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Les avances en génétique de translation ont débloqué par les technologies Bio-Rad à présenter à ASHG 2019

Les scientifiques présenteront 24 résumés et trois entretiens, mettant en valeur la recherche pilotée en partie par l'ACP de Digitals de la gouttelette des laboratoires Bio-Rad (ddPCR) et les technologies (scATAC-Seq) ATAC-Seq unicellulaires, à la société de 2019 Américains de la rencontre annuelle de la génétique humaine (ASHG) à Houston, des 15-19 octobre. La recherche présentée prouve que les méthodes sensibles et fiables telles que Bio-Rads scATAC-Seq et le ddPCR fournissent des chercheurs une voie d'étudier le règlement épigénétique à l'écaille et d'améliorer le dépistage des biomarqueurs précédemment recensés.

Sont ci-après les points culminants de deux des exposés qui expliquent l'utilisation des technologies gouttelette gouttelette de Bio-Rad dans la recherche épigénétique de découverte et en recensant des biomarqueurs pour l'exposition de toxine.

Mappage epigenomic unicellulaire à l'écaille sans précédent utilisant la solution scATAC-Seq de Bio-Rad

Les avances techniques récentes ont facilité le mappage des epigenomes à la définition unicellulaire. Cependant, le débit et la qualité de ces méthodes ont limité leur capacité d'être écaillé pour de grandes expériences.

Pour traiter ce problème, Ronald Lebofsky, PhD, de Bio-Rad, et de Caleb Lareau d'Université de Harvard décrira une méthode basée sur microfluidics de gouttelette de haute qualité pour le profilage unicellulaire de l'accessibilité de chromatine. Dans leur recherche, ils ont utilisé une analyse unicellulaire de gouttelette pour la chromatine transposase-accessible utilisant l'ordonnancement (dscATAC-Seq) pour découvrir des facteurs de régulation en 46.653 cellules dans le cerveau adulte de souris.

Les chercheurs ont augmenté le débit de la plate-forme unicellulaire de coupe-circuit du ddSEQ de Bio-Rad en le combinant avec de la transposase à code à barres, activant plus que dix fois une augmentation en cellules qu'ils pourraient analyser. Ceci leur a permis de mesurer l'accessibilité de chromatine en travers de 136.463 posant et a stimulé les cellules moelle-dérivées par os humain et d'indiquer des changements de règlement épigénétique en travers de différents types de cellules et dans différentes conditions environnementales à la définition unicellulaire. Totalement, elles ont décrit l'un total d'au-dessus des profils unicellulaires d'une moitié-million, expliquant l'évolutivité et la souplesse de la plate-forme gouttelette gouttelette de ddSEQ.

« En accroissant les plates-formes techniques de Bio-Rad pour augmenter le débit du mappage epigenomic, nous pouvons explorer des variations entre les types de cellules de tissus à l'écaille sans précédent et définition, » a dit Lebofsky.

Cet entretien aura lieu jeudi 17 octobre 12 : 45- 14h au marquis Houston Meyerland ab, niveau 3. de Marriott.

Premier test rapide pour évaluer le tabac et la consommation continuelle d'alcool

Le fumage et l'alcoolisme sont les premières et aboutissantes quatrièmement causes du décès évitables aux États-Unis, respectivement. Jusqu'à présent, aucun test objectif n'a été procurable pour mesurer ces comportements ou pour confirmer l'utilisation patient-rapportée. Robert Philibert, DM, PhD, et Président de la diagnose comportementale, LLC avait l'habitude la technologie de ddPCR pour développer le premier test épigénétique pour mesurer le tabac continuel et la consommation d'alcool.

Philibert et son équipe avaient précédemment recensé des biomarqueurs de méthylation pour boire et fumer suivre des méthodes de la taille du génome d'analyse. À ASHG, ils présenteront les découvertes d'un test de ddPCR qui a été employé pour analyser le sang total ou la salive de 233 fumeurs et de 143 francs buveur. Les scientifiques ont prouvé que la technologie de ddPCR peut être employée pour mesurer la concentration d'un biomarqueur de méthylation qui marque avec la consommation de cigarettes quotidienne. De même, il a constaté que le demethylation à quatre autres sites a marqué avec la consommation lourde d'alcool d'une façon dépendante de la dose. Si validé, le test a pu être utile aux cliniciens et aux chercheurs en évaluant et en surveillant des patients dans un grand choix de programmes de bien-être.

Nous avons employé la technologie de ddPCR pour ce test parce que la précision et l'exactitude dans les réglages cliniques est primordiale. L'obtention de ce genre de mal de test peut être nuisible aux patients. La technologie d'ACP de Digitals de gouttelette est hautement évolutive. Et à la différence du qPCR, elle ne se fonde pas sur des gènes de référence, qui le rend plus fiable. »

Robert Philibert, DM, PhD, et Président de la diagnose comportementale

Philibert planification pour demander l'approbation des États-Unis Food and Drug Administration pour employer les deux tests dans la clinique.

Cette affiche (résumé 3298) sera présentée jeudi, le 18 octobre, 3 16h.

Jeudi 17 octobre, Bio-Rad hébergera deux événements d'éducation d'exposant enregistrant des applications à la recherche nouvelles pour scATAC-Seq :

7h15 - 8h45 du matin, salle de bal J, niveau 4 de Hilton Amériques Houston Lanier - Andrea Cosarizza, DM, PhD, de l'université de Modène, présentera un exposé intitulé les « modifications de surveillance au système immunitaire pendant la demande de règlement immunologique du cancer utilisant trier ultra-rapide de cellules et ARN-Seq unicellulaire. »

3h15 - 16h, théâtre 1 #345, parc des expositions de CoLab - Ethan A. Winkler, DM, PhD, de l'Université de Californie, San Francisco, et Pranav Patel, PhD, de Bio-Rad, présentera un exposé intitulé le « développement de la biopsie Basée sur ARNs d'endovasculaire pour des malformations artério-veineuses de cerveau. »

Pour plus de petits groupes au sujet de ces entretiens visitez l'emploi du temps de la réunion d'ASHG.

Pour des démonstrations du système de ddPCR de QX200 AutoDG, le ddSEQ, et d'autres instruments Bio-Rad, visitent la cabine #530. Pour apprendre plus au sujet de la technologie du ddPCR de Bio-Rad qui sera présentée à ASHG, visite bio-rad.com/digitalPCR.

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