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Os pesquisadores de Johns Hopkins ligam um gene ao crescimento da melanoma e espalham-no

Usando um RNA, um microRNA 211, e umas ferramentas noncoding pequenos que seguissem a estabilidade e a deterioração da proteína-codificação e do RNAs noncoding em pilhas laboratório-crescidas da melanoma, uma equipe conduzida por um pesquisador do centro do cancro de Johns Hopkins Kimmel identificou moléculas altamente instáveis do RNA nas melanoma humanas, incluindo um gene DUSP3 do alvo da novela miR-211.

Os pesquisadores de Johns Hopkins ligam um gene ao crescimento da melanoma e espalham-no
Crédito: iStock

Ranjan J. Perera, Ph.D., professor adjunto da oncologia na Faculdade de Medicina da Universidade Johns Hopkins, e relatório dos colegas que usando um transcrito especializado que arranja em seqüência o método chamou BRIC-segs., identificaram os transcritos altamente estáveis e instáveis do gene do mRNA que participam no crescimento e na invasão da pilha durante a progressão da melanoma. Um gene, fosfatase dupla 3 da especificidade (DUSP3), regula caminhos importantes da sinalização da melanoma.

Relataram seu resultados o 16 de junho na biologia do RNA em linha.

A pesquisa precedente em outros laboratórios mostrou que DUSP3 estêve envolvido na progressão e na propagação de vários tipos do cancro, em incluir cervical, na próstata e nos cancro da mama. O estudo novo é acreditado para ser o primeiro relatório de sua participação na melanoma e o primeiro relatório de seu regulamento por miR-211, os pesquisadores conclui.

A melanoma golpeia 96.000 americanos calculados todos os anos, e matanças aproximadamente 7.200, fazendo lhe o cancro de pele o mais fatal nos Estados Unidos, na grande parte devido a sua natureza agressiva e ao seu potencial reproduzir-se por metástese. Perera diz que mais trabalho é necessário compreender a biologia anormal que é a base do crescimento e da propagação do cancro, e fornecer alvos novos potenciais para o tratamento.

Geralmente, Perera diz, aproximação dos cientistas seus estudos da genética da melanoma olhando para ver que produtos do gene e da proteína são ascendentes ou para baixo-regulados nas pilhas do tumor comparadas com os ancestral normais da pele. Em lugar de, diz, do “a aproximação da estabilidade transcriptome” da sua equipe olha quanto tempo transcritos assim chamados do gene -; as instruções moleculars do RNA que “são lidas” do ADN antes de ser traduzida em proteínas -; sobreviva em pilhas do tumor antes que degradem.

É importante compreender durante a progressão do tumorigenesis ou do tumor como estes transcritos se comportam. Assim nós decidimos olhar um ângulo completamente novo da estabilidade e da deterioração do RNA do genomewide durante as primeiras etapas na revelação da melanoma.”

Ranjan J. Perera, Ph.D., professor adjunto da oncologia, Faculdade de Medicina da Universidade Johns Hopkins

Outros pesquisadores, Perera notam, tentaram perfilar a estabilidade do transcrito do genomewide usando os produtos químicos que obstruem toda a transcrição, e então observando a estabilidade dos transcritos que existiram antes de obstruir. Este método do malho, contudo, é considerado tóxico, e pode alterar outros aspectos de uma biologia de pilha nas maneiras que podem obscurecer a informação da estabilidade do transcrito. Para endereçar este, Perera e os colegas usaram BRIC-segs., um método que etiquetasse transcritos com o 5-Bromouridine, que é incorporado em RNAs recentemente sintetizado e então pode immunocytochemically ser analisado ao longo do tempo sem perturbar o resto do ambiente celular.

Em uma linha celular da melanoma que faltasse normalmente miR-211, os pesquisadores introduziram a expressão miR-211 e usaram então o método BRIC-segs. para investigar a dinâmica da estabilidade do transcriptome na presença/ausência de miR-211. Então combinaram estes resultados com as mudanças em níveis totais da expressão genética e usaram ferramentas da previsão do programa informático para identificar os alvos específicos do gene de miR-211, descobrindo o alvo previamente não-relatado DUSP3.

Como parte de seus estudos em curso, Perera e seus colegas igualmente estão olhando como miR-211 pôde afectar outros transcritos do gene da melanoma nas maneiras que promovem a metástase e a resistência do cancro a determinadas drogas anticancerosas.

Source:
Journal reference:

Joshi, P. et al. (2019) Transcriptome stability profiling using 5’-bromouridine IP chase (BRIC-seq) identifies novel and functional microRNA targets in human melanoma cells. RNA Biology. doi.org/10.1080/15476286.2019.1629769.

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