de 5 ans qui portent le choc.

La tension exacte de l'iNTS producteur typhimurium de S. dans cette région est type ST313, qui est connu pour être résistant aux médicaments. Ceci a également provoqué la lignée appelée I de deux variantes neuves et la lignée II, qui ont écarté indépendamment pour couvrir la majeure partie de l'Afrique, alimentée par deux facteurs : Prévalence de VIH et résistance de multi-drogue (MDR). Les infections de la lignée II sont maintenant la cause principale de l'iNTS.

Que le XDR signifie-t-il ?

Les agents pathogènes de MDR sont résistants à l'ampicilline, au triméthoprim/au sulfamethoxazole et au chloramphénicol. Ceci ne devrait pas produire un problème avec l'iNTS, qui est type traité avec de la ciprofloxacine d'antibiotique de fluoroquinolone. D'autre part, l'iNTS compliqué exige le ceftriaxone - mais ST313 la lignée II montre maintenant la présence des enzymes de bêta-lactamase de large spectre, que les moyens ils ne répondent pas à des céphalosporines plus neuves non plus, comme le ceftriaxone. Ceci adapte la définition du XDR pour des typhus de S., c.-à-d., résistants à cinq médicaments.

Augmenté, ceci signifie l'exposition MDR de bactéries avec la résistance aux deux médicaments de deuxième-line, ceftriaxones (par des enzymes de bêta-lactamase de large spectre), et azithromycines. Ceci laisse seulement les fluoroquinolones. Cependant, un échantillon a été déjà isolé qui n'est pas susceptible du ce non plus - un agent pathogène carter-résistant. Cette tension en évolution, la lignée aboubée II.1, est responsable de plus de 10% d'isolats dans la pièce centrale du transporteur.

Modifications invasives neuves

Inquiéter la partie est de venir encore. Est non seulement être de bactérie de plus en plus résistant à tous les antibiotiques, mais il est changeant vers devenir un agent pathogène primaire de circulation sanguine. Dans le premier cas, les chercheurs ont constaté qu'un plasmide unique a transporté tous les gènes de résistance. Un plasmide est un envoi de matériel génétique qui peut être transféré à partir de la cellule à la cellule. D'ailleurs, la tension neuve de la lignée II subit plusieurs changements, en son génome et de son comportement, que le moyen il devient de plus en plus engrené pour des infections de circulation sanguine - devenant « invasif », en d'autres termes.

Des caractéristiques invasives ont été trouvées dans des expériences de laboratoire ainsi que par l'utilisation novatrice des algorithmes d'apprentissage automatique. Ces techniques ont aidé à capter les configurations caractéristiques dans l'ADN qui indiquent quelles tensions deviennent invasives. Celles-ci comprennent moins de stimulation du système immunitaire d'hôte, du métabolisme inférieur, de la perte d'un type de flagelles et de la tendance plus grande de former des films biologiques.

Pourquoi est-ce que ceci s'est produit ?

Il pourrait être dû à la consommation excessive d'antibiotiques, dit l'étude. L'azithromycine était utilisée récemment dans une campagne de masse pour éliminer le trachome, une origine infectieuse de cécité, et également est considérable employée chez les enfants. Le plasmide trouvé dans des tensions de la lignée II a été précédemment trouvé dans l'autre S. iNTS-associé typhimurium.

Penser à l'avenir

Au cours de la dernière décennie, toutes les infections de circulation sanguine ont été mises sous le contrôle par deux agences, Institut National de Recherche Biomédicale (INRB) du transporteur et institut du médicament tropical (ITM) à Anvers. L'isolement courant des organismes causaux des patients en travers du pays a prouvé une aide grande en captant les premiers signes des infections de circulation sanguine avec cette tension de XDR de S. typhimurium. Avec des centaines de prises de sang rassemblées des patients dans le transporteur qui ont été soupçonnés pour avoir la sepsie, l'émergence de la résistance au médicament au S. typhimurium sur une commande jamais avant qu'imaginé devient claire. Les scientifiques ont mis en place un effort mondial pour tracer le développement continu de ST313, et pour évaluer sa résistance aux antibiotiques.

La bio-informatique devient plus importante pendant qu'elle aide à trouver ces signes de pouvoir envahissant. Le charron de Nicole de chercheur dit, « l'espoir est que dans un avenir proche nous pourrons déployer l'apprentissage automatique dans un rôle plus prévisionnel pour aider à contrôler l'émergence et la propagation des souches de bactéries résistant à la drogue telles que le S. typhimurium. »

Commentaires de professeur Gordon Dougan de Cambridge : Les « études comme ceci sont seules car nous effectuons la passerelle entre les problèmes de santé les plus importants observés dans les hôpitaux en travers du monde avec la recherche biologique en profondeur pour laquelle nous appliquons des technologies de tranchant. Les collaborations comme ceci sont clavette et seront importantes à l'avenir pour gagner d'autres analyses sur les maladies apparaissantes. »

Journal reference:

An African Salmonella typhimurium ST313 sublineage with extensive drug-resistance and signatures of host adaptation. Sandra Van Puyvelde, Derek Pickard, Koen Vandelannoote, Eva Heinz, Barbara Barbé, Tessa de Block, Simon Clare, Eve L. Coomber, Katherine Harcourt, Sushmita Sridhar, Emily A. Lees, Nicole E. Wheeler, Elizabeth J. Klemm, Laura Kuijpers, Lisette Mbuyi Kalonji, Marie-France Phoba, Dadi Falay, Dauly Ngbonda, Octavie Lunguya, Jan Jacobs, Gordon Dougan & Stijn Deborggraeve. Nature Communications, volume 10, Article number: 4280 (2019). https://doi.org/10.1038/s41467-019-11844-z. https://www.nature.com/articles/s41467-019-11844-z

Dr. Liji Thomas

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Dr. Liji Thomas

Dr. Liji Thomas is an OB-GYN, who graduated from the Government Medical College, University of Calicut, Kerala, in 2001. Liji practiced as a full-time consultant in obstetrics/gynecology in a private hospital for a few years following her graduation. She has counseled hundreds of patients facing issues from pregnancy-related problems and infertility, and has been in charge of over 2,000 deliveries, striving always to achieve a normal delivery rather than operative.

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