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Los investigadores de Johns Hopkins conectan un gen al incremento del melanoma y se extienden

Usando un pequeños ARN, microRNA 211, y herramientas noncoding que rastrean la estabilidad y la extinción de la proteína-codificación y del RNAs noncoding en células laboratorio-crecidas del melanoma, las personas llevadas por un investigador del centro del cáncer de Johns Hopkins Kimmel determinaron las moléculas altamente inestables del ARN en melanomas humanos, incluyendo un gen DUSP3 del objetivo de la novela miR-211.

Los investigadores de Johns Hopkins conectan un gen al incremento del melanoma y se extienden
Haber: iStock

Ranjan J. Perera, Ph.D., profesor adjunto de la oncología en la Facultad de Medicina de la Universidad John Hopkins, y el parte de los colegas que usando una transcripción especializada que ordenaba método llamó BRIC-seq, han determinado las transcripciones altamente estables e inestables del gen del mRNA que participan en incremento y la invasión de la célula durante la progresión del melanoma. Un gen, fosfatasa doble 3 (DUSP3) de la especificidad, regula caminos importantes de la transmisión de señales del melanoma.

Denunciaron su las conclusión 16 de junio en biología del ARN en línea.

La investigación anterior en otros laboratorios mostró que DUSP3 estuvo implicado en la progresión y la extensión de los diversos tipos del cáncer, incluyendo cánceres cervicales, de la próstata y de pecho. El nuevo estudio se cree para ser el primer parte de su implicación en melanoma y el primer parte de su regla por miR-211, los investigadores concluye.

El melanoma golpea 96.000 americanos estimados cada año, y los aviones derribados cerca de 7.200, haciéndole el cáncer de piel más fatal de los Estados Unidos, en la parte grande debido a su naturaleza agresiva y a su potencial extenderse por metástasis. Perera dice que más trabajo es necesario entender la biología anormal que es la base del incremento y de la extensión del cáncer, y ofrecer los nuevos objetivos potenciales para el tratamiento.

Generalmente, Perera dice, aproximación de los científicos sus estudios de la genética del melanoma observando para ver qué productos del gen y de la proteína son altos o hacia abajo-regulados en las células del tumor comparadas con los progenitores normales de la piel. En lugar, él dice, de la “la aproximación estabilidad del transcriptome” de sus personas observa cuánto tiempo las supuestas transcripciones del gen -; las instrucciones moleculares del ARN que “se leen” en la DNA antes de ser traducido en las proteínas -; sobreviva en células del tumor antes de que degraden.

Es importante entender durante la progresión del tumorigenesis o del tumor cómo estas transcripciones se comportan. Decidíamos tan observar totalmente un nuevo ángulo de la estabilidad y de la extinción del ARN del genomewide durante los primeros pasos en el revelado del melanoma.”

Ranjan J. Perera, Ph.D., profesor adjunto de la oncología, Facultad de Medicina de la Universidad John Hopkins

Otros investigadores, Perera observan, han tentativa perfilar estabilidad de la transcripción del genomewide usando las substancias químicas que ciegan toda la transcripción, y después la observación de la estabilidad de las transcripciones que existieron antes de cegar. Este método de la almádena, sin embargo, se considera tóxico, y puede alterar otros aspectos de una biología de célula de las maneras que pueden obscurecer la información de la estabilidad de la transcripción. Para dirigir esto, Perera y los colegas utilizaron BRIC-seq, un método que marca transcripciones con etiqueta con 5-Bromouridine, que se incorpora en RNAs nuevamente sintetizado y entonces puede immunocytochemically ser analizado en un cierto plazo sin perturbar el descanso del ambiente celular.

En una variedad de células del melanoma que falta normalmente miR-211, los investigadores introdujeron la expresión miR-211 y después utilizaron el método BRIC-seq para investigar dinámica de la estabilidad del transcriptome en la presencia/la ausencia de miR-211. Después combinaron estos resultados con los cambios en niveles totales de la expresión génica y utilizaron las herramientas de la predicción del programa de computadora para determinar los objetivos específicos del gen de miR-211, descubriendo el objetivo previamente no denunciado DUSP3.

Como parte de sus estudios en curso, Perera y sus colegas también están observando cómo miR-211 pudo afectar a otras transcripciones del gen del melanoma de las maneras que ascienden la metástasis y la resistencia del cáncer a ciertas drogas anticáncer.

Source:
Journal reference:

Joshi, P. et al. (2019) Transcriptome stability profiling using 5’-bromouridine IP chase (BRIC-seq) identifies novel and functional microRNA targets in human melanoma cells. RNA Biology. doi.org/10.1080/15476286.2019.1629769.

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