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I ricercatori di Johns Hopkins collegano un gene alla crescita del melanoma e si spargono

Facendo uso di piccoli RNA, microRNA 211 e strumenti noncoding che tengono la carreggiata la stabilità e la disintegrazione della proteina-codifica e del RNAs noncoding in celle laboratorio-crescenti del melanoma, un gruppo piombo da un ricercatore del centro del Cancro di Johns Hopkins Kimmel ha identificato le molecole altamente instabili del RNA nei melanomi umani, compreso un gene DUSP3 dell'obiettivo del romanzo miR-211.

I ricercatori di Johns Hopkins collegano un gene alla crescita del melanoma e si spargono
Credito: iStock

Ranjan J. Perera, Ph.D., professore associato dell'oncologia alla scuola di medicina di Johns Hopkins University e rapporto dei colleghi che facendo uso di una trascrizione specializzata che ordina il metodo ha chiamato BRIC-seguente, hanno identificato le trascrizioni altamente stabili ed instabili del gene del mRNA che partecipano alla crescita ed all'invasione delle cellule durante la progressione del melanoma. Un gene, la fosfatasi doppia 3 (DUSP3) di specificità, regolamenta le vie importanti di segnalazione del melanoma.

Hanno riferito il loro risultati 16 giugno nella biologia del RNA online.

La ricerca precedente in altri laboratori ha mostrato che DUSP3 è stato compreso nella progressione e nella diffusione di vari tipi del cancro, compreso cervicale, la prostata ed i cancri al seno. Il nuovo studio è creduto per essere il primo rapporto della sua partecipazione al melanoma ed il primo rapporto del suo regolamento da miR-211, i ricercatori conclude.

Il melanoma direzione ogni anno i 96.000 Americani stimati ed uccisioni circa 7.200, rendendogli il cancro di interfaccia più interno negli Stati Uniti, nella grande parte dovuto la sua natura aggressiva ed il suo potenziale riprodurrsi per metastasi. Perera dice che più lavoro è necessario capire la biologia anormale che è alla base della crescita e della diffusione del cancro e fornire i nuovi obiettivi potenziali per il trattamento.

Generalmente, Perera dice, approccio degli scienziati i loro studi sulla genetica del melanoma guardando per vedere quali prodotti della proteina e del gene sono alti o giù-regolamentati in celle del tumore rispetto ai progenitori normali dell'interfaccia. Invece, dice, “l'approccio della stabilità del transcriptome„ del suo gruppo esamina quanto tempo le cosiddette trascrizioni del gene -; le istruzioni molecolari del RNA che “sono lette„ da DNA prima della traduzione nelle proteine -; sopravviva a in celle del tumore prima che si degradino.

È importante da capire durante la progressione del tumore o di tumorigenesis come queste trascrizioni si comportano. Così abbiamo deciso di esaminare un angolo completamente nuovo della stabilità e della disintegrazione del RNA di genomewide durante i primi punti nello sviluppo del melanoma.„

Ranjan J. Perera, Ph.D., professore associato di oncologia, scuola di medicina di Johns Hopkins University

Altri ricercatori, Perera nota, hanno tentato di profilare la stabilità della trascrizione di genomewide usando i prodotti chimici che bloccano tutta la trascrizione e poi l'osservazione della stabilità delle trascrizioni che sono esistito prima del blocco. Questo metodo della mazza, tuttavia, è considerato sostanza tossica e può alterare altri aspetti di una biologia delle cellule nei modi che possono oscurare le informazioni della stabilità della trascrizione. Per indirizzare questo, Perera ed i colleghi hanno usato BRIC-seguente, un metodo che etichetta le trascrizioni con 5-Bromouridine, che è incorporato in RNAs recentemente sintetizzato e poi può immunocytochemically essere analizzato col passare del tempo senza disturbare il resto dell'ambiente cellulare.

In una linea cellulare del melanoma che manca normalmente di miR-211, i ricercatori hanno introdotto l'espressione miR-211 e poi hanno usato il metodo BRIC-seguente per studiare la dinamica della stabilità del transcriptome in presenza/assenza di miR-211. Poi hanno combinato questi risultati con i cambiamenti nei livelli globali di espressione genica ed hanno utilizzato gli strumenti di previsione di programma informatico per identificare gli obiettivi specifici del gene di miR-211, scoprenti l'obiettivo precedentemente non riferito DUSP3.

Come componente dei loro studi in corso, Perera ed i suoi colleghi egualmente stanno esaminando come miR-211 potrebbe pregiudicare altre trascrizioni del gene del melanoma nei modi che promuovono la metastasi e la resistenza del cancro a determinate droghe anticancro.

Source:
Journal reference:

Joshi, P. et al. (2019) Transcriptome stability profiling using 5’-bromouridine IP chase (BRIC-seq) identifies novel and functional microRNA targets in human melanoma cells. RNA Biology. doi.org/10.1080/15476286.2019.1629769.

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